临床样本表达分析
检测miR-34a-5p和FoxM1在骨肉瘤组织与癌旁正常组织中的表达差异
收集9对骨肉瘤及癌旁正常骨组织,提取RNA,通过qRT-PCR检测miR-34a-5p和FoxM1的表达,以U6和GAPDH为内参。
New mechanism of miR-34a-5p in regulating the biological behavior of osteosarcoma by targeting FoxM1.
包含体外细胞实验(CCK-8、划痕、Transwell、流式)及分子验证(双荧光素酶、qRT-PCR、Western blot),但缺乏体内动物模型验证。
人骨肉瘤细胞系MG-63 人骨肉瘤细胞系U2OS 人骨肉瘤组织及癌旁正常骨组织样本
骨肉瘤细胞系MG-63和U2OS购自武汉普诺赛生命科技有限公司 细胞培养使用DMEM完全培养基(含10%胎牛血清、1%青霉素-链霉素双抗),37°C、5% CO2 细胞转染使用Lipofectamine 6000,miR-34a-5p mimic、inhibitor及si-FoxM1购自GenePharma CCK-8实验每孔接种约5000个细胞,检测0、24、48、72小时OD450值 Transwell侵袭实验每孔50,000个细胞,孵育24小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测miR-34a-5p和FoxM1在骨肉瘤组织与癌旁正常组织中的表达差异
收集9对骨肉瘤及癌旁正常骨组织,提取RNA,通过qRT-PCR检测miR-34a-5p和FoxM1的表达,以U6和GAPDH为内参。
验证miR-34a-5p对骨肉瘤细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡的影响
在MG-63和U2OS细胞中分别转染miR-34a-5p mimic或inhibitor及其对照,通过CCK-8、划痕愈合、Transwell和流式细胞术检测细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡,并通过Western blot检测相关蛋白表达。
验证miR-34a-5p是否靶向FoxM1并负调控其表达
通过TargetScan、ENCORI和miRmap预测结合位点,构建FoxM1 3'UTR野生型和突变型荧光素酶报告载体,共转染miR-34a-5p mimic后检测荧光素酶活性;同时通过qRT-PCR和Western blot检测调控miR-34a-5p后FoxM1的mRNA和蛋白水平。
进一步证实miR-34a-5p通过靶向FoxM1发挥调控作用
设置对照组(si-NC+inhibitor NC)、FoxM1抑制组(si-FoxM1+inhibitor NC)和FoxM1+miR-34a-5p共抑制组(si-FoxM1+inhibitor),比较各组细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡的变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM完全培养基 | -- | -- |
| 细胞转染 | 脂质体转染试剂6000 | Invitrogen | -- |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂 | -- | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI双染试剂 | -- | -- |
| 流式分析 | Beckman CytoFLEX流式细胞仪 | Beckman | -- |
| 双荧光素酶实验 | 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | -- | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | -- | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| FoxM1抗体 | Proteintech | 13147-1-AP | |
| PCNA抗体 | Proteintech | 10205-2-AP | |
| MMP9抗体 | Proteintech | 10375-2-AP | |
| Caspase-3抗体 | Proteintech | 19677-1-AP | |
| β-actin抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗 | Proteintech | PR30012/PR30011 | |
| ECL化学发光液 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本 | 骨肉瘤及癌旁正常骨组织样本的收集数量(9对)、正常组织与肿瘤边界距离(至少2.5cm)、病理确认 阅读提示:Methods 中 'Osteosarcoma cell lines and tissue' 部分 |
| 细胞培养 | 细胞系(MG-63和U2OS)、培养基(DMEM完全培养基含10%FBS、1%青霉素-链霉素)、培养条件(37°C、5% CO2) 阅读提示:Methods 中 'Osteosarcoma cell lines and tissue' 部分 |
| 细胞转染 | 转染试剂(Lipofectamine 6000)、转染序列(miR-34a-5p mimic/inhibitor、si-FoxM1及相应对照)、转染时间(未明确说明) 阅读提示:Methods 中 'Cell transfection' 部分 |
| CCK-8实验 | 每孔接种细胞数(约5000)、检测时间点(0、24、48、72h)、CCK-8稀释比例(1:10)、加入体积(10μL)、孵育时间(2h) 阅读提示:Methods 中 'CCK-8 assay' 部分 |
| 划痕实验 | 细胞密度(约90%)、划痕工具(200μL枪头)、血清浓度(2%)、拍照时间(0h和24h) 阅读提示:Methods 中 'Wound healing assay' 部分 |
| Transwell侵袭实验 | 细胞密度(50,000个/孔)、上室体积(150μL)、下室培养基(含10%FBS)体积(700μL)、孵育时间(24h)、固定和染色条件(4%多聚甲醛10min,0.5%结晶紫30min) 阅读提示:Methods 中 'Transwell invasion assay' 部分 |
| 凋亡检测 | 转染后培养时间(48h)、染色试剂(Annexin V-FITC/PI)、流式细胞仪(Beckman CytoFLEX) 阅读提示:Methods 中 'Cell apoptosis assay' 部分 |
| 双荧光素酶实验 | 293T细胞接种密度(24孔板)、转染载体(FoxM1-WT/MUT)、共转染试剂(Lipofectamine 6000)、检测时间(转染后48h) 阅读提示:Methods 中 'Dual luciferase assay' 部分 |
| qRT-PCR | 内参基因(U6和GAPDH)、引物序列(见表1) 阅读提示:Methods 中 'Quantitative real-time PCR' 部分及表1 |
| Western blot | 蛋白上样量(40μg)、SDS-PAGE浓度(10%)、封闭液(5%脱脂牛奶)、一抗孵育条件(4°C 24h)、二抗孵育时间(室温1h) 阅读提示:Methods 中 'Western blotting' 部分 |