验证ZC3HAV1对cGAS-STING通路的影响
确定ZC3HAV1是否参与调控STING介导的信号通路。
使用野生型(WT)和Zc3hav1-/-小鼠腹腔巨噬细胞(PMs),感染HSV-1或刺激ISD、cGAMP、DMXAA,检测STING、TBK1、IRF3、P65、IκBα的磷酸化水平及下游基因表达;siRNA敲低ZC3HAV1后重复检测;在Zc3hav1-/- MEFs中回补ZAPS或ZAPL,检测IRF3磷酸化。
ZC3HAV1 facilitates STING activation and enhances inflammation.
包含体外细胞实验(巨噬细胞、MEF、293T)、基因敲除/敲低、过表达回补及动物模型(Zc3hav1-/-小鼠)验证,并覆盖机制验证(相互作用、寡聚化、棕榈酰化、转位)和功能验证(细胞因子、病毒滴度)。
小鼠腹腔巨噬细胞(PMs) Zc3hav1-/-小鼠 Zc3hav1-/-小鼠胚胎成纤维细胞(MEFs) HEK293T细胞
PMs来自6-10周龄C57BL/6J小鼠,3%巯基乙酸盐肉汤腹腔注射3天后收获 刺激物浓度:ISD 5 μg/mL,cGAMP 3 μg/mL,DMXAA 150 μg/mL,LPS 200 ng/mL,poly(I:C) 20 μg/mL,R848 10 μg/mL,ODN1826 2 μM,H-151 1 μM siRNA敲低:siZc3hav1-1和siZc3hav1-2混合物转染PMs,INTERFERin试剂 HSV-1感染:2×10^7 PFU/只小鼠,腹腔注射,12小时或48小时 DMXAA模型:23 mg/kg腹腔注射,4小时后取样
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定ZC3HAV1是否参与调控STING介导的信号通路。
使用野生型(WT)和Zc3hav1-/-小鼠腹腔巨噬细胞(PMs),感染HSV-1或刺激ISD、cGAMP、DMXAA,检测STING、TBK1、IRF3、P65、IκBα的磷酸化水平及下游基因表达;siRNA敲低ZC3HAV1后重复检测;在Zc3hav1-/- MEFs中回补ZAPS或ZAPL,检测IRF3磷酸化。
验证ZC3HAV1是否特异性作用于cGAS-STING通路而非TLR通路。
用LPS、poly(I:C)、ODN1826、Pam3CSK4、R848刺激WT和Zc3hav1-/- PMs,检测IRF3和IκBα磷酸化及细胞因子分泌;另外用VSV或poly(I:C)转染并敲低RIG-I检测Ifna4表达和IRF3磷酸化。
确定ZC3HAV1是否直接靶向STING并影响其寡聚化和TBK1招募。
免疫共沉淀检测内源及外源ZC3HAV1与STING结合;Native PAGE检测STING二聚化;检测TBK1与STING的结合;cGAMP结合实验。
探究ZC3HAV1影响STING激活的机制(棕榈酰化、寡聚化、ER-高尔基转运)。
检测Zc3hav1缺陷对STING棕榈酰化(点击化学)、寡聚化(Native PAGE)和亚细胞定位(免疫荧光共聚焦)的影响。
在动物水平验证ZC3HAV1在STING依赖性炎症中的作用。
WT和Zc3hav1-/-小鼠感染HSV-1或注射DMXAA,检测脾脏Ifna4表达、病毒滴度(空斑实验)、血清细胞因子和多个组织中的Il6 mRNA。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | Procell | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 胰蛋白酶-EDTA | -- | -- | |
| 佛波醇酯 | -- | -- | |
| 药物处理 | 2'3'-cGAMP | InvivoGen | tlrl-nacga23-1 |
| 5,6-二甲基黄酮-4-乙酸 | InvivoGen | tlrl-dmx | |
| ODN 1826 | InvivoGen | tlrl-1826 | |
| Pam3CSK4 | InvivoGen | tlrl-pms | |
| R848 | InvivoGen | tlrl-r848 | |
| 干扰素刺激DNA | InvivoGen | tlrl-isdn | |
| 脂多糖 | Sigma Aldrich | L4130 | |
| 聚肌胞苷酸 | Sigma Aldrich | P1530 | |
| H-151 | MedChemExpress | HY-112693 | |
| 生物素标记cGAMP | BioLog Life Science Institute | C 157-001 | |
| 免疫沉淀 | 蛋白A/G琼脂糖 | Santa Cruz Biotechnology | sc-2003 |
| 蛋白G Plus琼脂糖 | -- | -- | |
| 免疫印迹 | Pierce RIPA裂解液 | Thermo Fisher Scientific | 89901 |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma Aldrich | P8340 | |
| Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23228 | |
| pull-down | Pierce链霉亲和素琼脂糖 | Thermo Fisher Scientific | 20347 |
| ELISA | 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | Dakewe Biotech Company Ltd. | 1217203 |
| 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | Dakewe Biotech Company Ltd. | 1210602 | |
| cGAMP ELISA试剂盒 | Cayman | 501700 | |
| RT-PCR | RNA fast 200 RNA提取试剂盒 | Fastagen | 220011 |
| HiScript III RT SuperMix用于qPCR(+gDNA去除剂) | Vazyme | R323-01 | |
| ChamQ通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q711-03 | |
