NFS1与FXN共同保护弥漫性大B细胞淋巴瘤细胞免于铁死亡和DNA损伤

NFS1, together with FXN, protects cells from ferroptosis and DNA damage in diffuse large B-cell lymphoma.

作者信息Xue Shi, Yun Zhao, Hong-Yu Gao, Wei Yang, Jun Liao, Hui-Han Wang, Xiao-Tian Wang, Wei Yan
PMID41005206
发布时间2025-11
DOI10.1016/j.redox.2025.103878

实验完整度

包含临床样本分析、体外细胞功能实验、体内异种移植模型、机制验证(催化突变、铁死亡抑制/诱导剂)及蛋白质组学等多层次证据。

主要模型

DLBCL细胞系DB、SU-DHL-4、FARAGE、SU-DHL-8、U-2932 SCID-NOD小鼠异种移植瘤模型 77例DLBCL患者临床组织样本 TCGA-DLBCL和GEO数据集(GSE12453、GSE56315)

重点核对

NFS1敲低或过表达对细胞活力、LDH和脂质ROS的影响 铁死亡诱导剂(erastin、BSO、RSL3)和抑制剂(Fer-1、DFO)处理 NFS1催化残基突变(C381)对功能的影响 FXN敲低对NFS1介导的细胞保护作用的影响 NFS1或FXN敲低对DNA损伤标志物(p-CHK1、p-H2AX)和8-oxoG水平的影响

摘要

弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)是一种常见的血液系统恶性肿瘤。NFS1半胱氨酸脱硫酶作为铁硫簇(ISC)生物合成中的限速酶,已被报道与肿瘤进展相关。然而,NFS1在DLBCL中的作用仍不清楚。在此,我们展示了NFS1在DLBCL肿瘤组织中的上调。敲低NFS1降低了DLBCL细胞的活力并增强了LDH水平。动物实验进一步表明,下调NFS1在体内抑制肿瘤生长。NFS1敲低增加了细胞内的脂质活性氧(ROS)水平,且这种促进作用可被铁死亡抑制剂逆转,但不受其他类型细胞死亡抑制剂的影响。该结果表明NFS1缺失所损害的细胞活力与铁死亡相关。沉默NFS1加剧了铁死亡诱导剂引起的细胞活力抑制、乳酸脱氢酶(LDH)和脂质ROS水平的升高,而添加铁死亡抑制剂则减弱了这些趋势。此外,NFS1催化残基突变不影响其蛋白表达,但降低了细胞活力,而NFS1上调则促进了细胞活力,表明NFS1在DLBCL细胞中的保护作用与其催化活性有关。进一步结果显示,frataxin(FXN)作为NFS1的上游激活因子,在NFS1上调的细胞中降低了细胞活力。与NFS1一致,FXN沉默加剧了erastin诱导的细胞活力抑制和LDH水平升高。沉默NFS1或FXN抑制了铁离子储存相关蛋白的水平,但促进了转运相关蛋白的水平。此外,沉默NFS1或FXN对DNA聚合酶的蛋白表达有抑制作用,但对DNA损伤标记物的磷酸化有促进趋势。总之,我们证明了ISC相关蛋白NFS1和FXN保护DLBCL细胞免于铁死亡和DNA损伤,从而在DLBCL进展中发挥重要作用。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
NFS1及其上游激活因子FXN在弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)进展中的作用及机制尚不清楚,本研究旨在探讨NFS1和FXN对DLBCL细胞铁死亡和DNA损伤的影响。
核心机制
NFS1通过其催化活性抑制铁死亡,并促进DNA损伤修复,从而保护DLBCL细胞;FXN作为NFS1的上游激活因子,协同NFS1发挥作用,共同抑制铁死亡和DNA损伤。
主要证据
体外细胞实验表明NFS1或FXN敲低诱导铁死亡特征(脂质ROS升高、GSH降低、Fe2+升高)并增加DNA损伤标志物;体内异种移植模型显示NFS1敲低抑制肿瘤生长;NFS1催化突变体无法挽救细胞活力,FXN敲低减弱NFS1过表达的保护作用。
研究意义
本研究揭示了ISC相关蛋白NFS1和FXN在DLBCL中的双重保护作用,为DLBCL治疗提供了潜在的新靶点,尤其是与铁死亡诱导剂或DNA损伤应答抑制剂联合治疗。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

