转录组测序和加权基因共表达网络分析揭示大鼠深低温停循环后肺脏中心基因和分子通路的变化

背景：涉及深低温停循环（DHCA）的主动脉夹层修复手术后急性肺损伤（ALI）的发生率显著较高。我们使用转录组测序和加权基因共表达网络分析（WGCNA）分析了DHCA后大鼠肺组织中的中心基因和信号通路。方法：建立大鼠DHCA模型，术后收集肺组织。采用高通量转录组测序评估DHCA组和非DHCA组之间的基因表达差异。利用DESeq2方法分析两组间的差异表达基因（DEGs），并通过WGCNA、蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络和iRegulon插件进一步筛选中心基因及其上游分子。通过基因本体论和京都基因与基因组百科全书分析检查中心基因的生物学功能。通过实验验证评估两组中心基因mRNA和蛋白质水平的变化。结果：与对照组相比，DHCA组共鉴定出438个DEGs。WGCNA进一步揭示197个关键基因。后续PPI分析鉴定出八个中心基因：FOS、FOSB、JUN、EGR1、ATF3、NR4A1、CCN1和ZFP36。中心基因主要与炎症、细胞凋亡和细胞免疫反应相关。ATF3和SRF可能作为潜在的上游调节因子。实验结果进一步证实这些中心基因发生了显著变化，且DHCA期间肺组织出现显著损伤。结论：DHCA显著改变大鼠肺组织中的基因表达模式。鉴定出的与炎症和凋亡相关的中心基因和信号通路可能作为DHCA后肺损伤的潜在治疗靶点。