| Applied Biosystems StepOnePlus实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| RNA干扰 | INTERFERin转染试剂 | PolyPlus | 409-10 |
| 质粒转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668019 |
| 免疫荧光 | 免疫染色固定液 | Beyotime | P0098 |
| 4',6-二脒基-2-苯基吲哚 | Solarbio | C0065 | |
| 蔡司激光共聚焦显微镜LSM980 | Zeiss | -- | |
| 点击化学 | 15-叠氮基十五烷酸 | NEW RESEARCH BIOSCIENCES | Y-AJS-24014 |
| 硫酸铜 | MACKUN | C805782 | |
| TBTA配体 | MACKUN | T823729 | |
| 生物素-炔烃 | Aladdin | B171422 | |
| 三(2-羧乙基)膦 | MACKUN | T819166 | |
| 空斑实验 | 甲基纤维素 | -- | -- |
| 结晶紫 | -- | -- | |
| 抗体 | 抗β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig |
| 辣根过氧化物酶标记的AffiniPure山羊抗兔IgG (H+L) | Proteintech | SA00001-2 | |
| 抗小鼠IgG抗体 | ABclonal | AC011 | |
| 抗兔IgG抗体 | Cell Signaling Technology | 2729 | |
| 抗磷酸化IκBα (Ser32, 14D4) 抗体 | Cell Signaling Technology | 2859 | |
| 抗磷酸化P65 (Ser536, 93H1) 抗体 | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| 抗P65 (D14E12) 抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| 抗STING (D1V5L) 抗体 | Cell Signaling Technology | 50494 | |
| 抗磷酸化IRF3 (Ser396, 4D4G) 抗体 | Cell Signaling Technology | 4947 | |
| 抗IRF3 (D83B9) 抗体 | Cell Signaling Technology | 4302 | |
| 抗磷酸化TBK1 (Ser172, D52C2) 抗体 | Cell Signaling Technology | 5483S | |
| 抗TBK1抗体 | Cell Signaling Technology | 3013 | |
| 抗ZC3HAV1抗体 | Proteintech | 16820-1-AP | |
| 抗STING (19851-1-AP) 抗体 | Proteintech | 19851-1-AP | |
| 抗HA (HA-7) 抗体 | Sigma Aldrich | H3663 | |
| 抗Myc (9E10) 抗体 | Sigma Aldrich | M4439 | |
| 抗Flag (M2) 抗体 | Sigma Aldrich | F1804 | |
| 抗HA (CB051) 抗体 | Origene | TA180128-1 | |
| 抗Myc (9E10, TA1501211) 抗体 | Origene | TA1501211 | |
| 抗GM130抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-55591 | |
| 抗Calnexin抗体 | Abcam | ab22595 | |
| 山羊抗兔IgG Alexa Fluor 633 | Thermo Fisher Scientific | A-21071 | |
| 兔抗小鼠IgG Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher Scientific | A-11059 | |
| 质粒构建 | ZAPS表达质粒 | WZ Bioscience, Inc. | CH892071 |
| ZAPL表达质粒 | Changsha Youze Biotechnology Co., Ltd. | YZ-B021001 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 小鼠PMs制备:6-10周龄C57BL/6J小鼠腹腔注射3%巯基乙酸盐肉汤,3天后收获;MEFs来自13-14天胚胎;细胞培养条件:DMEM+10%胎牛血清,37°C、5% CO2 阅读提示:见Materials and methods: Mice, Cell culture |
| 刺激物处理 | 刺激物浓度:ISD 5 μg/mL;cGAMP 3 μg/mL;DMXAA 150 μg/mL;LPS 200 ng/mL;Pam3CSK4 1 μg/mL;poly(I:C) 20 μg/mL;R848 10 μg/mL;ODN 1826 2 μM;H-151 1 μM 阅读提示:见Materials and methods: Reagents and antibodies |
| RNA干扰 | siRNA序列:siZc3hav1-1和siZc3hav1-2混合物(浓度未明确);siRig-i混合物;对照siRNA序列;INTERFERin试剂转染 阅读提示:见Materials and methods: RNA interference assay |
| 蛋白检测 | 免疫印迹:RIPA裂解,SDS-PAGE,PVDF膜;免疫沉淀:IP缓冲液,蛋白G琼脂糖;Native PAGE:7%非变性凝胶,电泳条件45 mA预跑30分钟,25 mA 6小时 阅读提示:见Materials and methods: Immunoblot and IP analysis, Native PAGE analysis |
| 动物实验 | HSV-1感染:6-8周龄WT和Zc3hav1-/-小鼠,2×10^7 PFU腹腔注射,12小时或48小时;DMXAA模型:16-18g雄性小鼠,23 mg/kg腹腔注射,4小时;H-151处理:750 nM/只,1小时前 阅读提示:见Materials and methods: Viral infection in vivo, In vivo DMXAA model |