验证肠道FXR激活与AAD的相关性
探讨肠道FXR激活是否与AAD发生相关。
检测AAD患者和小鼠血清UDCA、FGF19/15、MMP2/9水平,以及肠道FXR、FGF15、SHP mRNA表达。
Ursodeoxycholic acid alleviates aortic aneurysm and dissection through the intestinal farnesoid X receptor/ceramide synthase 2 axis.
研究包含患者样本、小鼠模型(BAPN/AngII诱导)、细胞实验(原代肠细胞、巨噬细胞等)、类器官、体内敲低和多种机制验证(ChIP-qPCR、双荧光素酶等)
AAD患者样本 BAPN/AngII诱导的AAD小鼠模型 ApoE−/−小鼠AngII诱导的AAD模型 原代肠细胞和BMDM
肠道FXR敲低(AAV-sh-FXR)在AngII诱导的ApoE−/−小鼠中降低AAD发生率 UDCA(50 mg/kg/d)在BAPN/AngII模型中降低AAD发生率和死亡率 C20 ceramide(10 mg/kg/d)补充逆转UDCA和FXR敲低的保护作用 GW4064(10 μM)处理原代肠细胞上调Cers2表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探讨肠道FXR激活是否与AAD发生相关。
检测AAD患者和小鼠血清UDCA、FGF19/15、MMP2/9水平,以及肠道FXR、FGF15、SHP mRNA表达。
评估抑制肠道FXR激活是否能预防AAD。
给予UDCA或对照,建立BAPN/AngII诱导的AAD模型,观察AAD发生率、死亡率、病理改变及MMP2/9表达。
确定肠道FXR是否通过直接调控Cers2促进C20神经酰胺合成。
采用脂质组学分析、qPCR、Western blot、ChIP-seq、ChIP-qPCR和双荧光素酶实验验证FXR与Cers2的调控关系。
验证UDCA的疗效是否通过降低C20神经酰胺介导。
在BAPN/AngII模型中,给予UDCA和C20神经酰胺,观察AAD发生率和病理变化。
验证抑制神经酰胺从头合成是否能减少AAD发生。
给予神经酰胺合成抑制剂Myriocin建立BAPN诱导AAD模型,观察发生率及血管病理。
进一步验证肠道FXR在AAD中的作用。
使用AAV特异性敲低肠道FXR,建立AngII诱导的ApoE−/−小鼠AAD模型,观察发生率及Cers2表达。
探究C20神经酰胺是否通过促进巨噬细胞炎症和MMP释放影响AAD。
用C20神经酰胺刺激BMDM、VSMC、EC、成纤维细胞,检测炎症因子和MMP2/9表达;与FXR激活的肠细胞共培养。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Dulbecco磷酸盐缓冲液 | -- | -- |
| 类器官培养 | 温和细胞解离试剂 | STEMCELL Technologies | -- |
| 基质胶 | Corning | -- | |
| IntestiCult类器官生长培养基 | STEMCELL Technologies | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 逆转录 | 逆转录试剂盒(RR037A) | Takala | RR037A |
| RT-qPCR | RT-qPCR试剂盒(R011) | Takala | R011 |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| 细胞因子 | 重组巨噬细胞集落刺激因子 | R&D Systems | 416-ML-010 |
| 药物处理 | GW4064 | MCE | HY-50108 |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂 | -- | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| ChIP-seq | Illumina ChIP-seq DNA样品制备试剂盒 | Illumina | -- |
| ChIP-qPCR | EZ ChIP试剂盒 | Millipore | -- |
| Maxima SYBR Green | Fermentas | -- | |
| 免疫组织化学 | 超敏SP免疫组化试剂盒 | MXB | KIT-9710 |
| 抗MMP2抗体 | Proteintech | 10373-2-AP | |
| 抗MMP9抗体 | Proteintech | 10375-2-AP | |
| 免疫荧光 | 抗F4/80抗体 | Cell signaling technology | 30325S |
| 抗COL1A1抗体 | Cell signaling technology | 72026S | |
