质谱分析MEE磷酸化的Cdc25C
确定M期超级迁移是否与调节域和催化域的磷酸化模式相关
将GST标记的催化失活Cdc25C与MEE孵育6小时,通过LC-MS/MS分析磷酸化位点。
Revisiting phosphoregulation of Cdc25C during M-phase induction.
包含体外磷酸化实验、质谱分析、功能活性检测、位点突变验证以及体内爪蟾卵母细胞成熟实验,具有多层级验证。
非洲爪蟾卵母细胞 非洲爪蟾卵提取物(MEE/IOE) HEK293T细胞 重组Cdc25C蛋白
Cdc25C的M期超级迁移需要其调控结构域内多个保守S/TP基序的磷酸化作为前提 四种主要的有丝分裂激酶(Cdk1、MAPK、Plx1、RSK2)的联合抑制或敲除不能阻断Cdc25C的M期超级迁移 Cdc25C的位点全面磷酸化是一个双相过程,包括浓度依赖的准备阶段和浓度无关的快速执行阶段 G2期状态的Cdc25C需经位点全面磷酸化才能被强效激活,而仅位点特异性磷酸化只能适度激活
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定M期超级迁移是否与调节域和催化域的磷酸化模式相关
将GST标记的催化失活Cdc25C与MEE孵育6小时,通过LC-MS/MS分析磷酸化位点。
测试保守S/TP基序的磷酸化是否为超级迁移产生的先决条件
对三个保守的TP基序(T48, T67, T138)和两个SP基序(S205, S285)进行磷酸化缺陷型或模拟型突变,观察对MEE诱导的超级迁移的影响。
确定Cdk1、MAPK、Plx1和RSK2是否足以或必需产生超级迁移
使用TNT系统产生激酶,比较单激酶或混合激酶与MEE的磷酸化效果;并利用特异性抑制剂组合或免疫耗竭检测对超级迁移的影响。
检验超级迁移的突然性是否源于位点全面磷酸化的固有机理
通过系列稀释MEE、脉冲-追踪实验检测磷酸化过程是否包含依赖浓度的准备阶段和独立浓度的执行阶段,以及是否需要底物持续结合。
比较位点特异性和位点全面磷酸化对Cdc25C磷酸酶激活能力的影响
将免疫沉淀的Cdc25C用IOE处理产生G2态,再用不同激酶或MEE磷酸化,并检测其对Cdk1 pY15去磷酸化的能力。
确认在爪蟾卵母细胞成熟过程中位点特异性和位点全面磷酸化是否表现出两阶段时序
在孕酮诱导的卵母细胞成熟中,通过时间过程检测Cdc25C迁移率变化、MAPK激活和Cdk1激活,并使用U0126抑制MAPK验证其作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫印迹 | 抗myc标签抗体 | Sigma-Aldrich | SAB4301136 |
| 免疫沉淀 | 抗myc标签抗体 | Cell Signaling Technology | 2276 |
| 免疫沉淀/免疫印迹 | 抗myc标签抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-40 |
| Cdc25C活性测定 | 抗磷酸化Cdk1 (Y15) 抗体 | Cell Signaling Technology | 9111 |
| 抗Cdk1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-54 | |
| 激酶免疫耗竭 | 抗Cdk1抗体 | AS ONE INTERNATIONAL | 69-003 |
| M期检测 | MPM-2抗体 | MilliporeSigma | 05-368 |
| 免疫印迹 | 抗Cdc25C抗体 | -- | -- |
| 抗磷酸化T48 Cdc25C抗体 | -- | -- | |
| 抗磷酸化ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 9106 | |
| 抗磷酸化p38 MAPK抗体 | Cell Signaling Technology | 9211 | |
| 免疫印迹/免疫沉淀 | 抗非洲爪蟾MAPK抗体 | -- | -- |
| 免疫印迹 | 抗ERK2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-1647 |
| 免疫沉淀 | 抗Plx1抗体 | -- | -- |
| 免疫印迹 | 抗Plx1抗体 | Invitrogen | 33-1700 |
| 免疫沉淀 | 抗RSK2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-9986 |
| 免疫印迹 | 抗RSK2抗体 | Cell Signaling Technology | 9355 |
| 激酶抑制 | Roscovitine | LC Laboratories | R1234 |
| Vx-11e | ChemieTeK | 896720 | |
| SL0101 | MedChemExpress | HY-15237 | |
| BI2536 | Selleck Chemicals | S1109 | |
| U0126 | Calibiochem | 109511-58-2 | |
