MTHFD2表达与临床相关性分析
评估MTHFD2在膀胱癌中的表达水平及其与临床病理特征和预后的关系。
利用TIMER、TCGA等数据库分析MTHFD2在膀胱癌中的表达,并进行ROC曲线和生存分析;通过WB、RT-qPCR和免疫组化检测细胞系和组织中MTHFD2的表达。
MTHFD2 promotes PD-L1 expression via activation of the JAK/STAT signalling pathway in bladder cancer.
包含体外细胞实验(增殖、迁移、侵袭、凋亡)、体内裸鼠移植瘤模型、临床样本免疫组化及数据库分析,并进行了机制验证(JAK/STAT通路激活剂和敲低实验)。
人膀胱癌细胞系T24和5637 SV-HUC-1正常膀胱上皮细胞系 裸鼠皮下移植瘤模型 膀胱癌患者肿瘤及癌旁组织
细胞系:T24和5637人膀胱癌细胞系,SV-HUC-1正常膀胱上皮细胞系 MTHFD2稳定敲低:使用慢病毒shRNA,筛选浓度4μg/mL嘌呤霉素,处理2-4天 IFN-γ处理:20ng/mL重组人IFN-γ处理24小时 JAK/STAT通路激活剂:20μM RO819115处理 裸鼠移植瘤:T24细胞2×10^6皮下注射,28天后取材
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估MTHFD2在膀胱癌中的表达水平及其与临床病理特征和预后的关系。
利用TIMER、TCGA等数据库分析MTHFD2在膀胱癌中的表达,并进行ROC曲线和生存分析;通过WB、RT-qPCR和免疫组化检测细胞系和组织中MTHFD2的表达。
验证MTHFD2是否促进膀胱癌细胞的增殖能力。
构建MTHFD2稳定敲低T24和5637细胞系,进行CCK-8实验、集落形成实验和Ki67免疫荧光染色。
评估MTHFD2是否促进膀胱癌细胞的迁移和侵袭能力。
采用划痕实验检测细胞迁移,采用Transwell实验检测细胞侵袭,并通过免疫荧光检测间充质标志物Vimentin的表达。
探究MTHFD2是否抑制凋亡、维持线粒体功能并促进细胞周期进展。
通过流式细胞术检测凋亡和细胞周期,JC-1染色检测线粒体膜电位,WB检测Bcl-2、Bax和Cyclin D1的表达。
探索MTHFD2表达与免疫细胞浸润及PD-L1表达的相关性。
利用TIMER数据库分析免疫细胞浸润和免疫检查点分子相关性,GSEA富集分析信号通路,免疫荧光检测PD-L1表达,WB检测IFN-γ处理和MTHFD2敲低后相关蛋白表达。
证实MTHFD2通过JAK/STAT信号通路调控PD-L1表达。
使用JAK/STAT通路激活剂RO819115处理细胞,检测PD-L1表达、细胞功能变化及相关蛋白表达。
验证MTHFD2在体内对膀胱癌肿瘤生长的影响。
建立T24细胞裸鼠皮下移植瘤模型,比较shNC和shMTHFD2组的肿瘤生长,并进行TUNEL染色、免疫组化检测PD-L1表达,WB检测相关蛋白。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Pricella | -- |
| DMEM培养基 | Pricella | -- | |
| F12K培养基 | Pricella | -- | |
| 胎牛血清 | Pricella | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Pricella | -- | |
| 慢病毒转染 | 嘌呤霉素 | Beyotime | -- |
| 药物处理 | 干扰素γ | MedChemExpress | -- |
| RO8191 | MedChemExpress | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Servicebio | -- |
| SweScript All-in-One 第一链cDNA合成预混液 | Servicebio | -- | |
| 2×SYBR Green qPCR预混液 | Servicebio | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Servicebio | -- |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | YEASEN | -- |
| 细胞周期检测 | 碘化丙啶 | YEASEN | -- |
| 线粒体膜电位检测 | 线粒体膜电位检测试剂盒(JC-1) | Beyotime | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Servicebio | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| ECL化学发光试剂盒 | Servicebio | -- | |
