EVs提取与鉴定
从RKO细胞培养基中提取EVs并验证其符合实验要求。
使用Exosome Extraction and Purification Kit从RKO无外泌体血清培养基中提取EVs,通过TEM观察形态,NTA分析粒径,Western blotting检测标志物CD81、TSG101和Calnexin。
Extracellular vesicles isolated from SphK1 inhibitor SKI II-medium restrain the migration of colorectal cancer.
包含EVs提取鉴定、细胞功能验证(迁移)和分子表达检测,但缺乏动物模型和机制深入研究。
RKO细胞系 HT29细胞系
EVs提取使用Exosome Extraction and Purification Kit (UR52121),来自Umibio;需确认操作流程。 RKO-SKEVs提取时SKI II干预浓度5 µM,处理48小时;需核对细胞存活率。 GW4869浓度为20 µM,处理RKO细胞48小时。 RKOEVs和RKO-SKEVs干预浓度为100 µg/mL,处理48小时。 Transwell实验使用1% FBS培养基重悬细胞,200 µL细胞悬液加于上室,下室加含30% FBS的培养基500 µL,培养24小时。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从RKO细胞培养基中提取EVs并验证其符合实验要求。
使用Exosome Extraction and Purification Kit从RKO无外泌体血清培养基中提取EVs,通过TEM观察形态,NTA分析粒径,Western blotting检测标志物CD81、TSG101和Calnexin。
验证内源性EVs对RKO细胞E-钙黏蛋白、波形蛋白表达和迁移的影响。
使用EVs抑制剂GW4869处理RKO细胞,通过Western blotting检测E-钙黏蛋白和波形蛋白,Transwell实验检测迁移。
验证外源性RKOEVs对RKO细胞E-钙黏蛋白、波形蛋白表达和迁移的影响。
RKO细胞与PKH67标记的RKOEVs共培养,检测细胞摄取;再与RKOEVs共培养,检测E-钙黏蛋白、波形蛋白和迁移。
确定RKO细胞可耐受的最大SKI II浓度。
用不同浓度SKI II处理RKO细胞48小时,使用CCK-8检测细胞活性。
验证从SKI II培养基中提取的EVs对RKO细胞E-钙黏蛋白、波形蛋白表达和迁移的影响。
RKO细胞在含5 µM SKI II的10%无外泌体FBS培养基中培养48小时,收集培养基提取RKO-SKEVs。RKO细胞与RKO-SKEVs共培养,检测E-钙黏蛋白、波形蛋白和迁移。
验证RKOEVs对低转移潜力HT29细胞的影响及RKO-SKEVs的逆转作用。
HT29细胞与PKH67标记的RKOEVs共培养验证摄取;再分别用10µg/mL和100µg/mL RKOEVs及100µg/mL RKO-SKEVs处理,检测E-钙黏蛋白、波形蛋白和迁移。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | HT29 | Procell | CL-0118 |
| RKO | BOSTER | CX0083 | |
| 细胞培养与药物处理 | GW4869 | Umibio | 45089153 |
| 药物处理 | SKI II | Selleck | S717602 |
| 细胞活性检测 | 细胞计数试剂盒-8 | GLPBIO | GK10001 |
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | -- | -- |
| 细胞活性检测 | 酶标仪 | Synergy H1 | -- |
| EVs提取 | 外泌体提取纯化试剂盒 | Umibio | UR52121 |
| EVs鉴定 | 纳米粒子追踪分析 | Particle Metrix | -- |
| 透射电子显微镜 | HITACHI HT-7700 | -- | |
| EVs标记 | PKH67 | Umibio | UR52303 |
| EVs摄取 | 4',6-二脒基-2-苯基吲哚 | Beyotime | P0131 |
| Western blotting | 专用裂解液 | Umibio | UR33101 |
| 聚偏二氟乙烯膜 | Millipore | -- | |
| 增强化学发光凝胶成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| CD81抗体 | Proteintech | 66866-1-lg | |
| TSG101抗体 | Proteintech | 28283-1-AP | |
| E-钙黏蛋白抗体 | Proteintech | 60335-1-lg | |
| 波形蛋白抗体 | Proteintech | 10366-1-AP | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| 钙联蛋白抗体 | MedChemExpress | HY-P80578 | |
| 抗小鼠IgG(H+L)抗体 | BOSTER | BA1050 | |
| 抗兔IgG(H+L)抗体 | BOSTER | BA1054 | |
| Transwell assay | Transwell小室 | Corning | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与药物处理 | SKI II浓度5 µM及处理时间48小时;GW4869浓度20 µM及处理时间48小时;细胞系HT29 (CL-0118, Procell)和RKO (CX0083, BOSTER)的培养基条件。 阅读提示:参见Methods 'Cell culture and cell viability assays' 和 'RKOEVs-mediated RKO cell migration was partially reversed by RKO-SKEVs' |
| EVs提取与鉴定 | Exosome Extraction and Purification Kit (UR52121, Umibio)的操作步骤;EVs鉴定参数:TEM形态、NTA粒径(128.3±55.5 nm)、Western blotting标志物CD81和TSG101阳性、Calnexin阴性。 阅读提示:参见Methods 'Isolation, characterization and quantification of EVs' 和 Figure 1 |
| EVs干预实验 | RKOEVs和RKO-SKEVs的干预浓度(100 µg/mL)及处理时间(48小时);HT29细胞中RKOEVs浓度(10和100 µg/mL)及处理时间。 阅读提示:参见Figure 2C和图3B的图注及对应结果部分 |
| Western blotting检测 | 抗体稀释比例:CD81 1:1,000、TSG101 1:4,000、E-cadherin 1:4,000、Vimentin 1:2,000、GAPDH 1:4,000、Calnexin 1:1,000、二抗1:10,000;抗体品牌及货号(Proteintech等)。 阅读提示:参见Methods 'Western blotting analysis' |
| Transwell迁移实验 | 细胞悬液制备:1% FBS培养基;上室细胞悬液200 µL;下室含30% FBS的培养基500 µL;培养时间24小时;固定和染色条件(4%多聚甲醛20分钟,0.1%结晶紫8分钟)。 阅读提示:参见Methods 'Transwell assay' |
| 统计分析 | 统计方法:Student's t-test和ANOVA,LSD事后检验;软件SPSS 26.0和GraphPad Prism 8.0。 阅读提示:参见Methods 'Statistical analysis' |