| 对照 | U0124 | Calibiochem | 1140528-25-1 |
| 激酶抑制 | 星形孢菌素 | MilliporeSigma | S4400 |
| 蛋白纯化 | 谷胱甘肽树脂 | GenScript | L00206 |
| 还原型谷胱甘肽 | MilliporeSigma | 3541 | |
| 免疫沉淀 | 蛋白A/G琼脂糖 | ThermoFisher Scientific | 20241 |
| Cdk1纯化 | Q-琼脂糖凝胶快速流动 | Pharmacia | 17-0510-01 |
| 磷酸化反应 | 腺苷-5'-(3-硫代三磷酸) | Roche | 11162306001 |
| 蛋白磷酸酶处理 | λ蛋白磷酸酶 | New England Biolabs | P0753 |
| 磷酸酶抑制剂 | 冈田酸 | Calbiochem | 495604 |
| 微囊藻毒素-LR | Cayman Chemical Company | 10007188 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | C11995500BT |
| 胎牛血清 | Cellmax | SA301.02.V | |
| L-谷氨酰胺 | Solarbio Life Sciences | G8230 | |
| 青霉素/链霉素 | Solarbio Life Sciences | P1400 | |
| 细胞同步化 | 胸苷 | Solarbio Life Sciences | T8080 |
| 诺考达唑 | Sigma-Aldrich | M1404 | |
| 蛋白检测 | 丽春红S溶液 | Sigma-Aldrich | P7170 |
| 蛋白染色 | 考马斯亮蓝 | Sigma-Aldrich | 6104-59-2 |
| 质谱前消化 | 测序级修饰胰蛋白酶 | Promega Corporation | V5111 |
| Lys-C,质谱级 | Promega Corporation | VA1170 | |
| 体外转录翻译 | TnT快速偶联转录/翻译系统 | Promega Corporation | L2080 |
| RNA合成 | mMESSAGE mMACHINE高产加帽RNA转录试剂盒 | Promega Corporation | AM1340 |
| 定点突变 | 快速诱变系统 | TransGen Biotech | FM1-11 |
| 蛋白纯化 | pMAL蛋白融合与纯化系统 | New England Biolabs | E8000S |
| 蛋白表达 | Bac-to-Bac杆状病毒表达系统 | Invitrogen | 10359-016 |
| 蛋白纯化 | QIAexpress系统 | QIAGEN | 32149 |
| 免疫印迹 | 辣根过氧化物酶标记的山羊抗小鼠IgG | BIO-RAD | 1706516 |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔IgG | BIO-RAD | 1706515 | |
| 细菌培养 | BL21 (DE3) 感受态细胞 | ThermoFisher Scientific | EC0114 |
| 卵母细胞收集 | 人绒毛膜促性腺激素 | MilliporeSigma | 9002-61-3 |
| 蛋白表达诱导 | 溶菌酶 | MilliporeSigma | L6876 |
| 活性检测 | 小牛胸腺组蛋白H1 | MilliporeSigma | 382150 |
| 激酶活性检测 | 髓鞘碱性蛋白 | MilliporeSigma | 13-104 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外磷酸化反应 | MEE或激酶样品的活性浓度,底物Cdc25C的浓度,OA/MC的浓度(1μM),反应时间 阅读提示:Methods部分 'Phosphorylation of myc-tagged Cdc25C proteins and determination of their gel mobility shifts' |
| 质谱分析 | 磷酸化反应时间(3或6小时),蛋白上样量,质谱鉴定标准(HCD和ETD),数据过滤阈值 阅读提示:Methods部分 'Analysis of phosphorylation of GST-tagged Cdc25C^ proteins by mass spectrometry' |
| 活性测定 | G2态Cdc25C的制备条件(IOE处理1小时),Cdc25C免疫复合物的处理(磷酸化或λ-PP去磷酸化),pCdk1底物的制备和浓度 阅读提示:Methods部分 'Cdc25C activity assays' |
| 卵母细胞成熟实验 | 孕酮浓度(1 μM),U0126浓度(50 μM)及预处理时间(1小时),卵母细胞培养时间和收集时间点 阅读提示:Methods部分 'Microinjection and maturation of Xenopus oocytes' |