高脂饮食诱导肝脏炎症模型建立与表型分析
建立大黄鱼脂质过剩诱导的肝脏炎症模型,评估脂质积累、肝损伤和炎症表型。
对大黄鱼幼鱼进行10周高脂饮食(HFD,18%粗脂质)或对照饮食(CON,12%粗脂质)饲喂,分析体重、肝TG、血浆游离脂肪酸、ALT/AST、肝脏H&E染色、炎症因子表达、p65核定位及乙酰化水平。
Acetyl-CoA derived from hepatic mitochondrial fatty acid β-oxidation aggravates inflammation by enhancing p65 acetylation.
包含体内高脂饮食模型、体外鱼原代肝细胞与AML12细胞模型,结合乙酰化组学、LC-MS、Western blot、EMSA及双荧光素酶等,明确功能与机制验证。
大黄鱼幼鱼(高脂饮食诱导肝脏炎症模型) 大黄鱼原代肝细胞 AML12小鼠肝细胞 HEK293T细胞
高脂饮食(HFD)含18%粗脂质,对照饮食含12%粗脂质,饲喂10周 棕榈酸(PA)浓度:鱼肝细胞使用100 μM处理12小时;AML12细胞使用500 μM处理24小时 抑制剂使用:etomoxir(CPT1α抑制)、SB-204990(ACLY抑制)、MK-2206(Akt抑制)、c646(CBP抑制)、MB-3(GCN5抑制)、resveratrol(SIRT1激活)、AICAR(AMPK激活) 关键位点:p65 Lys63和Lys147突变增强其转录活性和DNA结合能力;ACLY Ser455磷酸化、Akt Ser473磷酸化、AMPK Thr172磷酸化 检测指标:肝TG、血浆游离脂肪酸、ALT/AST、KAT活性、NAD+/NADH比值、乙酰辅酶A含量、p65乙酰化、组蛋白H3乙酰化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立大黄鱼脂质过剩诱导的肝脏炎症模型,评估脂质积累、肝损伤和炎症表型。
对大黄鱼幼鱼进行10周高脂饮食(HFD,18%粗脂质)或对照饮食(CON,12%粗脂质)饲喂,分析体重、肝TG、血浆游离脂肪酸、ALT/AST、肝脏H&E染色、炎症因子表达、p65核定位及乙酰化水平。
检测高脂饮食对肝脏酰基辅酶A水平及乙酰化修饰图谱的影响,探究乙酰辅酶A与炎症的关联。
使用LC-MS检测肝组织酰基辅酶A水平;通过LC-MS/MS进行乙酰化组学分析,鉴定和定量乙酰化蛋白、肽段和位点,并进行GO和KEGG通路富集分析。
验证脂质过剩条件下线粒体脂肪酸β-氧化是否为p65乙酰化提供乙酰辅酶A并促进炎症。
使用棕榈酸(PA)处理大黄鱼原代肝细胞,检测炎症因子表达、p65乙酰化、脂肪酸氧化相关基因和蛋白;使用etomoxir抑制CPT1α,观察对PA诱导的p65乙酰化和炎症的影响;使用乙酸钠处理评估单纯乙酰辅酶A升高的作用。
探究ACLY是否介导乙酰辅酶A从线粒体到细胞核的转运,并参与PA诱导的p65乙酰化和炎症。
检测HFD和PA处理下ACLY Ser455磷酸化水平;使用ACLY抑制剂SB-204990预处理鱼肝细胞,观察对乙酰辅酶A含量、p65乙酰化和炎症因子表达的影响;使用Akt抑制剂MK-2206验证Akt对ACLY的调控。
确定在脂质过剩条件下参与p65乙酰化调控的关键KAT和KDAC。
在鱼肝细胞中检测PA处理后KAT和KDAC基因表达变化;在HEK293T细胞中通过双荧光素酶、免疫共沉淀和乙酰化检测验证CBP、PCAF、GCN5和SIRT1对p65的作用;使用CBP抑制剂c646和SIRT1激活剂resveratrol处理鱼肝细胞验证功能。
评估鱼类中发现的脂肪酸氧化-ACLY-p65乙酰化轴在哺乳动物细胞中的保守性。
使用500 μM PA处理AML12细胞24小时建立脂质过剩炎症模型,检测乙酰辅酶A含量、p65乙酰化、炎症因子表达、脂肪酸氧化基因、ACLY磷酸化;使用etomoxir、SB-204990、MB-3和KDAC抑制剂处理验证通路。
使用不诱导炎症的辛酸处理,验证脂肪酸氧化是否提供乙酰辅酶A用于核蛋白(组蛋白H3)乙酰化。
使用辛酸处理鱼肝细胞,检测脂肪酸氧化基因表达、MCAD蛋白、组蛋白H3乙酰化、ACLY磷酸化;使用SB-204990、MK-2206、AICAR和resveratrol处理,探究Akt/ACLY和AMPK/SIRT1通路在H3乙酰化中的作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白检测 | 抗p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 |
| 抗Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| 抗Akt(磷酸化Ser473)抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| 抗ACLY(磷酸化Ser455)抗体 | Cell Signaling Technology | 4331 | |
