体外抗菌活性测定
评估牛磺酸对李斯特菌生长的直接抑制作用。
采用肉汤微量稀释法测定MIC和MBC;测定不同浓度牛磺酸处理下的生长曲线、CFU、溶血活性和生物膜形成。
Taurine attenuates Listeria monocytogenes-induced inflammation and pyroptosis in mouse model by regulating MAPK and NLRP3/caspase-1/GSDMD pathways.
研究包含体外细菌实验、细胞实验、动物模型等多个证据层级,并通过Western blot、抑制剂回补等进行了功能与机制验证。
小鼠J774.1巨噬细胞系 BALB/c小鼠感染模型
牛磺酸浓度:体外100 mM,体内400 mg/kg 李斯特菌感染剂量:2×10^4 CFU/只(尾静脉注射) 牛磺酸给药方案:感染后2小时腹腔注射,每日一次,持续3天 NLRP3抑制剂MCC950(10 μM)预处理2小时 p38 MAPK抑制剂SB203580(5 mg/kg/天)腹腔注射3天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估牛磺酸对李斯特菌生长的直接抑制作用。
采用肉汤微量稀释法测定MIC和MBC;测定不同浓度牛磺酸处理下的生长曲线、CFU、溶血活性和生物膜形成。
探究牛磺酸对李斯特菌转录水平的影响,寻找潜在作用靶点。
对800 mM牛磺酸处理6小时的李斯特菌进行RNA-seq,分析差异表达基因并进行GO和KEGG富集。
验证牛磺酸在巨噬细胞中抑制李斯特菌胞内复制和细胞毒性的作用。
用J774.1细胞感染李斯特菌(MOI=10),加入100 mM牛磺酸,通过CCK-8、LDH释放、流式细胞术和RT-qPCR检测细胞活力和炎症因子表达。
评估牛磺酸对李斯特菌感染小鼠的治疗效果。
BALB/c小鼠尾静脉注射李斯特菌,感染后2小时腹腔注射牛磺酸(100-800 mg/kg)每日一次共3天,观察生存率、体重、器官细菌载量、氧化应激和组织病理。
探究牛磺酸对李斯特菌感染小鼠T细胞增殖和功能的影响。
分离感染后72小时的脾细胞,通过流式细胞术检测总T细胞、CD4+/CD8+ T细胞数量和IFN-γ产生情况。
阐明牛磺酸调节MAPK和NLRP3/caspase-1/GSDMD通路的机制。
Western blot检测小鼠肝脏中MAPK通路磷酸化水平和NLRP3/caspase-1/GSDMD蛋白表达;使用p38抑制剂SB203580和NLRP3抑制剂MCC950进行回补实验。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细菌培养 | 胰蛋白胨大豆肉汤 | Hopebio | HB4114 |
| 胰蛋白胨大豆琼脂 | Hopebio | HB0177 | |
| 药物处理 | 牛磺酸 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 转录组测序 | TRIzol试剂 | Invitrogen Life Technologies | -- |
| AMPure XP系统 | Beckman Coulter | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒(CCK8) | EallBio Life Sciences | -- |
| 细胞毒性检测 | 乳酸脱氢酶释放检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 细胞凋亡检测 | 凋亡检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 动物实验 | MCC950 | -- | -- |
| SB203580 | -- | -- | |
| 氧化应激检测 | 髓过氧化物酶检测试剂盒 | Jiancheng | -- |
| 过氧化氢检测试剂盒 | Jiancheng | -- | |
| 药代动力学 | 牛磺酸检测试剂盒(MET-5071) | Cell Biolabs | MET-5071 |
| 流式细胞术 | FITC标记的抗CD4抗体 | -- | GK1.5 |
| PE标记的抗CD8a抗体 | -- | 53.0-6.7 | |
| APC标记的抗IFN-γ抗体 | -- | XMG1.2 | |
| 同型对照大鼠IgG1 | -- | R3-34 | |
| FITC标记的抗CD4抗体 | -- | GK1.5 | |
| PE标记的抗CD8a抗体 | -- | 53.0-6.7 | |
| RT-qPCR | HiScript III第一链cDNA合成试剂盒 | Vazyme | R323 |
| ChamQ SYBR Color qPCR预混液 | Vazyme | Q311 | |
| 细菌RNA提取 | MolPure细菌RNA提取试剂盒 | Yeasen | -- |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| Western blot | 抗JNK1+JNK2+JNK3多克隆抗体 | Bioss | bs-2592R |
| 抗磷酸化JNK1/2/3单克隆抗体 | Bioss | bsm-52462R | |
| 抗ERK1/2单克隆抗体 | Bioss | bsm-52259R | |
| 抗磷酸化ERK1/2多克隆抗体 | Bioss | bs-3016R | |
| p38 MAPK兔单克隆抗体 | CST | 8690 | |
| 磷酸化p38 MAPK兔单克隆抗体 | CST | 4511 | |
| IL-1β多克隆抗体 | Bioss | bs-812R | |
| Caspase 1/p20/p10多克隆抗体 | Proteintech | 22915-1-AP | |
| 总GSDMD和裂解N端GSDMD抗体 | Abmart | P79887R | |
| NLRP3单克隆抗体 | Proteintech | 68102-1-Ig | |
| β-actin抗体 | Servicebio | GB15003 | |
| GAPDH抗体 | Servicebio | GB11002 | |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG | ABclonal | AS003 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG | ABclonal | AS014 | |
| 增强化学发光ECL试剂盒 | Tanon | 180-501 | |
| Western blot检测系统 | Tanon | -- | |
| 流式细胞术 | NovoCyte流式细胞仪 | Agilent | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外抗菌活性测定 | 牛磺酸浓度(80-800 mM)、细菌接种量、培养时间、MIC/MBC测定方法 阅读提示:Materials and Methods: Determination of minimum inhibitory concentration and minimum bactericidal concentration; Growth curves and CFU determination |
| 细胞感染实验 | J774.1细胞培养条件、MOI=10、牛磺酸浓度100 mM、gentamicin浓度100 µg/mL、感染时间4小时 阅读提示:Materials and Methods: Cell line infection; Cytotoxicity assays |
| 动物模型 | 小鼠品系、年龄、性别、感染剂量(2×10^4 CFU)、给药途径(尾静脉和腹腔)、牛磺酸剂量(400 mg/kg)、给药时间(感染后2小时,每日一次共3天) 阅读提示:Materials and Methods: Animal experiment |
| 信号通路验证 | Western blot抗体和稀释比例、p38抑制剂SB203580剂量(5 mg/kg/day)、NLRP3抑制剂MCC950浓度(10 μM) 阅读提示:Materials and Methods: Immunoblot analysis; Results: Taurine enhances MAPK signaling pathway and downregulates Lm-activated NLRP3 inflammasome in mice |
| 药代动力学 | 单次腹腔注射400 mg/kg牛磺酸后,在0-72小时多个时间点采集血液和组织样品,检测牛磺酸浓度 阅读提示:Materials and Methods: Pharmacokinetics study |