丁酸盐通过激活cAMP/PKA/CREB信号通路增强肠道菌群失调以抑制子宫内膜癌的进展

Butyrate enhances gut dysbiosis by activating the cAMP/PKA/CREB signaling pathway to inhibit the progression of endometrial carcinoma.

作者信息Muheng Tao, Tingting Wu, Xin Zhou, Fengjie Li, Yingfan Chen, Kaijian Ling, Zhiqing Liang
PMID40818981
发布时间2025-08-16
DOI10.1186/s12866-025-04190-2

实验完整度

包含体外细胞功能实验(CCK-8、EdU、划痕、Transwell)、RNA-seq、Western blot、体内FMT小鼠模型及结肠组织病理和ELISA检测,多个独立证据层级验证。

主要模型

人子宫内膜癌细胞系Ishikawa和AN3CA Balb/c裸鼠皮下移植瘤模型(patient-derived xenografts) EC患者粪便样本(30例)和健康志愿者粪便样本(10例)

重点核对

EC患者粪便上清液处理Ishikawa和AN3CA细胞时,NaB和NaAC的浓度(1 mM)及处理时间(24小时) FMT小鼠模型中,ABX(抗生素)预处理10天,每日灌胃200 μL EC患者粪便或加NaB(20 mg/kg体重)持续16天 AN3CA细胞RNA-seq分析中,EC_NaB组与EC组的差异基因数量(6338上调,5221下调) Western blot检测p-PKA、p-CREB、Bcl2、BAX等蛋白表达的变化

摘要

背景:肠道菌群可能影响肠外肿瘤的进展和预后。子宫内膜癌(EC)、肠道菌群和短链脂肪酸(SCFAs)之间的关系和机制仍不明确。本研究旨在确定肠道菌群和SCFAs的改变是否与EC相关。方法:我们分别使用16S核糖体RNA和液相色谱-质谱法评估了健康志愿者和EC患者的肠道菌群组成和SCFAs浓度。随后,我们通过细胞实验和全面的RNA测序研究了肠道菌群和SCFAs对细胞表型的影响及相关机制。结果:与健康志愿者相比,EC患者的肠道菌群表现出显著差异。在门水平上,EC患者中变形菌门的丰度升高,而厚壁菌门和拟杆菌门的丰度降低。此外,EC患者粪便中乙酸和丁酸的浓度显著低于健康个体。EC患者的粪便上清液促进了EC细胞的增殖、侵袭和迁移,并抑制了细胞凋亡。然而,添加丁酸钠(NaB)和乙酸钠后,这些效应被逆转。在进一步研究SCFAs参与调节EC的机制时,RNA-seq分析显示,与EC相比,EC上清液加NaB中cAMP/PKA/CREB信号通路富集。与未处理的小鼠相比,用EC患者粪便处理的小鼠肿瘤生长速度加快。然而,NaB灌胃逆转了这些效应。在EC粪便中添加NaB增加了EC小鼠结肠中Occludin和Claudin 1蛋白的表达,重塑了小鼠结肠的结构,降低了白细胞介素(IL)-1β和肿瘤坏死因子(TNF)-α的水平,增加了IL-10的水平,并在EC进展中发挥了保护作用。结论:EC患者的粪便显示出肠道菌群失调。此外,粪菌移植可促进肿瘤生长并破坏小鼠结肠的正常结构;然而,丁酸盐减轻了这些效应,突显了其作为一种可行的治疗选择。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
探究子宫内膜癌患者的肠道菌群和短链脂肪酸变化是否与EC相关,以及丁酸盐能否通过特定信号通路抑制EC进展。
核心机制
丁酸盐通过激活cAMP/PKA/CREB信号通路,抑制EC细胞增殖、迁移和侵袭,促进凋亡,并减轻肠道炎症。
主要证据
RNA-seq和RT-qPCR显示NaB处理上调PRKACA、CREB3L2、FOS表达,Western blot证实p-PKA和p-CREB水平升高;体内FMT小鼠实验显示NaB减少肿瘤体积、降低Ki-67阳性率、促进凋亡。
研究意义
作者提出丁酸盐补充可能代表一种有潜力的EC治疗策略,但需要进一步的临床验证。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

肠道菌群组成分析

比较EC患者与健康对照者肠道菌群组成差异

收集粪便样本,提取DNA,进行16S rRNA基因V4区扩增和测序,分析α多样性、β多样性和差异菌群。

2

粪便短链脂肪酸测定

检测EC患者与健康对照者粪便中SCFAs浓度差异

用LC-MS定量分析粪便中七种SCFAs浓度,并进行组间比较和相关分析。

3

细胞表型实验

验证EC粪便上清液及添加NaB或NaAC对EC细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭的影响

用Ishikawa和AN3CA细胞,分别用PBS、EC粪便上清液、上清液加NaB或NaAC处理,进行CCK-8、EdU、划痕和Transwell实验,并用Western blot检测凋亡相关蛋白。

4

RNA-seq分析

探究NaB抑制EC细胞恶性进程的信号通路

提取AN3CA细胞总RNA,进行RNA-seq,比较EC组、EC_NaB组和NC组的基因表达,KEGG富集分析。

5

体内FMT小鼠实验

验证EC粪便移植对肿瘤生长的影响及NaB的干预效果

建立AN3CA皮下移植瘤模型,随机分为4组,分别给予PBS、EC粪便、EC粪便+NaB灌胃,测量肿瘤体积和重量,进行H&E、IHC、TUNEL和Western blot检测。

