BIN1缺陷增强ULK3依赖性自噬流并减少小鼠海马神经元的树突大小

BIN1 deficiency enhances ULK3-dependent autophagic flux and reduces dendritic size in mouse hippocampal neurons.

作者信息Yuxi Jin, Lin Zhao, Yanli Zhang, Tingzhen Chen, Huili Shi, Huaiqing Sun, Shixin Ding, Sijia Chen, Haifeng Cao, Guannan Zhang, Qian Li, Junying Gao, Ming Xiao, Chengyu Sheng
PMID39171951
期刊Autophagy
发布时间2025-01
DOI10.1080/15548627.2024.2393932

实验完整度

包含体外原代神经元、体内AAV敲低、MRI体积分析、Barnes迷宫行为学、自噬抑制剂和ULK3干预等至少两个独立证据层级,并包含功能验证和机制验证。

主要模型

原代培养小鼠海马神经元 小鼠海马CA1兴奋性神经元 小鼠海马CA1区域AAV介导的Bin1敲低模型 Neuro-2A细胞

重点核对

神经元培养天数:DIV5转导慢病毒,DIV11分析 AAV注射位点:CA1区域,坐标前后2.5mm,旁开1.0mm,深度1.9mm,注射体积0.5μl Barnes迷宫:训练5天,每天一次,测试在训练后3天进行 氯喹浓度:细胞实验40μM处理24小时;体内20mg/kg腹腔注射连续4天 SU6668浓度:细胞实验5μM每日一次连续6天;体内100mg/kg饮水给药5周

摘要

全基因组关联研究将BIN1(桥接整合因子1)基因位点附近的变异确定为迟发性阿尔茨海默病的主要风险因素。在本研究中,我们降低了小鼠海马神经元中BIN1的表达以研究其神经元功能。通过RNAi敲低Bin1减少了原代培养海马神经元以及成熟CA1兴奋性神经元的树突乔木大小。AAV介导的Bin1 RNAi敲低也在器官水平上导致注射部位周围的显著区域体积损失,如7特斯拉结构磁共振成像所示,并且在Barnes迷宫测试中损害了空间参考记忆。出乎意料的是,Bin1敲低导致巨自噬/自噬和MTOR(雷帕霉素激酶的机制靶标)复合物1(MTORC1)同时激活。用溶酶体抑制剂氯喹抑制自噬有效减轻了Bin1敲低诱导的树突回缩。随后的分子研究表明,ULK3(unc-51样激酶3)表达的增加(对MTOR不敏感)支持了BIN1缺陷中的自噬体形成。用SU6668(一种受体酪氨酸激酶抑制剂)降低ULK3活性,或通过AAV介导的RNAi降低神经元ULK3表达,显著减轻了Bin1敲低诱导的海马体积损失和空间记忆衰退。在阿尔茨海默病患者中,BIN1的主要神经元亚型特异性降低。我们的工作表明,这种减少可能是增加自噬水平的重要分子事件,可能通过减少树突结构促进脑萎缩和认知障碍,而ULK3是缓解这些不利影响的潜在干预靶点。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
BIN1缺陷是否通过影响自噬和树突结构导致海马萎缩及认知障碍?
核心机制
BIN1缺陷通过降低AKT活性促进TFEB核转位,上调自噬基因(包括ULK3)的表达,ULK3以MTOR非依赖方式启动自噬,增强的自噬流导致树突退化、海马区域体积损失和空间记忆损害。
主要证据
在培养海马神经元和体内CA1神经元中,Bin1敲低均导致树突大小减少和自噬流升高;氯喹抑制自噬可挽救树突回缩;SU6668或Ulk3敲低可减轻CA1体积损失和记忆损害。
研究意义
揭示BIN1减少可能是通过增加自噬水平促进脑萎缩和认知障碍的重要分子事件,ULK3是缓解这些有害效应的潜在干预靶点。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

体外Bin1敲低模型建立

确定在培养海马神经元中敲低Bin1的效率及对树突形态的影响。

使用慢病毒表达shRNA敲低小鼠Bin1,在DIV5转导,DIV11进行蛋白检测和形态学分析。

2

树突形态分析

评估Bin1敲低对树突乔木大小和复杂性的影响。

通过MAP2免疫荧光染色和神经元重建,进行Sholl分析和分支阶数分析。

3

自噬流检测

检测Bin1敲低是否导致自噬流改变。

使用BafA1、Leupeptin和氯喹处理,通过Western blot检测LC3-II、BECN1、SQSTM1水平,并使用GFP-LC3-RFP-LC3ΔG探针监测自噬通量。

