验证P2rx7在衰老中的表达变化
评估P2rx7在老龄小鼠和人类衰老MSCs中的表达是否改变。
通过qPCR、Western blot、免疫组化和公共单细胞及bulk RNA-seq数据分析老龄小鼠和人类衰老MSCs中P2rx7的表达。
The purinergic receptor P2rx7 mediated ATP sensing is required to prevent bone aging by directing mitochondrial fitness of MSCs.
包含P2rx7-/-小鼠模型和细胞模型等体外实验、体内移植和骨缺损模型等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
小鼠骨髓间充质干细胞(MSCs) P2rx7-/-小鼠 免疫缺陷小鼠皮下移植模型 小鼠下颌骨缺损模型
P2rx7-/-小鼠构建(CRISPR/Cas9敲除外显子2-4) 对照和P2rx7-/- MSCs用于体外分化及移植实验 BzATP浓度(0, 40, 100 nM)处理MSCs DCA处理(1 g/L饮水)于4月龄P2rx7-/-小鼠 ERK抑制剂U0126(10 μM)处理
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估P2rx7在老龄小鼠和人类衰老MSCs中的表达是否改变。
通过qPCR、Western blot、免疫组化和公共单细胞及bulk RNA-seq数据分析老龄小鼠和人类衰老MSCs中P2rx7的表达。
确定P2rx7缺失是否导致骨量减少和过早老化。
通过micro-CT、组织学染色(H&E、TRAP、Masson)和钙黄绿素双标记分析不同年龄段对照和P2rx7-/-小鼠的骨表型。
探究P2rx7在MSCs成骨分化和线粒体功能中的作用。
从对照和P2rx7-/-小鼠分离MSCs,进行CFU-F、茜素红染色、ALP染色、Western blot和qPCR检测成骨标志物;通过Seahorse、ATP含量、JC-1染色和TEM评估线粒体功能。
确定P2rx7是否通过Mfn1介导的线粒体融合来调节线粒体形态。
通过Western blot、免疫荧光、免疫金标记和Co-IP检测P2rx7对线粒体融合蛋白表达和定位的影响;使用Mfn1 siRNA验证其必要性。
探究P2rx7是否通过增强ERK信号敏感性来上调Mfn1表达。
通过RNA-seq和KEGG通路富集分析鉴定ERK通路;通过Western blot检测基础及bFGF刺激后的ERK磷酸化水平;使用ERK抑制剂U0126验证其对BzATP诱导的Mfn1表达和成骨分化的影响。
确定恢复线粒体适应性是否能挽救P2rx7缺失导致的骨缺陷,并评估BzATP激活P2rx7的体内作用。
用DCA处理P2rx7-/- MSCs和小鼠,评估成骨分化和骨表型;在小鼠下颌骨缺损模型中局部注射BzATP,评估骨愈合。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型构建 | 一步法小鼠基因分型试剂盒 | Vazyme Biotech Co., Ltd. | -- |
| 抗体 | 抗小鼠CD29抗体 | eBioscience | 2473836 |
| 抗小鼠CD31抗体 | eBioscience | 2373735 | |
| 抗小鼠CD44抗体 | eBioscience | 2255545 | |
| PE抗小鼠CD11b抗体 | BioLegend | 101207 | |
| APC抗小鼠CD90.2抗体 | BioLegend | 105311 | |
| 抗小鼠I型胶原α1抗体 | Abcam | ab255809 | |
| 动力相关蛋白1抗体 | CST | 8570 | |
| 细胞外调节蛋白激酶1/2抗体 | CST | 4370 | |
| 磷酸化细胞外调节蛋白激酶1/2抗体 | CST | 4695 | |
| 碱性磷酸酶抗体 | Invitrogen | PA5-106391 | |
| 骨形态发生蛋白2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-137087 | |
| CD90抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-53116 | |
| 细胞色素c抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-13156 | |
| 骨钙素抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-390877 | |
| P2rx7抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-514962 | |
| 线粒体分裂蛋白1抗体 | ProteinTech | 10956-1-AP | |
| p16抗体 | ProteinTech | 10883-1-AP | |
| p21抗体 | ProteinTech | 10355-1-AP | |
| P2rx7抗体 | ProteinTech | 28207-1-AP | |
| 线粒体融合蛋白1抗体 | ProteinTech | 13798-1-AP | |
| 线粒体融合蛋白2抗体 | ProteinTech | 12186-1-AP | |
| 视神经萎缩蛋白1抗体 | ProteinTech | 27733-1-AP | |
| Runt相关转录因子2抗体 | ProteinTech | 82636-2-RR | |
| 磷酸化动力相关蛋白1(Ser616)抗体 | Affinity | AF8470 | |
| 热休克蛋白60抗体 | Beyotime | AF0186 | |
| 小鼠IgG | Beyotime | A7028 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Servicebio | GB15001-100 | |
| 药物处理 | 苯甲酰苯甲酰-ATP (BzATP) | Sigma-Aldrich | B6396 |
| U0126 | MCE | HY-12031A | |
| 细胞培养 | 重组小鼠碱性成纤维细胞生长因子 (bFGF) | PeproTECH | 450-33 |
| 组织学染色 | 抗酒石酸酸性磷酸酶染色试剂盒 | Servicebio | -- |
| 改良Masson三色染色试剂盒 | Solarbio | -- | |
| 细胞培养 | α-最低必需培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Procell | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Cytiva | -- | |
