筛选衰老相关AAD miRNA
鉴定与衰老和AAD相关的差异表达miRNA
招募430名参与者,分为年轻正常、老年正常、年轻患者和老年患者四组,进行血浆miRNA微阵列分析,筛选与衰老和AAD相关的候选miRNA,并在血浆和主动脉样本中验证miR-1204表达。
Aging aggravates aortic aneurysm and dissection via miR-1204-MYLK signaling axis in mice.
包含患者血浆和主动脉样本分析、两种小鼠AAD模型、体外VSMC功能实验、机制验证(靶基因、通路、回补实验)等多层级证据。
人血浆及主动脉样本 C57BL/6小鼠AngII诱导AAD模型 C57BL/6小鼠BAPN诱导AAD模型 原代人主动脉血管平滑肌细胞
患者分组年龄阈值50岁 miR-1204 agomir剂量10 nmol,尾静脉注射每3天一次共5次 AngII输注剂量1000 ng/kg/min,持续4周 BAPN给药剂量1 g/kg/d,饮水中给予4周 LNA anti-miR-1204给药剂量10 mg/kg,尾静脉注射一次
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定与衰老和AAD相关的差异表达miRNA
招募430名参与者,分为年轻正常、老年正常、年轻患者和老年患者四组,进行血浆miRNA微阵列分析,筛选与衰老和AAD相关的候选miRNA,并在血浆和主动脉样本中验证miR-1204表达。
验证miR-1204对AAD形成的影响
建立AngII和BAPN诱导的两种小鼠AAD模型,通过尾静脉注射miR-1204 agomir或LNA anti-miR-1204,检测AAD发生率、生存率、主动脉直径、组织病理和衰老标志物。
探究miR-1204对VSMC衰老、收缩表型及SASP的影响
在原代人主动脉VSMC中过表达miR-1204,检测SA-β-gal染色、SASP成分表达、收缩标志物蛋白水平。
确定miR-1204调控VSMC表型的直接靶基因
利用TargetScan预测miR-1204靶基因,结合转录组分析筛选候选基因,并通过荧光素酶报告基因实验验证MYLK为直接靶基因。
验证MYLK在miR-1204诱导VSMC损伤中的功能
在VSMC中过表达MYLK腺病毒,观察其对miR-1204诱导的衰老、SASP、收缩表型变化及AAD形成的影响。
验证MYLK过表达是否能挽救miR-1204加重的AAD形成
在AngII诱导的小鼠AAD模型中,同时给予miR-1204 agomir和MYLK过表达腺病毒,检测AAD发生率、主动脉直径、SA-β-gal染色和离体主动脉环收缩功能。
阐明衰老诱导miR-1204表达的上游机制
利用ChIP、ChIP-seq和荧光素酶报告实验验证p53与PVT1响应元件的结合,并检测miR-1204对p53活性的反馈调控。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| miRNA检测 | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596018 |
| miRNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | 74104 | |
| miRNeasy血清/血浆试剂盒 | Qiagen | 217184 | |
| Bulge-Loop miRNA qRT-PCR Starter Kit | Ribobio | C10211-2 | |
| 组织RNA提取 | 组织RNA纯化试剂盒Plus | ESscience | RN002plus |
| 原位杂交 | miRCURY LNA miRNA检测探针 | Qiagen | 339111 |
| 免疫荧光 | 抗MYH11抗体 | Abcam | ab53219 |
| 抗α-SMA抗体 | Cell Signaling Technology | 19245 | |
| 抗SM22抗体 | Abcam | ab14106 | |
| 抗MYLK抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-365352 | |
| 抗MCP-1抗体 | Abcam | ab214819 | |
| 抗CXCL1抗体 | Proteintech | 12335-1-AP | |
| 抗CD68抗体 | Abcam | ab283667 | |
| 抗IL-6抗体 | Abcam | ab233706 | |
| 抗小鼠IgG H&L (Alexa Fluor 488) | Cell Signaling Technology | 4408 | |
| 抗兔IgG H&L (Alexa Fluor 555) | Cell Signaling Technology | 4413 | |
| OCT包埋剂 | Sakura | 4583 | |
| 动物模型 | 血管紧张素II | Sigma Aldrich | A9525 |
| miR-1204 agomir | Ribobio | miR40005868 | |
| Cy5标记的miR-1204 agomir | Ribobio | miR4200521013014 | |
| LNA anti-miR-1204 | Qiagen | 339204 | |