4

体内CA1特异性敲低

验证Bin1敲低在体内对树突、体积和认知功能的影响。

通过立体定位注射AAV-shBin1至小鼠双侧海马CA1区域,2.5个月后进行MRI、高尔基染色和Barnes迷宫测试。

5

神经退行与体积分析

评估Bin1敲低是否导致CA1区域体积损失及神经元丢失。

使用7T MRI测量CA1体积,并使用NeuN染色计数神经元。

6

行为学测试

评估Bin1敲低对空间学习记忆的影响。

进行Barnes迷宫测试,包括连续5天训练和3天后的探针测试。

7

机制研究:ULK3与TFEB

探究Bin1敲低导致自噬激活的分子机制。

检测ULK3表达、TFEB核转位、AKT磷酸化,并使用siRNA敲低ULK1/ULK3或使用SU6668抑制ULK3活性。

8

体内靶向干预

验证ULK3在Bin1敲低效应中的关键作用。

通过AAV-shUlk3敲低ULK3或使用SU6668处理,评估对CA1体积和认知功能的恢复。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM培养基Thermo ScientificC11995500BT
Neurobasal-A培养基Thermo Scientific10888022
B-27添加剂Thermo Scientific17504044
L-谷氨酰胺Thermo Scientific35050061
青霉素-链霉素Thermo Scientific15140122
多聚D-赖氨酸MerckP6407
脱氧核糖核酸酶MerckD4513
木瓜蛋白酶Sangon Biotech9001-73-4
Falcon 40微米细胞过滤器Corning352340
Lipofectamine 3000转染试剂InvitrogenL3000075
亮肽素Beyotime BiotechnologySG2012
SC79Beyotime BiotechnologySF2730
巴弗洛霉素A1Sangon BiotechA601116
氯喹Beijing Vokai BiotechnologyA31639
氯喹MacklinC843545
SU6668MacklinN872395
SU6668Beyotime BiotechnologySF5301
SU6668Yuanye Bio-TechnologyS96560
RIPA裂解液BeyotimeP0013B
蛋白酶抑制剂混合物Beyotimest506
磷酸酶抑制剂混合物Roche04906837001
增强型BCA蛋白定量试剂盒BeyotimeP0010S
SDS-PAGE上样缓冲液5XBeyotimeP0015
Immobilon-PSQ PVDF膜MerckISEQ08100
Tris缓冲盐溶液Sangon BiotechA510025-0001
吐温20Sangon BiotechA600560
RNAiso Plus总RNA提取试剂Takara Bio9109
4× EZscript反转录预混液IIEZBioscienceEZB-RT2GQ
2× SYBR Green实时定量PCR预混液EZBioscienceA0001-R1
蔗糖----
磷酸盐缓冲液Sangon BiotechE607008
OCT包埋剂Sakura Finetek4583
Triton X-100Sangon BiotechA600198
牛血清白蛋白Sangon BiotechA600332
FD快速高尔基染色试剂盒FD NeuroTechnologiesPK401
抗MAP2抗体Sigma-AldrichM9942
抗RBFOX3/NeuN抗体abcamab177487
抗BIN1抗体Proteintech14647-1-AP
抗TFEB抗体Proteintech13372-1-AP
抗ACTB抗体ProteintechHRP-60008
抗LC3抗体Proteintech14600-1-AP
抗MTOR抗体Cell Signaling Technology2983
抗磷酸化RPS6KB1抗体Cell Signaling Technology9234
抗RPS6KB1抗体Cell Signaling Technology9202
抗MAP2抗体Proteintech17490-1-AP
抗ULK3抗体ImmunoWay BiotechnologyYT4820
抗ULK1抗体AffinityAb-DF7588
抗磷酸化ULK1 (Ser317)抗体AffinityAb-AF2301
抗磷酸化ULK1 (Ser757)抗体AffinityAb-AF4387
抗AKT抗体Proteintech10176-2-AP
抗磷酸化AKT (S473)抗体Proteintech66444-1-lg
抗H3抗体ABclonalA2348
HRP标记的山羊抗小鼠IgGProteintechSA00001-1
HRP标记的山羊抗兔IgGProteintechSA00001-2
CoraLite488标记的山羊抗小鼠IgGProteintechSA00013-1
CoraLite488标记的山羊抗兔IgGProteintechSA00013-2
罗丹明(TRITC)标记的山羊抗小鼠IgGProteintechSA00007-1
罗丹明(TRITC)标记的山羊抗兔IgGProteintechSA00007-2
Alexa Fluor Plus 405标记的山羊抗兔IgGInvitrogenA48254
基于DCFHDA的活性氧检测试剂盒BeyotimeS0033S
Neuro-2A细胞系----
HT22细胞系Wuhan Pricella BiotechnologyCL-0697
Hamilton 33G注射针----
7特斯拉BioSpin MRI GmbH光谱仪Bruker--
ImageJ----
DM4000 B荧光显微镜Leica Biosystems--
LSM 710激光共聚焦显微镜Zeiss--
CM1950冷冻切片机Leica Biosystems--
GraphPad Prism----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
原代神经元培养与敲低
神经元来源(新生小鼠P0或E16-18)、培养天数(DIV5转导)、慢病毒滴度、敲低效率(Western blot验证)
阅读提示:Methods: Culture of primary hippocampal neurons, Lentivirus transduction
树突形态分析
固定方法、MAP2染色条件、重建方法、Sholl分析参数(间隔10μm)
阅读提示:Methods: Immunofluorescence, Image analysis
自噬流检测
BafA1浓度(50nM)、处理时间(4小时)、氯喹浓度(40μM)及处理时间(4或24小时)、LC3-II检测方法
阅读提示:Methods: Reagents and antibodies, Results Figure 2 legend
体内AAV注射
小鼠品系和年龄(8周龄C57BL/6J)、AAV血清型(9)、注射坐标(前后2.5mm、旁开1.0mm、深度1.9mm)、注射体积(0.5μl)、注射后时间(8-10周)
阅读提示:Methods: Stereotaxic intracranial injection
行为学测试
Barnes迷宫训练天数(5天)、每天训练次数(1次)、探针测试在训练后3天进行、测试时间(300秒)
阅读提示:Methods: Behavioral tests, Barnes maze
体内给药
SU6668剂量(100mg/kg)、给药途径(饮水)、给药时长(5周)、氯喹剂量(20mg/kg)、给药途径(腹腔注射)、给药时长(4天)
阅读提示:Methods: Mouse maintenance, drug administration