临床样本中NEAT1表达与卵巢功能相关性分析
验证DOR患者颗粒细胞中NEAT1表达变化及其与卵巢储备功能和ART结局的关系。
收集DOR和NOR患者颗粒细胞,RT-qPCR检测NEAT1表达,并分析其与临床指标的相关性。
LncRNA NEAT1 participates in diminished ovarian reserve by affecting granulosa cell apoptosis and estradiol synthesis via the miR-204-5p/ESR1 axis.
包含临床样本检测、细胞功能实验、双荧光素酶报告基因、Western blot等,功能验证和机制验证明确,但缺乏体内动物模型验证。
KGN人卵巢颗粒细胞系 DOR患者颗粒细胞样本 NOR患者颗粒细胞样本
KGN细胞系来源和培养条件 NEAT1过表达/敲低以及miR-204-5p mimics/inhibitor的转染条件 临床样本DOR诊断标准(AFC、AMH、FSH) 双荧光素酶报告基因验证NEAT1与miR-204-5p及miR-204-5p与ESR1的结合
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证DOR患者颗粒细胞中NEAT1表达变化及其与卵巢储备功能和ART结局的关系。
收集DOR和NOR患者颗粒细胞,RT-qPCR检测NEAT1表达,并分析其与临床指标的相关性。
确定NEAT1对颗粒细胞生物学功能的影响。
在KGN细胞中转染OE-NEAT1或si-NEAT1,通过CCK-8、EdU、流式细胞术检测细胞活力、增殖、凋亡和细胞周期。
确认NEAT1是否作为ceRNA海绵吸附miR-204-5p。
生物信息学预测,RT-qPCR验证miR-204-5p表达,双荧光素酶报告基因实验验证结合,及NEAT1过表达/敲低对miR-204-5p表达的影响。
确定miR-204-5p是否介导NEAT1的作用。
转染mimics/inhibitor-miR-204-5p,检测细胞功能;共转染OE-NEAT1和mimics-miR-204-5p,观察逆转效果。
确认ESR1是否为miR-204-5p的直接靶基因。
生物信息学预测,双荧光素酶报告基因实验验证结合,RT-qPCR和Western blot检测ESR1表达。
确定ESR1是否为miR-204-5p调控细胞功能和类固醇合成的关键下游因子。
共转染inhibitor-miR-204-5p和si-ESR1,检测细胞功能、类固醇合成相关基因和MAPK通路蛋白表达。
确认NEAT1通过miR-204-5p/ESR1轴影响MAPK通路和类固醇合成。
过表达NEAT1,或共转染mimics-miR-204-5p,检测下游蛋白表达和E2水平;并在临床样本中验证。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F-12培养基 | BasalMedia | -- |
| 胎牛血清 | BasalMedia | -- | |
| 青霉素-链霉素溶液 | Biosharp | -- | |
| 0.25%胰蛋白酶-EDTA | Biosharp | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| NEAT1过表达质粒 | Tsingke Biotech | -- | |
| NEAT1小干扰RNA | Tsingke Biotech | -- | |
| ESR1小干扰RNA | Tsingke Biotech | -- | |
| miR-204-5p模拟物 | Tsingke Biotech | -- | |
| miR-204-5p抑制剂 | Tsingke Biotech | -- | |
| 荧光原位杂交 | FISH试剂盒 | RiboBio | -- |
| FITC标记的NEAT1探针 | Sangon Biotech | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| 双荧光素酶报告 | pGL4载体 | Promega | -- |
| 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Promega | -- | |
| CCK-8 | CCK-8试剂盒 | Vazyme | -- |
| EdU | EdU细胞增殖试剂盒 | Beyotime | -- |
| Hoechst 33342 | -- | -- | |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | Vazyme | -- |
| 细胞周期 | 细胞周期与凋亡检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| RT-qPCR | 总RNA提取试剂RNA Isolator | Vazyme | -- |
| NanoDrop 2000分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| miRNA特异性茎环引物 | Sangon Biotech | -- | |
| HiScript II Q RT SuperMix逆转录试剂 | Vazyme | -- | |
| ChamQ SYBR qPCR Master Mix | Vazyme | -- | |
| 荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| Western blotting | RIPA裂解液 | Servicebio | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | CWBIO | -- | |
| PVDF膜 | Bio-Rad | -- | |
| 增强化学发光检测试剂盒 | Vazyme | -- | |
| ESR1抗体 | Proteintech | 20698-1-AP | |
| 磷酸化ERK1/2抗体 | Proteintech | 80031-1-RR | |
| ERK1/2抗体 | Proteintech | 11257-1-AP | |
| 磷酸化CREB1抗体 | Proteintech | 28792-1-AP | |
| CREB1抗体 | Proteintech | 12208-1-AP | |
| StAR抗体 | Proteintech | 12225-1-AP | |
| CYP19A1抗体 | Proteintech | 16554-1-AP | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| ELISA | 雄烯二酮 | -- | -- |
| 人雌二醇ELISA试剂盒 | Cusabio | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本采集 | DOR和NOR组各20例,DOR诊断标准(AFC<6,AMH<1.10 ng/mL,FSH 10-40 mIU/mL),排除标准 阅读提示:见Materials and methods中的Clinical sample collection |
| 细胞培养 | KGN细胞系来源(Procell),培养基成分,培养条件(37°C,5% CO2),传代密度(80-90%) 阅读提示:见Materials and methods中的Cell culture |
| 细胞转染 | 转染试剂(Lipofectamine 3000),转染量(2×10^5细胞/6孔板),转染时间(6小时后换液,继续48小时) 阅读提示:见Materials and methods中的Cell transfection |
| 双荧光素酶报告实验 | 质粒构建(NEAT1/ESR1 WT/MUT),共转染报告质粒和miR-204-5p mimics/inhibitor,检测时间(48小时) 阅读提示:见Materials and methods中的Dual-luciferase reporter assay |
| 流式凋亡和细胞周期 | 凋亡检测试剂盒(Annexin V-FITC/PI),细胞周期检测试剂盒(PI染色),染色时间(15分钟/30分钟),检测仪器(BD流式细胞仪) 阅读提示:见Materials and methods中的Flow cytometric assay |