重组蛋白制备与验证
获得高纯度、低内毒素的重组蛋白用于后续实验。
将编码rPK5、rGal-3C、rPK5-RL-Gal-3C的基因克隆至pET-22b(+)载体,在E. coli BL21(DE3)中表达,并通过His-tag树脂或α-乳糖琼脂糖纯化,用SDS-PAGE和BCA法检测纯度和浓度。
Novel fusion protein PK5-RL-Gal-3C inhibits hepatocellular carcinoma via anti-angiogenesis and cytotoxicity.
包含体外细胞实验(MTT、管形成、流式、Western blot)、体内动物模型(原位肝癌模型、matrigel plug)及临床相关样本,并进行了功能与机制验证。
HCC细胞系(HepG2、Huh7、PLC/PRF/5) 小鼠肝癌细胞系ML-1原位肝癌模型 人脐静脉内皮细胞(HUVECs) C57BL/6小鼠matrigel plug模型
重组蛋白浓度(2 μmol/l)和处理时间(48 h) 小鼠治疗剂量(100 μg/只,每周一次)及对照组设置 给药方式(腹腔注射) 样本量(每组5-6只) 统计方法(t检验、ANOVA、Kaplan-Meier)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得高纯度、低内毒素的重组蛋白用于后续实验。
将编码rPK5、rGal-3C、rPK5-RL-Gal-3C的基因克隆至pET-22b(+)载体,在E. coli BL21(DE3)中表达,并通过His-tag树脂或α-乳糖琼脂糖纯化,用SDS-PAGE和BCA法检测纯度和浓度。
评估PK5-RL-Gal-3C在原位肝癌模型中的肿瘤抑制效果和安全性。
建立ML-1细胞原位肝癌模型,随机分组后分别给予H1/EEV空载、H1/EEV-PK5、H1/EEV-Gal-3C、H1/EEV-PK5-RL-Gal-3C纳米颗粒或索拉非尼治疗,测量肿瘤重量、生存期、体重及HE染色检测器官损伤。
评估重组蛋白对HUVEC管形成的影响。
将HUVEC与rPK5、rGal-3C、rPK5-RL-Gal-3C或阳性对照E25共培养于matrigel上,观察管形成情况;并加入乳糖或蔗糖竞争抑制Gal-3C域。
评估重组蛋白在matrigel plug模型中对VEGF诱导血管生成的抑制作用。
将含VEGF-A165和重组蛋白的matrigel皮下注射于C57BL/6小鼠,一周后取出plug观察血管形成。
评估重组蛋白对HCC细胞活力的影响,并比较融合蛋白与单独域的效果。
用不同浓度rPK5、rGal-3C、rPK5-RL-Gal-3C处理HepG2、Huh7、PLC/PRF/5细胞48小时,MTT法检测细胞活力;并使用乳糖或蔗糖竞争抑制Gal-3C域。
探究rPK5-RL-Gal-3C对HCC细胞周期和凋亡的影响及分子机制。
用rPK5-RL-Gal-3C处理HepG2细胞后,PI染色检测细胞周期,Annexin V-FITC/PI检测凋亡,Western blot检测周期和凋亡相关蛋白。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素和链霉素 | -- | -- | |
| 蛋白质印迹 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | -- | -- | |
| BCA蛋白浓度测定试剂盒 | Vazyme | -- | |
| 管形成实验 | 基质胶 | -- | -- |
| 乳糖 | -- | -- | |
| 蔗糖 | -- | -- | |
| 基质胶塞实验 | 无酚红低生长因子基质胶 | Corning | -- |
| VEGF-A165 | PeproTech | -- | |
| 细胞活力检测 | MTT试剂盒 | VICMED | -- |
| 流式分析 | 碘化丙啶 | KeyGen Biotech | -- |
| Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | KeyGen Biotech | -- | |
| 动物实验 | 三溴乙醇 | Merck | -- |
| 甲苯磺酸索拉非尼 | TargetMol | -- | |
| 蛋白质印迹 | 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 5174 |
| 抗caspase-8抗体 | Cell Signaling Technology | 9746 | |
| 抗caspase-9抗体 | Cell Signaling Technology | 9504 | |
| 抗caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| 抗PARP抗体 | Cell Signaling Technology | 9532 | |
| 抗Bcl-2抗体 | Cell Signaling Technology | 4223 | |
| 抗Bax抗体 | Cell Signaling Technology | 2772 | |
| 抗CDK4抗体 | Cell Signaling Technology | 12790 | |
| 抗Cyclin D1抗体 | Cell Signaling Technology | 2798 | |
| 抗微管蛋白抗体 | TransGen Biotechnology | HC101-01 | |
| 免疫组织化学 | 抗CD31抗体 | Abcam | ab28364 |
| 抗Ki-67抗体 | Abcam | ab16667 | |
| 蛋白质印迹 | 抗p27抗体 | Proteintech Group | 25614-1-AP |
| 抗p21抗体 | Proteintech Group | 10355-1-AP | |
| 抗Cyclin D3抗体 | Proteintech Group | 26755-1-AP | |
| 抗VEGF-A抗体 | Proteintech Group | 19003-1-AP | |
| 抗HIF-1α抗体 | Proteintech Group | 20960-1-AP | |
| 抗Ang-2抗体 | Proteintech Group | 11992-1-AP | |
| 免疫组织化学 | 抗CD34抗体 | Proteintech Group | 60180-2-Ig |
| 蛋白质印迹 | HRP标记的二抗 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 药物处理 | 去铁胺 | TargetMol | -- |
| 质粒提取 | PureLink™ Hipure质粒大提试剂盒 | Invitrogen | -- |
| 蛋白质纯化 | His标签纯化树脂 | Beyotime Biotechnology | -- |
| α-乳糖-琼脂糖 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 内毒素检测 | ToxinSensor™内毒素检测系统 | GenScript | -- |
| HE染色 | HE染色试剂盒 | Beyotime Technology | -- |
| 成像系统 | Tanon成像系统 | Tanon Science & Technology Co, Ltd | -- |
| 显微成像 | 倒置显微镜 | Olympus Life Science | -- |
| 正置显微镜 | Olympus Life Science | -- | |
| 流式分析 | BD FACSCanto™ II流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 微孔板检测 | 全波长酶标仪 | BioTek Instruments | -- |
| 图像分析 | Image-Pro Plus 7.0 | Media Cybernetics, Inc. | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism 8.0.1 | GraphPad Software, Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系(HepG2、Huh7、PLC/PRF/5、ML-1)的来源和培养条件(培养基、血清浓度、双抗浓度) 阅读提示:Methods: Cell lines and antibodies |
| 重组蛋白制备 | 表达载体(pET-22b+)、宿主菌(E. coli BL21)、诱导剂(IPTG)浓度、纯化方法(His-tag树脂、α-乳糖琼脂糖) 阅读提示:Methods: Preparation of recombinant protein |
| 体内实验 | 小鼠品系(BALB/c、C57BL/6)、周龄(6-8周)、细胞接种量、给药剂量(100 μg/只)、给药频率(每周一次)、治疗周期(4周) 阅读提示:Methods: Animals, Orthotopic mouse liver cancer model |
| 体外管形成实验 | HUVEC来源、蛋白浓度(2 μmol/l)、培养时间(6-8 h)、基质胶用量(100 μl) 阅读提示:Methods: Tube formation assay in vitro |
| 细胞处理 | 药物浓度(4 μmol/l)、处理时间(48 h) 阅读提示:Methods: Cell viability assay, Cell cycle assay, Cell apoptosis assay |