| 超声检测 | Vevo 2100超声系统 | Visual Sonics | -- |
| SA-β-gal染色 | SA-β-gal染色试剂盒 | Cell Signaling Technology | 9860 |
| 细胞培养 | 原代人主动脉血管平滑肌细胞 | ScienCell | 6110 |
| 平滑肌细胞培养基 | ScienCell | 1101 | |
| HEK-293T细胞 | Procell | CL-0005 | |
| DMEM培养基 | Gibco | C11995500BT | |
| 细胞转染 | Lipofectamine RNAiMAX试剂 | Invitrogen | 13778030 |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Cell Signaling Technology | 9806 |
| 抗TGFβR2抗体 | Cell Signaling Technology | 79424 | |
| 抗SMAD2/3抗体 | Cell Signaling Technology | 8685 | |
| 抗p53抗体 | Cell Signaling Technology | 2524 | |
| 抗p16抗体 | Cell Signaling Technology | 92803 | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| 抗小鼠IgG HRP标记抗体 | Cell Signaling Technology | 7076 | |
| 抗兔IgG HRP标记抗体 | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| 免疫共沉淀 | 细胞裂解缓冲液 | Cell Signaling Technology | 9803S |
| Protein A/G磁珠 | Bimake | B23201 | |
| 抗MDM2抗体 | Abcam | ab226939 | |
| IgG抗体 | Cell Signaling Technology | 2729 | |
| EdU增殖实验 | Cell-Light EdU Apollo567体外试剂盒 | RiboBio | C10310-1 |
| 胶原凝胶收缩实验 | 细胞收缩检测试剂盒 | Cell Biolabs | CBA-021 |
| Transwell迁移实验 | Transwell小室 | Corning | 3422 |
| 流式细胞术 | 抗CD80 PE/Cyanine7抗体 | Biolegend | 305218 |
| ELISA | IL-6 ELISA试剂盒 | Abcam | ab178013 |
| MCP-1 ELISA试剂盒 | Abcam | ab179886 | |
| 荧光素酶报告基因实验 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | L3000015 |
| Dual-Glo荧光素酶检测试剂盒 | Promega | E2920 | |
| 染色质免疫沉淀 | SimpleChIP Plus酶法染色质免疫沉淀试剂盒 | Cell Signaling Technology | 9005 |
| 抗p53抗体 | Abcam | ab1101 | |
| ChIP-seq | Protein A/G Dynabeads | Life Technologies | 10015D |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者血浆miRNA筛选 | 患者分组标准(年龄阈值50岁)、样本量(每组例数)、miRNA筛选阈值(fold change ≥ 2, P ≤ 0.05) 阅读提示:Methods-Study populations,Results第一段,图1 |
| AngII诱导AAD模型 | 小鼠品系、月龄、性别;AngII输注剂量(1000 ng/kg/min);miR-1204 agomir剂量(10 nmol)和给药方案(尾静脉注射,每3天一次,共5次);对照组设置 阅读提示:Methods-Disease models,图2A |
| BAPN诱导AAD模型 | 小鼠周龄、品系;BAPN给药剂量(1 g/kg/d)和途径(饮水);LNA anti-miR-1204剂量(10 mg/kg)和给药时间 阅读提示:Methods-Disease models,图3A |
| 体外VSMC实验 | VSMC来源(原代人主动脉VSMC)、培养条件(SMCM+2%FBS);转染miR-1204 mimic浓度(50 nM);AngII处理浓度(1×10^-6 mol/L)和处理时间(24 h) 阅读提示:Methods-Cell culture,Cell transfection,图4 |
| MYLK靶基因验证 | 荧光素酶报告基因实验所用细胞系(HEK-293T)、载体构建(MYLK 3'UTR野生型/突变型/缺失型)、miR-1204 mimic浓度(100 nmol/L) 阅读提示:Methods-Luciferase assay,图5E |
| 体内回补实验 | MYLK腺病毒给药方式(尾静脉注射)和剂量(文中未明确说明)、与miR-1204 agomir联合给药的时间顺序 阅读提示:Methods-Disease models,图6H |