验证PrP(N)在体内的神经毒性
确定PrP(N)在体内是否足以引起快速神经退行性变及其特征。
通过ICV注射rAAV在新生小鼠脑中表达PrP1-110-Nb(融合纳米抗体),并利用CRISPR敲入小鼠(LSL-PrP1-110-Nb)及他莫昔芬诱导表达进行验证,观察生存曲线、体重及病理变化。
Soluble N-terminal region of prion protein causes rapid neurodegeneration in prion disease.
包含rAAV介导的小鼠体内表达、CRISPR敲入小鼠模型、蛋白溶解度及脂膜结合分析、结构域缺失突变、蛋白质组学以及朊病毒感染实验等多层级功能验证。
野生型小鼠 Prnp敲除小鼠 神经元特异性EMX1-Cre驱动的LSL-PrP1-90-Nb小鼠 他莫昔芬诱导的Rosa26-CreERT2驱动的LSL-PrP1-110-Nb小鼠
rAAV介导的PrP1-110-Nb或PrP1-90-Nb表达水平及ICV注射剂量(3×10^10 gc) PrP(N)的毒性阈值:rAAV稀释倍数(2倍、5倍、10倍)影响小鼠致死率 CC1区域的必需性:删除或突变KKRPKP序列完全消除神经毒性 N1ΔCC1-Nb可加剧PrP1-90-Nb诱导的神经退行性变及朊病毒感染小鼠的病程 神经毒性PrP(N)的溶解度、膜结合特性及PK敏感性
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定PrP(N)在体内是否足以引起快速神经退行性变及其特征。
通过ICV注射rAAV在新生小鼠脑中表达PrP1-110-Nb(融合纳米抗体),并利用CRISPR敲入小鼠(LSL-PrP1-110-Nb)及他莫昔芬诱导表达进行验证,观察生存曲线、体重及病理变化。
探究PrP(N)的表达水平是否需超过一定阈值才能引发神经毒性。
通过将rAAV进行2倍、5倍和10倍稀释后注射小鼠,比较不同剂量下的致死率,并检测脑内PrP1-110-Nb水平。
鉴定PrP(N)中介导神经毒性的最小区域。
表达PrP1-90-Nb(N2片段)及PrP1-135-Nb,比较其神经毒性,并通过构建LSL-PrP1-90-Nb/Emx1-cre小鼠验证神经元特异性表达的影响。
确定PrP(N)是可溶性还是聚集状态,及其与细胞膜的相互作用方式。
通过超速离心分离可溶/不溶组分、密度梯度离心分析膜结合情况,并用碱溶液提取验证外周膜结合特性。
确定CC1和八肽重复序列(OR)对神经毒性的相对贡献。
表达删除CC1的突变体(N1ΔCC1-Nb)或CC1正电荷残基突变为甲硫氨酸的突变体(N1MCC1-Nb),以及缺失OR的突变体(N2ΔOR-Nb),比较其神经毒性。
探究无毒的PrP(N)ΔCC1是否能影响PrP(N)诱导的神经毒性。
共表达N1ΔCC1-Nb或N2ΔCC1-Nb与PrP1-90-Nb,观察生存时间变化。
验证PrP(N)诱导的神经毒性机制是否与朊病毒病中的神经退行性变一致。
比较PrP1-110-Nb诱导的蛋白质组学变化与朊病毒病的变化;并测试N1ΔCC1-Nb是否加速朊病毒感染小鼠的病程。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 质粒构建 | Bam HI限制性内切酶 | New England Biolabs | R3136S |
| Eco RI限制性内切酶 | New England Biolabs | R3101S | |
| pAAV-CAG-tdTomato质粒 | -- | -- | |
| PCR聚合酶 | TransGen Biotech | AP221-11Kit | |
| 连接酶 | TransGen Biotech | CU201-02 | |
| 感受态细胞 | TransGen Biotech | CD201-02 | |
| 动物实验 | 他莫昔芬 | Sigma-Aldrich | T5648-5G |
| 玻璃微电极 | RWD Life Science | B-15086-10F | |
| 注射泵 | LSP Syringe Pump | LSP01-1B | |
| 组织学分析 | 10%中性缓冲福尔马林 | Beijing Solarbio | G2161 |
| H&E染色试剂盒 | Beijing Solarbio | G1120 | |
| 牛血清白蛋白 | Beijing Solarbio | A8020 | |
| 抗体稀释液 | Thermo Fisher Scientific | 003218 | |
| 抗Iba1抗体 | Abcam | ab289874 | |
| 抗GFAP抗体 | Bioss | bs-0199R | |
| 二抗(PV-8000) | ZSGB-Bio | PV-8000 | |
| 显色试剂盒 | ZSGB-Bio | PV-8000 | |
| 甲酸溶液 | Aladdin | F112038 | |
| 生化分析 | Triton X-100 | -- | -- |