6

结肠炎症与屏障功能评估

观察EC粪便灌胃引起的小鼠结肠炎症和屏障损伤,以及NaB的缓解作用

取小鼠结肠组织,进行H&E染色评估组织学损伤,IHC和Western blot检测紧密连接蛋白Occludin和Claudin1,ELISA检测炎症因子IL-1β、TNF-α和IL-10,FISH检测变形菌门分布。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
磁珠法土壤和粪便DNA提取试剂盒TianGenDP328
Phusion®高保真PCR预混液NEBM0532S
Qiagen凝胶回收试剂盒Qiagen28704
TruSeq® DNA无PCR试剂盒IlluminaFC-121-3001
Qubit® 2.0荧光计Thermo Fisher--
安捷伦生物分析仪2100Agilent--
TRIzol试剂Takara9109
RNA Nano 6000检测试剂盒Agilent5067-1511
SuperScript II逆转录酶Thermo Fisher18064-014
AMPure XP磁珠Beckman Coulter--
TruSeq PE簇生成试剂盒v3-cBot-HSIllumina--
丁酸钠Merk303410
乙酸钠MerkS8750
改良Eagle培养基(DMEM)----
胎牛血清----
青霉素和链霉素----
CCK-8检测试剂盒BiogroundBG0025
EdU检测试剂盒BeyotimeC0071S
DAPIBeyotimeC1006
基质胶Corning354234
Balb/c裸鼠Hunan SJA Laboratory Animal Co., Ltd.--
改良显色法鲎试剂内毒素检测试剂盒BeyotimeC0278S
组织固定液ServicebioG1101
苏木素-伊红染色液BeyotimeC0105M
柠檬酸抗原修复液BeyotimeP0083
Ki-67抗体AbclonalA20018
Occludin抗体CST#91131S
Claudin1抗体AbclonalA11530
二抗BosterSV0004
DAB显色剂ABclonalRK50015
苏木素BeyotimeC0107
磷酸酶抑制剂混合物和蛋白酶抑制剂BeyotimeP1045
IL-1β ELISA试剂盒ABclonalRK00006
TNF-α ELISA试剂盒ABclonalRK00027
IL-10 ELISA试剂盒ABclonalRK00016
逆转录试剂盒TakaraRR047A
TB Green预混液Ex Taq IITakaraRR820A
CFX96 Touch实时荧光定量PCR仪Bio-Rad--
RIPA裂解液BeyotimeP0013B
5× SDS上样缓冲液BeyotimeP0015L
SDS-PAGE试剂盒BeyotimeP0012A
PVDF膜MilliporeISEQ00010, IPVH00010
Bcl2抗体CST#15071
BAX抗体AbclonalA20227
α-微管蛋白抗体AbclonalA6830
β-肌动蛋白抗体AbclonalAC026
磷酸化CREB抗体CST#9198
CREB抗体CST#9197
磷酸化PKA抗体Affinity#AF7246
PKA抗体Affinity#AF7746
ECL底物ABclonalRM00021
ChemiDoc凝胶成像系统Bio-Rad--
TUNEL试剂盒BeyotimeC1088
蛋白酶KBeyotimeST533
FISH试剂盒ServicebioGF003
靶向变形菌门的FISH探针Servicebio--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
粪便16S rRNA测序
样本量:30例EC患者和10例健康志愿者;DNA提取试剂盒(TianGen DP328);PCR引物515F-806R;测序平台(Illumina NovaSeq)
阅读提示:方法部分“Stool 16 s rRNA gene sequencing and analysis”
SCFAs测定
粪便样本量(100 mg)和提取方法;LC-MS条件(色谱柱、流动相);SCFAs浓度计算方式
阅读提示:方法部分“Stool SCFAs measurements by LC–MS”
细胞表型实验
细胞系(Ishikawa, AN3CA);NaB和NaAC浓度(1 mM);处理时间(24 h EdU,48 h划痕和Transwell);重复次数(3个独立生物学重复,每个3个技术重复)
阅读提示:方法部分“Cell culture”、“CCK-8 assay”、“EdU staining”、“Wound healing assay”、“Transwell assay”
RNA-seq
AN3CA细胞处理组(EC、EC_NaB、NC);RNA提取试剂(TRIzol);测序平台(Illumina Novaseq, 150 bp PE)
阅读提示:方法部分“RNA-seq”
动物实验(FMT)
小鼠品系和年龄(5周龄雌性Balb/c裸鼠);分组(NC、PBS、EC、EC+NaB),每组6只;ABX预处理10天;灌胃剂量(200 μL粪便或粪便+NaB 20 mg/kg,持续16天)
阅读提示:方法部分“Mice”和“FMT”
结肠炎症评估
组织固定、包埋、切片方法;IHC抗体(Occludin, Claudin1)及稀释度;ELISA检测的炎症因子(IL-1β, TNF-α, IL-10)
阅读提示:方法部分“Hematoxylin&Eosin(H&E) staining”、“Immunohistochemistry(IHC)”、“Enzyme-linked immunosorbent assays (ELISA)”