| TUNEL检测 | 原位凋亡检测试剂盒 | Roche Applied Science | -- |
| 抗体 | MTHFD2抗体 | Abmart | PHF6156 |
| p-JAK1抗体 | Abmart | TP56310 | |
| p-STAT3抗体 | Abmart | T56566 | |
| PD-L1抗体 | Abmart | T55980 | |
| JAK1抗体 | Abmart | T57173 | |
| STAT3抗体 | Abmart | T55292 | |
| β-Tubulin抗体 | Abmart | M20005 | |
| Ki67抗体 | Proteintech | 27309-1-AP | |
| Vimentin抗体 | Proteintech | 10366-1-AP | |
| PD-L1抗体 | Abcam | ab205921 | |
| Bcl-2抗体 | Wanleibio | WL01556 | |
| Bax抗体 | Wanleibio | WL01637 | |
| Cyclin D1抗体 | Proteintech | 60186-1-Ig | |
| 仪器 | 酶标仪 | -- | -- |
| 显微镜(OLYMPUS IX71) | OLYMPUS | -- | |
| 流式分析 | CytoFLEX流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- |
| 软件 | FlowJo软件 | -- | -- |
| 图像分析 | ImageJ软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源:SV-HUC-1、T24、5637、UMUC3来自中国科学院;培养基:F12K、RPMI-1640、DMEM;添加10%FBS和1%青霉素/链霉素;培养条件:37°C,5% CO2 阅读提示:见Methods 2.3 Cell culture |
| MTHFD2敲低 | 慢病毒shRNA序列(文中未提供具体序列);感染后恢复24小时;筛选:4μg/mL嘌呤霉素处理2-4天 阅读提示:见Methods 2.4 Lentiviral transfection |
| IFN-γ处理 | 浓度:20ng/mL;时间:24小时 阅读提示:见Methods 2.4 Lentiviral transfection和Results 3.6 |
| JAK/STAT通路激活 | RO819115浓度:20μM;处理时间:文中未明确说明 阅读提示:见Methods 2.4 Lentiviral transfection |
| 细胞增殖检测 | CCK-8:1000细胞/孔,检测时间点0、24、48、72、96小时;集落形成:500细胞/孔,培养2周 阅读提示:见Methods 2.6 Cell viability assays |
| 迁移和侵袭检测 | 划痕实验:观察时间36小时;Transwell侵袭实验:8×10^4细胞/孔,培养72小时,Matrigel包被 阅读提示:见Methods 2.7 Wound healing assay和2.8 Transwell cell invasion assay |
| 凋亡和细胞周期检测 | 细胞密度1×10^6细胞/孔;使用Annexin V-FITC/PI试剂盒和PI染色 阅读提示:见Methods 2.9 Apoptosis and cell cycle analysis |
| 蛋白表达检测 | WB一抗稀释比:MTHFD2 1:5000,PD-L1 1:500,p-JAK1 1:2000,JAK1 1:2000,p-STAT3 1:1000,STAT3 1:2000,Bcl-2 1:500,Bax 1:1000,Cyclin D1 1:5000,β-Tubulin 1:5000;内参:β-Tubulin 阅读提示:见Methods 2.12 Western blot analysis |
| 体内实验 | 动物:4周龄裸鼠;细胞数量:T24 2×10^6;注射体积:100μL PBS;皮下注射;28天后取材 阅读提示:见Methods 2.13 Nude mouse xenograft assay |
| 生物信息学分析 | TCGA-BLCA数据;分组:高表达205例,低表达206例;GSEA阈值:p<0.05,FDR<0.25 阅读提示:见Methods 2.1 Data mining and bioinformatics analyses |