KNG1在衰老皮肤中表达上调的检测
验证KNG1在内在皮肤衰老中的表达变化。
对3个月和15个月小鼠背部皮肤进行4D蛋白质组学测序,并通过IHC和Western blot验证不同月龄(3, 9, 18个月)小鼠皮肤KNG1表达;同时分析人类皮肤样本(GSE106940数据集和IHC)中KNG1的表达。
Decoding skin aging: the role of KNG1 in collagen and elastic fibre degradation.
包含体内小鼠模型(过表达和敲低)、体外原代成纤维细胞实验、人类皮肤样本验证、蛋白质组学与PPI网络分析,并进行了组织学和分子机制验证。
C57BL/6J小鼠皮肤(背部) 原代小鼠成纤维细胞 人眼睑皮肤和阳光保护背部皮肤样本 GSE106940数据集(人类臀部皮肤样本)
小鼠品系、性别和年龄:雌性C57BL/6J小鼠,年龄3、6、9、15、18个月 慢病毒载体:空载体pCLenti-U6-shRNA(NC)-CMV-EGFP-WPRE、干扰载体pCLenti-U6-shRNA(KNG1)-CMV-EGFP-WPRE、过表达载体pcSLenti-EF1-EGFP-CMV-Kng1-WPRE 皮下注射剂量:20 μL,浓度1×10^8 TU/ml(NC和shKNG1)或2.72×10^8 TU/ml(oeKNG1) 处理后时间:7天收获组织 抗体信息:KNG1 (1:200)、MME (1:200)、EPHX2 (1:200)、MMP1 (1:200)、MMP9 (1:200)、Lamin B1 (1:200)、ELN (1:200)、8-OHdG (1:100)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证KNG1在内在皮肤衰老中的表达变化。
对3个月和15个月小鼠背部皮肤进行4D蛋白质组学测序,并通过IHC和Western blot验证不同月龄(3, 9, 18个月)小鼠皮肤KNG1表达;同时分析人类皮肤样本(GSE106940数据集和IHC)中KNG1的表达。
探究KNG1对皮肤衰老表型(厚度、增殖、衰老标志物)的因果作用。
通过皮下注射慢病毒在6个月和18个月小鼠皮肤中过表达或敲低KNG1,7天后进行H&E染色测量真皮厚度,EdU染色检测成纤维细胞增殖,IHC检测Lamin B1,SA-β-gal染色检测细胞衰老。
研究KNG1是否通过MMP1/MMP9调节胶原纤维降解。
Masson三色染色观察胶原纤维形态和密度,Western blot和IHC检测MMP9和MMP1表达,STRING数据库分析KNG1与胶原相关基因的相互作用。
探究KNG1是否通过MME调节弹性纤维降解。
Gomori醛品红染色观察弹性纤维,IHC检测弹性蛋白(ELN)表达,Western blot和IHC检测MME表达,STRING数据库筛选与KNG1相互作用的蛋白(评分>0.4),共17个,其中包括MME。
探究KNG1是否通过EPHX2调节皮肤氧化应激水平。
IHC检测8-OHdG作为氧化应激标志物,Western blot和IHC检测EPHX2表达,发现KNG1过表达升高EPHX2,敲低降低EPHX2。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白质组学测序 | 4D蛋白质组学测序 | Jingjie PTM BioLab | -- |
| 免疫组织化学染色(一抗) | KNG1抗体 | Proteintech | 11926-1-AP |
| 抗MME抗体 | Proteintech | 18008-1-AP | |
| MMP1抗体 | Proteintech | 10371-2-AP | |
| MMP9抗体 | Proteintech | 10375-2-AP | |
| EPHX2抗体 | Proteintech | 10833-1-AP | |
| Lamin B1抗体 | Abcam | ab133741 | |
| ELN抗体 | ABclonal | A2723 | |
| 8-OHdG抗体 | Bioss | bs-1278R | |
| Western blot(内参) | β-肌动蛋白抗体 | Rayay | RM2001 |
| 细胞培养 | 胰蛋白酶 | -- | -- |
| 胶原酶I | -- | -- | |
| 低糖DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 细胞增殖检测 | EdU(5-乙炔基-2'-脱氧尿苷) | -- | -- |
| Apollo和核染料 | RiboBio | -- | |
| 衰老染色 | β-半乳糖苷酶染色液 | Beyotime | -- |
| 组织脱水透明 | 二甲苯 | GHTECH | -- |
| 石蜡包埋 | 石蜡 | LEICA | -- |
| 特殊染色 | Masson三色和Gomori弹性纤维染色试剂盒 | Solarbio | -- |
| 免疫组织化学 | 柠檬酸盐缓冲液 | Boster | -- |
| 山羊血清 | SolarBio | -- | |
| 显微镜观察 | Leica DM40008显微镜 | Leica | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 冷冻研磨机 | Luka | -- | |
| 预染分子量标记 | Epizyme | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| QuickBlock™封闭液 | Beyotime | -- | |
| 山羊抗小鼠二抗 | -- | -- | |
| 山羊抗兔二抗 | -- | -- | |
| Meilunbio Feikert超敏增强化学发光液 | Meilunbio | -- | |
| Tanon 5200CE化学发光成像系统 | Tanon | 5200CE | |
| 图像分析 | ImageJ软件 | -- | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism软件 | GraphPad | -- |
| 慢病毒感染 | Dulbecco磷酸盐缓冲液 | -- | -- |
| pCLenti-U6-shRNA(NC)-CMV-EGFP-WPRE慢病毒载体 | Obio Technology | -- | |
| pCLenti-U6-shRNA(KNG1)-CMV-EGFP-WPRE慢病毒载体 | Obio Technology | -- | |
| pcSLenti-EF1-EGFP-CMV-Kng1-WPRE慢病毒载体 | Obio Technology | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| KNG1表达检测(小鼠皮肤) | 小鼠品系、性别、年龄、样本量、抗体货号和稀释比例 阅读提示:Methods: Dorsal skin samples, Primary antibody; Figure legends 1C-F |
| KNG1表达检测(人类皮肤) | 皮肤样本来源(眼睑、背部)、年龄、样本量、IHC条件 阅读提示:Methods: Human skin specimen collection; Figure legends 1G-H, S1B-C |
| 慢病毒感染模型 | 慢病毒载体、滴度、注射剂量、注射方式、处理时间 阅读提示:Methods: Lentiviral infection; Figure S2-S3 |
| 细胞增殖与衰老检测 | 转染时间、EdU浓度和孵育时间、SA-β-gal染色条件 阅读提示:Methods: Cell proliferation assay, Senescence-associated β-galactosidase staining; Figure legends 2G-L |
| 组织学染色 | 固定、脱水、包埋、切片厚度、染色试剂盒 阅读提示:Methods: Histological examination; Figure legends 3A, 4A |
| 蛋白表达检测(Western blot) | 抗体稀释比例、裂解液、上样量、转膜条件 阅读提示:Methods: Western blot analysis |