| 10厘米培养皿 | Corning | -- | |
| CFU-F检测 | 1%结晶紫草酸铵溶液 | Solarbio | -- |
| 流式分析 | LSRFortessa流式细胞仪 | BD | -- |
| RNA-seq | NEBNext Ultra RNA文库制备试剂盒 | NEB | -- |
| HiSeq 2500测序平台 | Illumina | -- | |
| Illumina TruSeq SBS试剂盒v2(200循环) | Illumina | -- | |
| siRNA转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 质粒转染 | Lipo8000转染试剂 | Beyotime | -- |
| pCMV载体 | Sino Biological US Inc. | -- | |
| P2rx7质粒 | Sino Biological US Inc. | -- | |
| 成骨分化 | β-甘油磷酸 | Sigma | -- |
| L-抗坏血酸 | Solarbio | A8100 | |
| 地塞米松 | Sigma | -- | |
| ALP染色 | 碱性磷酸酶染色试剂盒 | Beyotime | -- |
| 茜素红染色 | 茜素红S | Sigma | -- |
| MSC移植 | 羟基磷灰石/磷酸三钙 | Zimmer Inc. | -- |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 488和594标记的二抗 | Zsgb-Bio | -- |
| 含DAPI的封片剂 | -- | -- | |
| 线粒体形态分析 | MitoTracker Red CMXRos线粒体染料 | MeilunBio | -- |
| Zeiss LSM 800共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| qPCR | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| cDNA合成试剂盒 | Takara Bio | -- | |
| SYBR Green Supermix | Bio-Rad | -- | |
| Western blotting | RIPA裂解和提取缓冲液 | ThermoFisher Scientific | -- |
| Halt™蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| 聚偏二氟乙烯膜 | Millipore | -- | |
| Thermo Scientific SuperSignal West Pico PLUS化学发光底物 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| 能量代谢分析 | Seahorse XFe96细胞培养微孔板 | Agilent | -- |
| XF细胞线粒体压力测试培养基 | Agilent | 102353-100 | |
| XF糖酵解压力测试培养基 | Agilent | 102353-100 | |
| Seahorse XFe96分析仪 | Agilent | -- | |
| 寡霉素 | Abcam | -- | |
| 葡萄糖 | Sigma | -- | |
| 2-脱氧-D-葡萄糖 | Sigma | -- | |
| 线粒体膜电位检测 | 线粒体膜电位(ΔΨM)检测试剂盒(JC-1) | Beyotime | -- |
| ATP检测 | ATP检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| ROS检测 | 2′,7′-二氯二氢荧光素二乙酸酯 (DCFH-DA) | Beyotime | S0033S |
| Victor® NivoTM多功能酶标仪 | PerkinElmer | -- | |
| 透射电镜 | Tecnai Spirit透射电子显微镜 | FEI | -- |
| ChIP | ChIP-IT® Express酶法磁性染色质免疫沉淀试剂盒 | Active Motif | -- |
| ChIP DNA纯化试剂盒 | Active Motif | -- | |
| Co-IP | 蛋白A/G琼脂糖珠 | Santa Cruz | -- |
| 动物实验 | 钙黄绿素 | Sigma | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型构建 | P2rx7-/-小鼠的构建方法:CRISPR/Cas9敲除P2rx7外显子2-4;基因分型引物及PCR条件见补充表1。 阅读提示:Material and Methods: Animals |
| MSC分离与培养 | MSCs来源:6-8周龄和18月龄小鼠;培养基:α-MEM含20% FBS和1%青霉素/链霉素;细胞在10 cm培养皿中培养,37°C、5% CO2;使用第2代MSCs。 阅读提示:Material and Methods: Isolation and culture of mouse MSCs |
| 成骨分化诱导 | 成骨诱导培养基:含10 mM β-甘油磷酸、50 μg/ml L-抗坏血酸、100 nM地塞米松;诱导时间:7天或14天;染色:ALP和茜素红染色。 阅读提示:Material and Methods: Osteogenic differentiation assay |
| 线粒体功能检测 | Seahorse试剂盒及培养基(XF Base Medium含5.5 mM葡萄糖、1 mM丙酮酸、2 mM谷氨酰胺);药物浓度:寡霉素1.5 μM、FCCP 1 μM、鱼藤酮/抗霉素A 0.5 μM;JC-1染色和ATP检测试剂盒。 阅读提示:Material and Methods: Cellular energy metabolism analysis |
| BzATP和U0126处理 | BzATP浓度:0、40、100 nM;U0126浓度:10 μM;处理时间:48小时(转染实验)或按实验设计。 阅读提示:Material and Methods: Small interfering RNAs infection and plasmid transfection; Results section 5 |
| 动物实验 | DCA给药:P2rx7-/-小鼠(4月龄)以1 g/L溶于饮水,处理2个月;下颌骨缺损模型:6-8周龄野生型小鼠,钻取3 mm缺损,BzATP局部注射(100 μl 50 nM,每两天一次,4周)。 阅读提示:Material and Methods: DCA treatment in P2rx7-/- mice; Mandibular bone defect model |