细胞活力与细胞毒性评估
确定Tim AIII对胃癌细胞和正常胃黏膜细胞活力的影响
用不同浓度Tim AIII处理AGS、HGC27和GES-1细胞24和48小时,通过MTT法检测细胞活力,通过LDH释放实验和Hoechst/PI染色评估细胞毒性。
Timosaponin AIII inhibits gastric cancer by causing oxidative stress and blocking autophagic flux.
包含体外细胞实验(活性、增殖、迁移、氧化应激、自噬)和体内裸鼠移植瘤模型,并进行了正常细胞对照及机制验证。
AGS胃癌细胞系 HGC27胃癌细胞系 GES-1正常胃黏膜上皮细胞 BALB/c裸鼠皮下移植瘤模型
Tim AIII浓度(0-5 μM)对GES-1、AGS、HGC27细胞处理24和48小时的细胞活力影响 Tim AIII处理AGS和HGC27细胞后ROS和MDA水平变化 Tim AIII处理AGS和HGC27细胞后Keap1、Nrf2、HO-1、GCLM、NQO1、GPX4蛋白表达水平 Tim AIII处理AGS和HGC27细胞后P62和LC3B表达变化以及自噬流阻断验证 裸鼠皮下移植瘤模型中Tim AIII给药剂量(5 mg/kg和10 mg/kg)及给药频率
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定Tim AIII对胃癌细胞和正常胃黏膜细胞活力的影响
用不同浓度Tim AIII处理AGS、HGC27和GES-1细胞24和48小时,通过MTT法检测细胞活力,通过LDH释放实验和Hoechst/PI染色评估细胞毒性。
评估Tim AIII对胃癌细胞增殖和迁移能力的影响
通过克隆形成实验检测细胞增殖能力,通过细胞周期分析和划痕实验评估细胞周期分布和迁移能力。
检测Tim AIII是否诱导胃癌细胞氧化应激
使用DCF荧光探针检测细胞内ROS水平,JC-1探针检测线粒体膜电位,并测定MDA和GSH含量。
探究Tim AIII对Keap1-Nrf2通路的影响
通过Western blot检测Keap1、Nrf2、HO-1、GCLM、NQO1、GPX4的蛋白表达水平。
揭示Tim AIII作用的分子机制
对AGS细胞进行RNA测序和蛋白质组学分析,鉴定差异表达基因和蛋白,并富集相关通路。
验证Tim AIII对自噬的诱导作用
通过透射电子显微镜观察自噬体形成,通过Western blot检测自噬相关通路蛋白PI3K、AKT、p-AKT、AMPK、p-AMPK、mTOR、p-mTOR的变化。
验证Tim AIII是否阻断自噬流
通过Western blot检测P62和LC3B表达,通过免疫荧光检测P62定位,通过mCherry-GFP-LC3B腺病毒和Lyso-Tracker Red染色检测自噬流和溶酶体功能。
评估Tim AIII在体内对胃癌肿瘤生长的抑制作用
将AGS细胞皮下接种裸鼠,待肿瘤形成后分组给药,测量肿瘤体积和重量,并观察主要器官的毒性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Procell Life Science & Technology Co., Ltd. | -- |
| 药物处理 | 知母皂苷AIII | Topscience | T3395 |
| 细胞活力检测 | MTT | Aladdin | M158055 |
| 细胞毒性检测 | LDH细胞毒性检测试剂盒 | Beyotime | C0016 |
| 凋亡/坏死检测 | Hoechst 33342 | Beyotime | -- |
| 碘化丙啶 | Beyotime | P0137 | |
| 细胞增殖检测 | 结晶紫 | Aladdin | C110703 |
| 细胞周期分析 | 细胞周期与凋亡分析试剂盒 | Beyotime | C1052 |
| ROS检测 | DCF | Sigma-Aldrich | D6883 |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1线粒体膜电位检测试剂盒 | Yeasen Biotechnology | 40706ES60 |
| MDA检测 | MDA含量检测试剂盒 | Solarbio | BC0025 |
| GSH检测 | GSH含量检测试剂盒 | Solarbio | BC1175 |
| 蛋白提取 | Western及免疫沉淀细胞裂解液 | Beyotime | P0013 |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Elabscience | E-BC-K318-M |
| Western blot | 增强型ECL化学发光底物试剂盒 | Yeasen Biotechnology | 36222 |
| 免疫荧光 | 增强免疫透化缓冲液 | Beyotime | P0097 |
| QuickBlock™封闭液 | Beyotime | P0228 | |
| 含DAPI抗荧光淬灭封片剂 | Beyotime | P0131 | |
| 自噬流检测 | Ad-mCherry-GFP-LC3B腺病毒 | Beyotime | C3011 |
| 溶酶体染色 | 溶酶体红色荧光探针 | Beyotime | C1046 |
| Western blot | AKT抗体 | Cell Signaling Technology | -- |
| 磷酸化AKT抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| PI3K抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| AMPK抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 磷酸化AMPK抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| mTOR抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 磷酸化mTOR抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| P62抗体 | Abcam | -- | |
| LC3抗体 | Abcam | -- | |
| Nrf2抗体 | Abcam | -- | |
| Keap1抗体 | Abcam | -- | |
| HO-1抗体 | Abcam | -- | |
| GCLM抗体 | Abcam | -- | |
| NQO1抗体 | Abcam | -- | |
| GPX4抗体 | Abcam | -- | |
| GAPDH抗体 | Affinity | -- | |
| 山羊抗兔IgG二抗 | Affinity | S0001 | |
| 免疫荧光 | 山羊抗兔IgG二抗 | Abcam | ab150077 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Seville Biotechnology | -- |
| 透射电镜 | EMBed 812树脂 | -- | -- |
| 透射电子显微镜 | HITACHI | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞活力检测 | Tim AIII浓度(0-5 μM),处理时间(24和48小时),细胞系(GES-1、AGS、HGC27) 阅读提示:Methods中的Cell viability assay, Figure 1B-D |
| LDH释放实验 | Tim AIII浓度(0-3 μM),处理时间(48小时),细胞系(AGS、HGC27、GES-1) 阅读提示:Methods中的lactate dehydrogenase (LDH) release experiment, Figure 1G-H |
| 氧化应激检测 | Tim AIII浓度(0-3 μM),处理时间(48小时),DCF孵育时间(30分钟),JC-1孵育时间(20分钟) 阅读提示:Methods中的Intracellular ROS detection和Mitochondrial membrane potential detection, Figure 3 |
| MDA和GSH检测 | 细胞数量(至少5×10^6),Tim AIII浓度(0-3 μM),处理时间(48小时) 阅读提示:Methods中的Malondildehide (MDA) assay和Glutathione (GSH) assay, Figure 4A-D |
| Western blot | 蛋白上样量,一抗浓度,二抗浓度,Tim AIII浓度(0-3 μM),处理时间(48小时) 阅读提示:Methods中的Western blotting, Figures 4E-G, 7C-E, 8A-B |
| 自噬流检测 | Ad-mCherry-GFP-LC3B感染时间(24小时),Tim AIII浓度(0-3 μM),处理时间(48小时),Lyso-Tracker Red孵育时间(10分钟) 阅读提示:Methods中的Ad-mCherry-GFP-LC3B staining和Lysosome red fluorescence probe assay, Figure 9E-H |
| 体内实验 | AGS细胞接种数量(6×10^5),小鼠周龄(5周),性别(雄性),品系(BALB/c裸鼠),给药剂量(5 mg/kg和10 mg/kg),给药频率(每两天一次,共7次) 阅读提示:Methods中的Subcutaneous tumor formation in nude mice, Figure 10 |