| 脱氧胆酸钠 | -- | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23227 | |
| 6D11抗体 | BioLegend | 808003 | |
| VHH抗体 | GenScript Biotech | A01860 | |
| 8B4抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-47729 | |
| SAF32抗体 | Cayman | 189720 | |
| 3F10抗体 | gift from Y.-S. Kim | -- | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | A1978 | |
| HRP偶联山羊抗兔IgG | Proteintech | SA00001-2 | |
| HRP偶联山羊抗小鼠IgG | Proteintech | SA00001-1 | |
| ECL试剂盒 | Tanon | 180-5001 | |
| iBright FL1000成像系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 5%脱脂牛奶 | Solarbio | D8340 | |
| 碘克沙醇 | -- | -- | |
| 蔗糖 | -- | -- | |
| 超速离心机 | Thermo Fisher Scientific | MX | |
| 水浴超声仪 | Qsonica | Q700 | |
| 匀浆器 | Next Advance | BT24M | |
| 蛋白质组学 | 盐酸胍 | -- | -- |
| 二硫苏糖醇 | Roche | 3483-12-3 | |
| 胰蛋白酶 | -- | -- | |
| 10K超滤管 | PALL | OD010C34 | |
| tC18 SepPak柱 | Waters | WAT023590 | |
| iRT内标肽 | Biognosys | KI-3002-2 | |
| 纳升液相系统 | Waters | M | |
| Orbitrap Exploris 480质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Acclaim PepMap捕集柱 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 自制C18色谱柱 | Dr. Maisch | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 10.1.2 | GraphPad Software | -- |
| 蛋白质组学数据分析 | Spectronaut 18 | Biognosys | -- |
| Perseus | -- | -- | |
| Origin 2017 | OriginLab | -- | |
| SRplot | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| PrP(N)表达载体及注射 | rAAV滴度(3×10^10 gc/只);ICV注射新生鼠(P1);注射体积及位点 阅读提示:Materials and Methods: ICV injection and tissue collection; Figure 1 legend |
| 体内神经毒性验证 | 小鼠品系(WT, Prnp KO, LSL-PrP1-110-Nb, LSL-PrP1-90-Nb);他莫昔芬诱导剂量(10 μg/g/天,7天);生存时间及病理评估 阅读提示:Materials and Methods: Animals; Figure 1, Figure 3 legends |
| 毒性阈值实验 | rAAV稀释倍数(1、2、5、10);观察指标:致死率、PrP1-110-Nb表达水平 阅读提示:Results: 'PrP(N) needs to exceed a toxic threshold...';Figure 2 legend |
| 结构域功能分析 | 突变体(N1ΔCC1-Nb, N1MCC1-Nb, N2ΔOR-Nb)的表达量;注射剂量;与PrP1-90-Nb共注射时的剂量配比 阅读提示:Results: 'CC1 is essential...';Figure 4 legend |
| 朊病毒感染实验 | 朊病毒株(rPrPres17kDa, RML);接种剂量(1%脑匀浆,30 μl);小鼠周龄(5-6周);N1ΔCC1-Nb或Nb对照的rAAV预注射时间 阅读提示:Materials and Methods: Animals (prion inoculation);Results: 'PrP(N) causes rapid neurodegeneration in prion disease';Figure 5 legend |