建立TMJOA大鼠模型并评估病理变化
验证TMJOA中软骨组织是否出现损伤、线粒体功能障碍和细胞焦亡。
通过单侧前牙反颌手术建立TMJOA大鼠模型,8周后取关节软骨,进行HE染色观察组织形态,免疫组化检测NLRP3、GSDMD、PINK1表达,JC-1染色、ATP和MDA检测线粒体功能。
ZC3H13 Promotes NSUN4-Mediated Chondrocyte Mitochondrial Dysfunction and Pyroptosis in Temporomandibular Joint Osteoarthritis.
包含大鼠模型、细胞实验、RNA测序及分子机制验证等多个独立证据层级,并进行功能验证和机制验证。
TMJOA大鼠模型(UAC手术) 大鼠软骨细胞(CP-R092) IL-1β诱导的软骨细胞骨关节炎模型
TMJOA模型建立方法:单侧前牙反颌手术及假手术对照 ZC3H13敲低和过表达效率验证(qRT-PCR和Western blot) IL-1β处理浓度和时长(10 ng/ml,24小时) 细胞死亡抑制剂类型及浓度(Nec 20 µM、Fer-1 50 µM、Z-VAD-FMK 10 µM、3-MA 100 µM、VX765 10 µM) 样本量和重复数(动物n=5,细胞实验多为n=3)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证TMJOA中软骨组织是否出现损伤、线粒体功能障碍和细胞焦亡。
通过单侧前牙反颌手术建立TMJOA大鼠模型,8周后取关节软骨,进行HE染色观察组织形态,免疫组化检测NLRP3、GSDMD、PINK1表达,JC-1染色、ATP和MDA检测线粒体功能。
确定在TMJOA中表达变化的表观遗传修饰酶,并验证ZC3H13对软骨细胞线粒体功能障碍和焦亡的影响。
通过PCR array筛选差异表达酶,免疫组化验证ZC3H13表达;在软骨细胞中敲低ZC3H13,检测细胞活力、凋亡、线粒体膜电位、PINK1/NLRP3表达及炎性因子水平。
揭示ZC3H13调控的下游靶基因及其分子机制。
对ZC3H13敲低和对照软骨细胞进行RNA测序,筛选差异表达基因;挑选线粒体相关基因验证;确定NSUN4为靶基因,并通过RIP、MeRIP、双荧光素酶报告基因实验验证ZC3H13对NSUN4的m6A修饰。
验证NSUN4是否抑制软骨细胞线粒体功能障碍和焦亡。
在软骨细胞中敲低NSUN4,检测凋亡、线粒体膜电位、PINK1/NLRP3表达、炎性因子和LDH水平及软骨形成标志物表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | SPF(北京)生物技术有限公司 | -- | -- |
| 生化检测 | ATP检测试剂盒 | Shanghai Tongwei Biotechnology Co., Ltd | TW30551 |
| MDA检测试剂盒 | Beyotime | S0131 | |
| 免疫组织化学 | 抗PINK1抗体 | Proteintech | 23274-1-AP |
| 抗NLRP3抗体 | Finetest | FNab10120 | |
| 抗GSDMD抗体 | Proteintech | 20770-1-AP | |
| 抗NSUN4抗体 | Abclonal | A14983 | |
| 抗ZC3H13抗体 | Abcam | ab70802 | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗 | Wuhan Cloud clone Technology Co., Ltd | -- | |
| DAB显色剂 | -- | -- | |
| 显微镜观察 | 显微镜 | OLYMPUS | -- |
| 基因表达分析 | RT2 Profiler™ PCR芯片 | Qiagen | -- |
| RNA提取 | RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | -- |
| cDNA合成 | RT2第一链合成试剂盒 | Qiagen | 330401 |
| 细胞培养 | 软骨细胞完全培养基 | Procell | CM-R092 |
| 白细胞介素-1β | -- | -- | |
| 细胞转染 | ZC3H13小干扰RNA | Shanghai GenePharma | -- |
| NSUN4小干扰RNA | Shanghai GenePharma | -- | |
| 阴性对照小干扰RNA | Shanghai GenePharma | -- | |
| ZC3H13过表达质粒 | Shanghai GenePharma | -- | |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| cDNA合成 | RevertAid第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo | -- |
| qRT-PCR | ABI Q6 PCR仪 | Applied Biosystems Inc. | -- |
| SYBR Green预混液 | Roche | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Thermo | -- |
| 抗ZC3H13抗体 | Yaji | Ys-18461R | |
| 抗PINK1抗体 | Proteintech | 23274-1-AP | |
| 抗NLRP3抗体 | Abcam | Ab263899 | |
| 抗NSUN4抗体 | ABclonal | A14983 | |
| 抗Col2抗体 | Proteintech | 28459-1-AP | |
| 抗Sox9抗体 | Proteintech | 67439-1-Ig | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-lg | |
| HRP标记山羊抗兔二抗 | Abcam | ab6721 | |
| HRP标记山羊抗鼠二抗 | Abcam | ab205719 | |
| 增强化学发光试剂盒 | -- | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | -- | -- |
| 酶标仪(Infinite M1000) | TECAN | -- | |
| 流式细胞术 | Annexin V-FITC | -- | -- |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| FACSVerseTM流式细胞仪 | BD | -- | |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1检测试剂盒 | Beyotime | C2006 |
| 荧光显微镜(CKX53) | OLYMPUS | -- | |
| ELISA | IL-1β ELISA试剂盒 | MLBIO | ml028514 |
| IL-18 ELISA试剂盒 | MLBIO | ml028510 | |
| LDH检测 | LDH检测试剂盒 | Solarbio | BC0680 |
| RNA测序 | Illumina TruSeq RNA样本制备试剂盒 | Illumina | FC-122-1001 |
| Illumina HiSeq 2000测序平台 | Illumina | -- | |
| RIP实验 | EZMagna RIP RNA结合蛋白免疫沉淀试剂盒 | Millipore | -- |
| MeRIP实验 | Magna MeRIP™ m6A试剂盒 | Millipore | -- |
| 双荧光素酶报告基因实验 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| TMJOA大鼠模型 | 大鼠品系、性别、年龄、体重、分组、手术方式(UAC)、术后时间、麻醉方式 阅读提示:Material and Methods: TMJOA Rat Model Construction and Groups |
| 细胞培养和模型建立 | 细胞系(CP-R092)、培养基(CM-R092)、培养条件、IL-1β浓度和处理时间 阅读提示:Material and Methods: Cell Culture |
| 细胞转染 | siRNA和质粒序列、转染试剂(Lipofectamine 3000)、转染时间 阅读提示:Material and Methods: Cell Transfection |
| 细胞死亡抑制剂处理 | 抑制剂类型(Nec、Fer-1、Z-VAD-FMK、3-MA、VX765)及浓度、处理时间 阅读提示:Material and Methods: Cell Counting Kit-8 |
| 机制验证 | RNA测序平台、差异基因筛选标准、RIP和MeRIP实验条件、双荧光素酶报告基因载体及突变位点 阅读提示:Material and Methods: RNA Sequencing, RNA Immunoprecipitation Assay, M6A Methylated RNA Immunoprecipitation-PCR, Dual-luciferase Reporter Assay |