表达分析
分析NCAPH在膀胱癌组织和细胞系中的表达水平
利用GEPIA数据库分析TCGA和GTEx数据中NCAPH在膀胱癌组织和正常组织的表达;利用qRT-PCR检测30对膀胱癌和癌旁组织以及60例膀胱癌组织中的NCAPH mRNA水平;利用IHC检测14对石蜡包埋组织中NCAPH蛋白表达;检测膀胱癌细胞系UMUC3、5637、J82、SW780和正常尿路上皮细胞SV-HUC-1中NCAPH mRNA水平。
NCAPH promotes cell proliferation and inhibits cell apoptosis of bladder cancer cells through MEK/ERK signaling pathway.
包含临床组织样本表达分析、体外细胞功能实验(增殖、凋亡、周期)、信号通路机制验证(抑制剂)以及体内异种移植模型验证。
膀胱癌组织及配对癌旁组织 膀胱癌细胞系UMUC3、SW780 人输尿管上皮细胞SV-HUC-1 BALB/c裸鼠异种移植模型
NCAPH在膀胱癌组织中的表达升高(mRNA和蛋白水平) NCAPH过表达促进SW780细胞增殖和细胞周期进展,抑制凋亡 NCAPH敲低抑制UMUC3细胞增殖,诱导G2/M期阻滞和凋亡 NCAPH通过激活MEK/ERK信号通路发挥作用,U0126可阻断其促增殖效应 体内敲低NCAPH抑制异种移植瘤生长
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
分析NCAPH在膀胱癌组织和细胞系中的表达水平
利用GEPIA数据库分析TCGA和GTEx数据中NCAPH在膀胱癌组织和正常组织的表达;利用qRT-PCR检测30对膀胱癌和癌旁组织以及60例膀胱癌组织中的NCAPH mRNA水平;利用IHC检测14对石蜡包埋组织中NCAPH蛋白表达;检测膀胱癌细胞系UMUC3、5637、J82、SW780和正常尿路上皮细胞SV-HUC-1中NCAPH mRNA水平。
验证NCAPH对膀胱癌细胞增殖和凋亡的影响
在SW780细胞中过表达NCAPH,在UMUC3细胞中敲低NCAPH,通过MTT实验、BrdU实验、流式细胞术分析细胞周期和凋亡、TUNEL实验检测细胞增殖和凋亡变化。
探究NCAPH是否通过MEK/ERK信号通路发挥作用
通过Western blot检测NCAPH过表达或敲低后p-MEK1/2、MEK1/2、p-ERK1/2、ERK1/2的表达变化;使用MEK1/2抑制剂U0126处理NCAPH过表达的SW780细胞,检测信号通路激活和细胞增殖的变化。
验证敲低NCAPH对膀胱癌肿瘤生长的影响
将稳定转染shNCAPH或shNC的UMUC3细胞皮下注射到BALB/c裸鼠腋下,25天后处死小鼠,测量肿瘤体积,并通过qRT-PCR、Western blot检测NCAPH表达,通过IHC检测Ki67表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Ham's F-12 K培养基 | Procell | PM150910 |
| MEM培养基 | Procell | PM150410 | |
| RPMI-1640培养基 | Gibco | 31,800-014 | |
| Leibovitz's L-15培养基 | Procell | PM151010 | |
| 胎牛血清 | TIANHANG | 11,011 | |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11,668-019 |
| 动物实验筛选 | G418 | Invitrogen | 11,811,023 |
| 免疫组织化学 | 过氧化氢 | Sinopharm | 10,011,218 |
| 山羊血清 | Solarbio | SL038 | |
| 抗NCAPH抗体 | Proteintech | 11,515-1-AP | |
| 抗Ki67抗体 | ABclonal | A2094 | |
| HRP标记二抗 | Thermo Fisher Scientific | 31,460 | |
| DAB显色液 | Solarbio | DA1010 | |
| 组织取材与RNA提取 | 总RNA提取试剂盒 | Tiangen | DP419 |
| qRT-PCR | SYBR Green荧光染料 | Solarbio | SY1020 |
| Exicycler 96实时荧光定量PCR仪 | BIONEER | -- | |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Solarbio | R0010 |
| PMSF蛋白酶抑制剂 | Solarbio | P0100 | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Solarbio | PC0020 |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 |
| 抗CDK1抗体 | ABclonal | A11420 | |
| 抗Cyclin B1抗体 | ABclonal | A19037 | |
| 抗磷酸化MEK1/2抗体 | ABclonal | AP0209 | |
| 抗MEK1/2抗体 | Affinity | AF6385 | |
| 抗磷酸化ERK1/2抗体 | Affinity | AF8208 | |
| 抗ERK1/2抗体 | Affinity | AF6240 | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60,004-1 | |
| ECL化学发光检测试剂 | Solarbio | PE0010 | |
| 细胞增殖 | MTT | KeyGen Biotech | KGA311 |
| 二甲基亚砜 | Beyotime | ST038 | |
| BrdU | BD Pharmingen | -- | |
| 抗BrdU抗体 | ABclonal | A20304 | |
| 细胞周期 | PI和RNase A | Beyotime | C1052 |
| 细胞凋亡 | Annexin V-FITC和PI | Beyotime | C1062 |
| TUNEL原位细胞死亡检测试剂盒 | Roche | 12,156,792,910 | |
| Triton X-100 | Beyotime | ST795 | |
| 数据统计 | GraphPad Prism 8.0 | GraphPad Software Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源(Procell、iCell Bioscience)和培养基类型(Ham's F-12 K、MEM、RPMI-1640、Leibovitz's L-15),以及FBS浓度和培养条件(37°C, 5% CO2) 阅读提示:Materials and methods, Cell culture and transfection |
| 转染 | SW780细胞转染NCAPH过表达质粒,UMUC3细胞转染siNCAPH-2/3,使用Lipofectamine 2000,以及siRNA序列 阅读提示:Materials and methods, Cell culture and transfection |
| 增殖检测 | MTT实验细胞接种密度(5×10^3细胞/孔)和检测时间点(0、24、48、72小时);BrdU实验浓度(30μg/ml)和孵育时间(45分钟) 阅读提示:Materials and methods, Cell proliferation |
| 细胞周期与凋亡 | PI染色、Annexin V-FITC/PI双染方案,以及TUNEL实验步骤和孵育时间 阅读提示:Materials and methods, Cell cycle and apoptosis analysis; TdT-mediated dUTP nick end labeling (TUNEL) assay |
| 信号通路 | 使用MEK1/2抑制剂U0126(10μM)处理NCAPH过表达SW780细胞,Western blot检测p-MEK1/2、MEK1/2、p-ERK1/2、ERK1/2 阅读提示:Materials and methods, Western blotting; Results, Figure 5 |
| 体内实验 | BALB/c裸鼠(6周龄,雄性),每只注射5×10^6个稳定转染shNCAPH或shNC的UMUC3细胞,25天后测量肿瘤体积 阅读提示:Materials and methods, BC tumor xenograft model; Results, Figure 6 |