临床样本分析
探究AFP与CD47膜表达及巨噬细胞浸润的相关性
对30例HCC组织进行免疫组化和免疫荧光染色,评估AFP、CD47、CD68、CD206表达。
AFP shields hepatocellular carcinoma from macrophage phagocytosis by regulating HuR-mediated CD47 translocation in cellular membrane.
包含体外细胞实验、体内动物实验、临床组织样本分析及单细胞测序,并进行功能验证和机制验证。
HLE、Huh7、PLC、HepG2及Hepa1-6肝癌细胞系 THP-1来源的巨噬细胞 C57小鼠皮下移植瘤模型 30例HCC临床组织样本
HCC细胞系中AFP过表达或敲低对细胞膜CD47水平的影响 CD47单克隆抗体(MIAP410)处理对巨噬细胞吞噬及肿瘤生长的影响 MS-444处理对HuR细胞质定位及膜CD47水平的影响 动物实验中Hepa1-6细胞注射量(2.5×10^6)及MIAP410给药剂量(550μg/只/周,共两次)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究AFP与CD47膜表达及巨噬细胞浸润的相关性
对30例HCC组织进行免疫组化和免疫荧光染色,评估AFP、CD47、CD68、CD206表达。
验证AFP对巨噬细胞吞噬HCC细胞的影响
使用HLE和Huh7细胞,过表达或敲低AFP,与PMA诱导的THP-1巨噬细胞共培养,通过高内涵成像和流式细胞术检测吞噬。
阐明AFP调控CD47膜转位的分子机制
通过Co-IP验证AFP与HuR相互作用,RIP验证HuR结合CD47 3'UTR,Western blotting检测HuR亚细胞分布及膜CD47水平,使用MS-444抑制HuR转位。
验证AFP敲低联合CD47阻断对肿瘤生长的影响
将Hepa1-6细胞(NC或siAFP)皮下注射至C57小鼠,第10天开始给予CD47单抗(MIAP410)或对照。
分析AFP、CD47与巨噬细胞浸润的关联
使用TCGA LIHC数据评估免疫细胞浸润,差异基因表达及功能富集分析;使用GSE149614数据集进行单细胞RNA测序分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良伊格尔培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| PMA | MedChemExpress | -- | |
| Western blotting | 抗AFP抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-8399 |
| 抗HuR抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-5261 | |
| 抗CD47抗体 | Abcam | ab284132 | |
| 抗ATP1A1抗体 | Proteintech | 14418-1-AP | |
| 抗LaminB1抗体 | Proteintech | 129871-AP | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| 抗β-微管蛋白抗体 | Proteintech | 10094-1-AP | |
| 流式细胞术 | APC抗CD68抗体 | BioLegend | 333809 |
| APC抗CD14抗体 | BioLegend | 301807 | |
| APC抗CD47抗体 | BioLegend | 323123 | |
| 细胞处理 | MS-444 | MedChemExpress | HY-1000685 |
| 蛋白提取 | NE-PER核和细胞质提取试剂 | Thermo Scientific | 78833 |
| Mem-PER Plus试剂盒 | Thermo Scientific | 89842 | |
| 免疫沉淀 | 蛋白A/G Plus琼脂糖 | Santa Cruz Biotechnology | SC-2003 |
| RNA免疫沉淀 | PureBinding RNA免疫沉淀试剂盒 | GENESEED | P0101 |
| qPCR | PrimeScript RT试剂盒 | Takara | -- |
| SYBR premix Ex Taq试剂盒 | Takara | -- | |
| 细胞培养 | CFSE | -- | LOT |
| Transwell细胞培养小室 | Millipore | -- | |
| 高内涵成像 | Lionheart FX智能活细胞高内涵成像分析仪 | BioTek | -- |
| 流式细胞术 | Novo Cyte流式细胞仪 | ACEA Bioscience | -- |
| 动物实验 | CD47单克隆抗体 (MIAP410) | BioXCell | BE0283 |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 488驴抗小鼠IgG | Life Technologies | -- |
| Alexa Fluor 594驴抗小鼠IgG | Life Technologies | -- | |
| Alexa Fluor 594驴抗兔IgG | Life Technologies | -- | |
| 细胞转染 | AFP表达载体 | Genechem | -- |
| siAFP载体 | Genechem | -- | |
| siHuR载体 | Genechem | -- | |
| 动物实验 | C57小鼠 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞系和培养条件 | 细胞系来源(HLE, Huh7, PLC, HepG2, Hepa1-6, THP-1)、培养基(DMEM含10% FBS和1%青霉素-链霉素)、培养条件(37°C,5% CO2) 阅读提示:Materials and methods, Cell line and cell culture |
| AFP和CD47检测 | 抗体信息(anti-CD47, anti-AFP, anti-HuR等)及稀释比例(免疫荧光1:100等)、细胞膜蛋白提取方法、Western blotting和流式细胞术检测条件 阅读提示:Materials and methods, Reagents and antibodies, Immunofluorescence, Western blotting, Flow cytometry |
| 巨噬细胞吞噬实验 | THP-1分化条件(PMA 50 ng/ml,72小时)、共培养比例(1:2)、共培养时间(2小时或11小时动态观察)、CFSE染色浓度及细胞密度 阅读提示:Materials and methods, Macrophage phagocytosis assay, Figure legends for Fig. 2 |
| 机制验证 | Co-IP条件(抗体、裂解缓冲液、孵育时间)、RIP条件(试剂盒)、MS-444处理浓度(IC50约50μM)和时间(48小时) 阅读提示:Materials and methods, Co-immunoprecipitation, Immunoprecipitation of RNA complexes, Results section 3.4 |
| 体内动物实验 | 小鼠品系(C57雄性)、细胞注射数量(2.5×10^6)和体积(200μL)、MIAP410剂量(550μg/只/周,共两次)、肿瘤分离时间(注射后14天) 阅读提示:Materials and methods, Animal experiments, Figure legends for Fig. 7 |