临床样本及数据库分析

评估NFS1和FXN在DLBCL患者中的表达水平及其与预后的关系。

利用TCGA、GEO数据库分析NFS1和FXN的mRNA水平;收集77例DLBCL临床样本进行IHC染色,并分析NFS1表达与临床病理特征的关系。

2

体外细胞功能实验

验证NFS1和FXN对DLBCL细胞活力、细胞死亡及铁死亡的影响。

通过siRNA敲低NFS1或FXN,使用CCK-8检测细胞活力,LDH检测细胞毒性,流式细胞术检测脂质ROS,并检测GSH、Fe2+水平及铁死亡相关蛋白表达。

3

体内异种移植实验

评估NFS1敲低对DLBCL肿瘤生长的影响。

将NFS1敲低的DB或SU-DHL-4细胞皮下注射至SCID-NOD小鼠,测量肿瘤体积和重量,并通过IHC检测Ki67和NFS1表达。

4

机制验证

阐明NFS1和FXN调控铁死亡和DNA损伤的分子机制。

使用NFS1催化突变体(C381)进行功能互补实验;检测铁代谢相关蛋白(FECH、TFRC、FTHL、FTHH)、DNA损伤标志物(p-CHK1、p-H2AX)和DNA聚合酶(POLA1、POLD1、POLE)的表达。

5

蛋白质组学分析

鉴定NFS1敲低后DLBCL细胞中差异表达蛋白,以探索下游机制。

对NFS1敲低和对照细胞进行label-free定量蛋白质组学分析,并进行PCA、GO和KEGG富集分析。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
RPMI-1640培养基Solarbio31800
胎牛血清Sijiqing11011-8611
Lipofectamine 3000转染试剂Invitrogen--
RIPA裂解液SolarbioR0010
BCA蛋白定量试剂盒SolarbioPC0020
SDS-PAGE凝胶SolarbioD1010
PVDF膜MilliporeIPVH00010
增强化学发光试剂SolarbioPE0010
NFS1抗体ABclonalA13385
FXN抗体ABclonalA1745
FECH抗体ABclonalA8418
TFRC抗体ABclonalA5865
FTHL抗体ABclonalA1768
FTHH抗体Zen-BioR382071
CHK1抗体AffinityAF6007
磷酸化CHK1抗体AffinityAF3008
H2AX抗体AffinityAF6187
磷酸化H2AX抗体AffinityAF3187
POLA1抗体Zen-BioP09884
POLD1抗体AffinityDF3997
POLE抗体GenetexGTX132100
GPX4抗体AffinityDF6701
SLC7A11抗体Zen-bioR382036
FSP1抗体Zen-bio342551
山羊抗兔IgG-HRPSolarbioSE134
CCK-8检测试剂盒KeygenKGA317
LDH检测试剂盒Nanjing JianchengA020
8-氧代-2'-脱氧鸟苷ELISA试剂盒Abcamab201734
甲磺酸去铁胺SigmaD9533
Ferrostatin-1SigmaSML0583
N-乙酰半胱氨酸SigmaA7250
ErastinSelleck ChemicalsS7242
Ferrostatin-1AladdinF129882
去铁胺MecklinD873692
ZVAD-FMKMecklinZ860402
坏死磺酰胺AladdinN302487
ErastinYuanyeS80804
丁硫氨酸亚砜胺YuanyeS51087
RAS选择性致死化合物3AladdinR302648
C11 BODIPY探针Maokang BioMX5211
谷胱甘肽检测试剂盒Nanjing JianchengA006-2-1
亚铁离子检测试剂盒SolarbioBC5415
TRIpure试剂BioTekeRP1001
BeyoRT II M-MLV逆转录酶BeyotimeD7160L
2×Taq PCR预混液SolarbioPC1150
SYBR Green荧光染料SolarbioSY1020
细胞周期检测试剂盒BeyotimeC1052
kFluor488-EdU染色增殖试剂盒KeyGenKGA330
流式细胞仪Agilent--
微孔板读数仪BIOTEK/BioTek--
Orbitrap Exploris 480质谱仪Thermo Fisher--
Nanospray Flex离子源Thermo Fisher--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞培养
细胞系来源和培养条件(培养基、血清浓度、温度、CO2浓度)
阅读提示:Methods 1.3 Cell culture and treatments
药物处理
铁死亡诱导剂(erastin, BSO, RSL3)和抑制剂(Fer-1, DFO)的浓度、处理时间
阅读提示:Methods 1.3 和 1.7;Figure legends 3 和 4
细胞活力检测
CCK-8检测的细胞密度、孵育时间、吸光度波长
阅读提示:Methods 1.5 CCK-8 assay
脂质ROS检测
C11 BODIPY染色浓度、染色时间、流式细胞仪设置
阅读提示:Methods 1.8 Lipid ROS measurement
体内异种移植实验
小鼠品系、周龄、性别、细胞注射数量、肿瘤测量时间点
阅读提示:Methods 1.12 Tumor xenograft models
DNA损伤检测
8-oxoG ELISA检测方法、S期富集方法、抗体(p-CHK1, p-H2AX)稀释度
阅读提示:Methods 1.7 和 Figure 7 图注