| 抗AMPKα抗体 | Cell Signaling Technology | 2532 | |
| 抗AMPKα(磷酸化Thr172)抗体 | Cell Signaling Technology | 2531 | |
| 乙酰化赖氨酸抗体 | Cell Signaling Technology | 9441 | |
| 抗SIRT1抗体 | Cell Signaling Technology | 9475 | |
| 抗DYKDDDDK标签抗体 | Cell Signaling Technology | 14793 | |
| 抗HA标签抗体 | Cell Signaling Technology | 3724 | |
| 抗组蛋白H3抗体 | Abcam | ab1791 | |
| 抗ACLY抗体 | Abcam | ab40793 | |
| 抗LCAD抗体 | Abcam | ab196655 | |
| 抗MCAD抗体 | Abcam | ab92461 | |
| 抗CBP抗体 | Wan Lei Bio | WL02842 | |
| 抗PPARα抗体 | Absin | abs117362 | |
| 抗GAPDH抗体 | Golden Bridge Biotechnology | TA-08 | |
| 抗IL-1β抗体 | This paper | -- | |
| 抗COX-2抗体 | Santa Cruz | sc-376861 | |
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Biological Industries | -- |
| 胎牛血清 | Biological Industries | -- | |
| 青霉素和链霉素 | Solarbio | P1400 | |
| 胰蛋白酶 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 高糖DMEM培养基 | Biological Industries | -- | |
| AML12细胞系 | Procell | CL-0602 | |
| 药物处理 | 棕榈酸 | Merck | P0500; 57-10-3 |
| 依托莫司 | MedChemExpress | HY-50202 | |
| 乙酸钠 | Merck | S2889; 127-09-3 | |
| SB 204990 | MedChemExpress | HY-16450 | |
| MK 2206 | MedChemExpress | HY-10358 | |
| C646 | MedChemExpress | HY-13823 | |
| 白藜芦醇 | MedChemExpress | HY-16561 | |
| KDAC抑制剂 | MedChemExpress | HY-K0030 | |
| AICAR | MedChemExpress | HY-13417 | |
| 辛酸 | Merck | C2875; 124-07-2 | |
| RT-qPCR | SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q711 |
| 转染 | EZ Trans转染试剂 | LIFE iLAB | AC04L099 |
| KAT活性检测 | HAT活性比色测定试剂盒 | BioVision | K332 |
| NAD+/NADH检测 | EZScreen™ NAD+/NADH比色测定试剂盒 | BioVision | K358 |
| 乙酰辅酶A检测 | 乙酰辅酶A检测试剂盒 | Merck | MAK039 |
| 核蛋白提取 | NE-PER核和细胞质提取试剂 | Thermo Fisher Scientific | 78835 |
| 双荧光素酶检测 | 双荧光素酶报告基因检测系统试剂盒 | TransGen Biotech | FR201 |
| EMSA | LightShift化学发光EMSA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 20148 |
| 定点突变 | Mut Express II快速突变试剂盒V2 | Vazyme | C214 |
| 组织生化检测 | 甘油三酯检测试剂盒 | Applygen Technologies Inc. | -- |
| 血浆生化检测 | ALT/AST检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Inc. | -- |
| 游离脂肪酸检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Inc. | -- | |
| LC-MS | Thermo Fisher U3000 DGLC液相色谱 | Thermo Fisher | -- |