| 抗FN1抗体 | Abcam | ab2413 | |
| 抗Cers2抗体 | Abcam | ab315452 | |
| 抗CD68抗体 | Abcam | ab303565 | |
| DAPI溶液 | Solarbio Life Science | C0065 | |
| 抗荧光淬灭封片剂 | Yeasen | 36307ES08 | |
| 组织染色 | EVG染色试剂盒(R20391-3) | Yuanye Bio-technology | R20391-3 |
| Masson三色染色液(G1340) | Solarbio Life Science | G1340 | |
| 细胞培养 | 胰蛋白酶 | Procell | PB180225 |
| 磷酸盐缓冲溶液 | Procell | PB180327 | |
| 血管平滑肌细胞完全培养基 | Procell | CM-M076 | |
| 成纤维细胞完全培养基 | Procell | CM-M077 | |
| 血管内皮细胞完全培养基 | BNCC | BNCC368023 | |
| 原代肠上皮细胞完全培养基 | Procell | CM-M045 | |
| C20神经酰胺 | Sigma-Aldrich | 860520P | |
| 药物处理 | 脂多糖 | MCE | HY-D1056 |
| 动物实验 | 血管紧张素II | MCE | HY-13948 |
| 熊去氧胆酸 | MCE | HY-13771A | |
| 多球壳菌素 | MCE | HY-N6798 | |
| 异氟烷 | Harvey-bio | -- | |
| 微型渗透泵(Model 2004) | Alzet | 2004 | |
| AAV-m-FXR | Hanbio Biotechnology | -- | |
| AAV-GFP | Hanbio Biotechnology | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 双荧光素酶实验 | pGL4.27荧光素酶质粒 | -- | -- |
| 海肾荧光素酶对照载体(pRL-luciferase) | Promega | -- | |
| 双荧光素酶检测系统 | Promega | -- | |
| 动物实验 | 氯磺丙脲 | Sigma-Aldrich | C1290 |
| 免疫共沉淀 | 抗RXR抗体 | Proteintech | 21218-1-AP |
| IgG | ABclonal | AC005 | |
| Western blot上样缓冲液 | Beyotime | P0015A | |
| Western blot | 抗FXR抗体 | Cell signaling technology | 72105S |
| 仪器设备 | 超高效液相色谱/高分辨质谱联用系统 | Waters Corp. | -- |
| Acquity BEH C18色谱柱(100 mm × 2.1 mm, 1.7 μm) | Waters Corp. | -- | |
| 类器官培养 | 振动切片机(Leica VT12000S) | Leica | VT12000S |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| AAD动物模型建立 | BAPN诱导模型:3周龄C57BL/6J小鼠,饮水含0.25% BAPN,持续4周;AngII剂量1000 ng/kg/min,输注3天(每天三次)。ApoE−/−模型:8周龄ApoE−/−小鼠,AngII 1000 ng/kg/min持续30天,通过微型渗透泵。 阅读提示:Methods: Mice |
| UDCA处理 | UDCA剂量50 mg/kg/d,灌胃给药。 阅读提示:Methods: Mice;Figure 2 legend |
| 肠道FXR敲低 | 4周龄ApoE−/−小鼠,AAV-m-FXR(RNA序列)通过肠道注射,3周后AngII诱导。验证敲低效率。 阅读提示:Methods: Mice;Figure 6 legend |
| C20神经酰胺补充 | C20 ceramide剂量10 mg/kg/d,腹腔注射。 阅读提示:Methods: Mice;Figure 4 legend |
| Myriocin处理 | Myriocin剂量0.5 mg/kg/d,腹腔注射28天。 阅读提示:Methods: Mice;Figure 5 legend |
| 细胞实验 | 原代肠细胞GW4064处理浓度10 μM(或10 μmmol,原文不一致),处理时间48小时;BMDM刺激C20 ceramide 100 ng/ml,1小时后LPS 100 ng/ml处理。 阅读提示:Methods: Cell culture, Bone Marrow-Derived Macrophages |