大鼠CPB模型建立及神经功能评估
建立稳定的CPB模型,评估CPB后大鼠神经功能损伤程度,并验证IL-17A中和抗体和4-PBA的神经保护作用。
SD大鼠随机分为5组,建立CPB模型,术后24小时进行mNSS评分。
Cardiopulmonary Bypass-Induced IL-17A Aggravates Caspase-12-Dependent Neuronal Apoptosis Through the Act1-IRE1-JNK1 Pathway.
包含大鼠CPB模型和体外OGD/R细胞模型两个独立层级,并通过转录组、ELISA、Western blot、Co-IP、TUNEL及行为学进行功能与机制验证。
大鼠体外循环(CPB)模型 B104大鼠神经母细胞瘤细胞系OGD/R模型
CPB模型的建立:大鼠品系(SD)、体重、麻醉与插管方式、CPB持续时间(2小时)及流量(160-180 mL/kg/min) IL-17A中和抗体给药:剂量(100 μg/kg)、给药途径(静脉)、给药时间(CPB前30分钟) 4-PBA给药:剂量(100 mg/kg/天)、给药途径(腹腔注射)、持续时间(CPB前连续14天) OGD/R模型条件:2% O2、无糖DMEM、1小时缺氧和24小时复氧 IL-17A重组蛋白处理浓度:250 ng/mL
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立稳定的CPB模型,评估CPB后大鼠神经功能损伤程度,并验证IL-17A中和抗体和4-PBA的神经保护作用。
SD大鼠随机分为5组,建立CPB模型,术后24小时进行mNSS评分。
识别CPB后大鼠脑组织中的差异表达基因及相关信号通路。
取CPB组和Sham组大鼠脑组织进行转录组测序,筛选DEGs并进行KEGG富集分析。
确定CPB后IL-17A升高和神经元凋亡的易受损脑区。
分离皮层、海马、纹状体和丘脑,ELISA检测IL-17A水平,Western blot检测cleaved-caspase-3水平。
验证CPB后海马组织病理学损伤及IL-17A中和抗体的改善作用。
进行H&E和Nissl染色观察海马CA1区神经元形态。
确定CPB后海马凋亡途径及IL-17A对ERS途径的激活作用。
Western blot检测caspase-8、caspase-9、caspase-12、Bax、Bcl-2、GRP78、CHOP、p-IRE1、p-PERK、ATF6、p-JNK1等蛋白水平。
验证CPB后Hsp90与Act1/IRE1结合变化,探索分子机制。
使用免疫共沉淀技术检测海马组织中Hsp90-Act1和Hsp90-IRE1的相互作用。
在细胞水平验证IL-17A通过IRE1-JNK1通路加重OGD/R诱导的凋亡。
B104细胞进行OGD/R处理,并给予重组IL-17A和IRE1抑制剂GSK2850163,检测凋亡相关蛋白和TUNEL染色。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型 | 膜式氧合器 | XIJIAN MEDICAL | -- |
| 药物处理 | IL-17A中和单克隆抗体 | eBioscience | clone |
| 4-苯基丁酸 | MedChemExpress | HY-A0281 | |
| 体外细胞实验 | 重组IL-17A | Thermo Fisher Scientific | RP-8621 |
| IRE1α抑制剂GSK2850163 | MedChemExpress | HY-U00459 | |
| ELISA | IL-17A ELISA试剂盒 | MULTI SCIENCES | EK317/3-48 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime Biotechnology | P0013B |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | -- | |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Roche | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Biotechnology | P0011 | |
| SDS-PAGE凝胶 | Invitrogen | NP0322BOX | |
| 硝酸纤维素膜 | Invitrogen | IB33001 | |
| Tanon 5800多功能化学发光成像系统 | Tanon Science & Technology | -- | |
| 组织病理 | 正置光学显微镜 | Nikon | NIKON |
| 免疫共沉淀 | Protein A+G磁珠免疫沉淀试剂盒 | Beyotime Biotechnology | P2179M |
| TUNEL检测 | TUNEL检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | C1086 |
| 免疫荧光固定液 | Beyotime Biotechnology | P0098 | |
| 免疫染色通透液 | Beyotime Biotechnology | P0097 | |
| Western blot | 抗caspase-3抗体 | Proteintech | 19677-1-AP |
| 抗caspase-8抗体 | Proteintech | 13423-1-AP | |
| 抗caspase-9抗体 | Proteintech | 10380-1-AP | |
| 抗caspase-12抗体 | Abcam | ab62484 | |
| 抗Bax抗体 | Proteintech | 50599-2-Ig | |
| 抗Bcl-2抗体 | Proteintech | 26593-1-AP | |
| 抗IL-17RA抗体 | RayBiotech | 144-10052-50 | |
| 抗Na+/K+-ATPase抗体 | Proteintech | 14418-1-AP | |
| 抗GRP78抗体 | Proteintech | 11587-1-AP | |
| 抗CHOP抗体 | Proteintech | 15204-1-AP | |
| 抗IRE1抗体 | WANLEIBIO | WL02562 | |
| 抗磷酸化IRE1抗体 | WANLEIBIO | WL05299 | |
| 抗PERK抗体 | WANLEIBIO | WL03378 | |
| 抗磷酸化PERK抗体 | WANLEIBIO | WL05295 | |
| 抗ATF6抗体 | Proteintech | 24169-1-AP | |
| 抗JNK1抗体 | WANLEIBIO | WL05246 | |
| 抗磷酸化JNK1抗体 | WANLEIBIO | WL01813 | |
| 抗Hsp90抗体 | Proteintech | 13171-1-AP | |
| 抗Act1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-398161 | |
| 抗β-微管蛋白抗体 | Proteintech | 10094-1-AP |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 大鼠CPB模型建立 | 大鼠品系、体重、年龄、麻醉方式、机械通气参数、血管插管细节、CPB持续时间、血流量、温度控制、肝素剂量 阅读提示:见2.1 Animals和2.2 Model of CPB |
| 药物处理 | IL-17A中和抗体剂量(100 μg/kg)、给药途径(静脉)、给药时间(术前30分钟);4-PBA剂量(100 mg/kg/天)、给药途径(腹腔)、持续时间(14天) 阅读提示:见2.3 Drug Treatment |
| 转录组测序 | 样品数量(每组5只)、缺血窗口、DEG筛选阈值(|log2FC|>1, p.adj<0.05) 阅读提示:见2.4 Transcriptome Sequencing |
| 体外OGD/R模型 | 细胞系(B104)、OGD条件(2% O2、无糖DMEM、1小时)、复氧条件(21% O2、完全培养基、24小时)、药物浓度(rmIL-17A 250 ng/mL;GSK2850163) 阅读提示:见2.5 In Vitro OGD/R Model |
| Western blot | 蛋白提取、上样量、抗体稀释比例、孵育条件、内参选择 阅读提示:见2.7 Western Blotting |
| 免疫共沉淀 | 抗体使用、孵育时间、洗涤步骤 阅读提示:见2.9 Co-Immunoprecipitation |
| 行为学评估 | 评估时间点(术后24小时)、评分标准(mNSS) 阅读提示:见2.2 Model of CPB 和 Figure 1b |