| SCIEX QTRAP 6500 Plus质谱仪 | SCIEX | -- | |
| 乙酰化组学 | PTMScan乙酰化赖氨酸基序(Ac-K)试剂盒 | Cell Signaling Technology | -- |
| Q Exactive质谱仪 | Thermo Fisher | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Takara | -- |
| 反转录 | PrimeScript RT试剂盒 | Takara | -- |
| RNA浓度测定 | NanoDrop 2000分光光度计 | Thermo Fisher | -- |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白浓度测定 | BCA蛋白检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| Beyo ECL Plus化学发光试剂 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| 质粒构建 | QuickCut EcoRI限制酶 | Takara | -- |
| ClonExpress II一步克隆试剂盒 | Vazyme Biotech Co., Ltd. | -- | |
| 双荧光素酶检测 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 免疫沉淀 | Western blotting和IP细胞裂解液 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 抗乙酰化赖氨酸抗体琼脂糖珠 | Cytoskeleton, Inc. | -- | |
| 免疫共沉淀 | ANTI-Flag M2亲和凝胶 | Sigma | -- |
| 小鼠IgG-琼脂糖 | Sigma | -- | |
| Pierce抗HA琼脂糖 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Flag肽 | MedChem Express | -- | |
| HA肽 | MedChem Express | -- | |
| 动物麻醉 | MS222(三卡因甲磺酸盐) | Sigma | -- |
| 细胞培养 | 磷酸盐缓冲液 | Biological Industries | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与饮食处理 | 大黄鱼初始体重(15.87±0.14g)、月龄(4个月)、饲养条件(26±2°C,29–32‰盐度,6–7 mg/L溶解氧)、对照组(12%粗脂质)和高脂组(18%粗脂质)饲料成分、饲喂频率(每天两次,10周) 阅读提示:STAR Methods: Animals and diets |
| 原代肝细胞分离与培养 | 肝组织消化方法(0.25%胰蛋白酶10分钟)、培养条件(DMEM/F12+15%FBS+100U/mL青霉素+100μg/mL链霉素,28°C)、处理时间(PA 12小时,辛酸12小时) 阅读提示:STAR Methods: Cell culture and reagents |
| AML12细胞培养与处理 | 培养条件(DMEM/F12+10%FBS+10μg/mL胰岛素+5.5μg/mL转铁蛋白+5ng/mL硒+40ng/mL地塞米松+1%青霉素/链霉素,37°C,5%CO2)、PA浓度(500μM)和处理时间(24小时) 阅读提示:STAR Methods: Cell culture and reagents |
| 药物处理 | 各抑制剂的浓度和孵育时间:etomoxir(CPT1α抑制)、SB-204990(ACLY抑制)、MK-2206(Akt抑制)、c646(CBP抑制)、MB-3(GCN5抑制)、resveratrol(SIRT1激活)、AICAR(AMPK激活)、KDAC inhibitor(广谱),文种未明确说明具体剂量 阅读提示:STAR Methods: Method details; Figure legends 3-7 |
| Western blot分析 | 一抗来源和货号(Key resources table)、二抗孵育条件(1小时)、ECL显色,蛋白条带密度以GAPDH为内参进行标准化 阅读提示:STAR Methods: Western blot analysis |
| 乙酰辅酶A和NAD+/NADH检测 | 乙酰辅酶A测定试剂盒(MAK039)、NAD+/NADH测定试剂盒(K358)、KAT活性试剂盒(K332),检测波长:乙酰辅酶A(λex=535nm, λem=587nm) 阅读提示:STAR Methods: KAT activity, NAD+ and acetyl-CoA measurements |