动物模型建立与组织病理学分析
评估ATR诱导的肝损伤及LYC的保护作用。
将75只蛋鸡随机分为5组,饲喂含ATR和/或LYC的饲料4个月,收集肝组织进行H&E染色、铜染色、TEM观察线粒体结构。
Cuproptosis in atrazine-induced hepatotoxicity: ATOX1 as a therapeutic target for lycopene-mediated protection.
包含体内动物模型和体外细胞模型,并通过ATOX1敲低和分子对接进行功能验证和机制验证。
7周龄海兰褐蛋鸡动物模型 LMH鸡肝癌细胞系 铜诱导的LMH细胞铜死亡模型
动物分组:C、VCon、ATR (100 mg/kg)、LYC (5 mg/kg)、ATR+LYC组,每组15只,饲喂4个月 细胞处理:200 μM ATR和/或2.5 μM LYC处理LMH细胞12小时 铜处理:50 μM铜离子处理LMH细胞 ATOX1敲低:siATOX1转染LMH细胞,剂量为40 pmol和80 pmol 统计设计:每组n=3,数据以均值±SD表示,P<0.05为显著
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估ATR诱导的肝损伤及LYC的保护作用。
将75只蛋鸡随机分为5组,饲喂含ATR和/或LYC的饲料4个月,收集肝组织进行H&E染色、铜染色、TEM观察线粒体结构。
验证ATR诱导的氧化应激和铜积累,以及LYC的缓解作用。
检测肝脏中MDA、H2O2、CAT、T-GSH、SOD水平以及铜含量,并进行铜染色。
评估ATR是否诱导肝细胞铜死亡,及LYC的抑制作用。
通过Western blot和RT-qPCR检测铜死亡相关蛋白(CTR1、FDX1、DLAT、ATP7B等)和mRNA水平,并检测代谢物丙酮酸和α-酮戊二酸含量。
在体外验证ATR诱导的铜死亡和LYC的保护作用。
用ATR和/或LYC处理LMH细胞,检测细胞活力、形态、铜死亡标志物和代谢物。
验证ATOX1在ATR诱导铜死亡中的关键作用。
用siATOX1转染LMH细胞,检测铜死亡标志物和代谢物变化。
预测LYC与ATOX1的结合模式。
使用AutoDock Vina进行分子对接,计算结合能并用PyMol可视化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 莠去津 | Shandong Binnong Technology Co., LTD. | -- |
| 番茄红素 | Solarbio | -- | |
| 氧化应激检测 | 丙二醛检测试剂盒 | Jiancheng Biotechnology | A003-1-1 |
| 过氧化氢检测试剂盒 | Jiancheng Biotechnology | A064-1-1 | |
| 过氧化氢酶检测试剂盒 | Jiancheng Biotechnology | A007-2-1 | |
| 总谷胱甘肽检测试剂盒 | Jiancheng Biotechnology | A061-1-1 | |
| 总超氧化物歧化酶检测试剂盒 | Jiancheng Biotechnology | A001-2 | |
| 蛋白质定量 | 总蛋白定量试剂盒 | Jiancheng Biotechnology | A045-2-2 |
| 铜含量检测 | 铜检测试剂盒 | Solarbio | BC5560 |
| 代谢物检测 | α-酮戊二酸检测试剂盒 | Solarbio | BC5420 |
| RNA提取 | Trizol | Invitrogen | 15596026CN |
| cDNA合成 | FastQuant逆转录试剂盒 | Tiangen | KR116 |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | -- | -- | |
| 硝酸纤维素膜 | -- | -- | |
| 抗FDX1抗体 | Abclonal | A24786 | |
| 抗ATOX1抗体 | Abclonal | A6874 | |
| 抗CTR1抗体 | Abclonal | A0773 | |
| 抗ACSL4抗体 | Abclonal | A20414 | |
| 抗GPX4抗体 | Abclonal | A21440 | |
| 抗Caspase-3抗体 | Abclonal | A0214 | |
| 抗LIAS抗体 | Proteintech | 11577-1 | |
| 抗COX17抗体 | Proteintech | 11464-1-AP | |
| 抗ATP7B抗体 | Proteintech | 19786-1-AP | |
| 抗BAX抗体 | Wanleibio | -- | |
| 抗DLAT抗体 | Bioss | bs-19695R | |
| 抗硫辛酸抗体 | Abcam | ab58724 | |
| β-肌动蛋白 | Bioss | bs-0061R | |
| Amersham Imager 600成像系统 | GE | -- | |
| 细胞培养 | DMEM/F-12培养基 | Meilun | MA0214 |
| 胎牛血清 | VivaCell | -- | |
| 细胞处理 | 番茄红素 | Shanghai yuanye Bio-Technology Co., Ltd | B20378 |
| 莠去津 | Aladdin | A114432 | |
| 铜离子 | Aladdin | C110828 | |
| 细胞活力检测 | CCK-8溶液 | Dojindo | CK04 |
| siRNA转染 | TRS002 SuperTrans转染试剂 | Gencefebio | TRS002 |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | -- | -- |
| DAPI | -- | -- | |
| 二抗 | Bioss | bs-0295G-BF488 | |
| 二抗 | Proteintech | SA00013-4 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 动物品系、年龄、分组、剂量、给药方式、饲养时间 阅读提示:参见Materials and methods中的Animals and experimental design |
| 组织病理学分析 | 固定液、切片厚度、染色方法 阅读提示:参见Materials and methods中的Histopathological analysis |
| 氧化应激检测 | 试剂盒品牌、货号、检测方法 阅读提示:参见Materials and methods中的Analysis of liver oxidative stress indicators |
| 铜含量和代谢物检测 | 试剂盒品牌、货号 阅读提示:参见Materials and methods中的Measurement of copper content and metabolic indices |
| Western blot | 抗体品牌、货号、稀释比例、封闭和孵育条件 阅读提示:参见Materials and methods中的Western blot analysis |
| RT-qPCR | 引物序列、RNA提取方法、逆转录试剂盒、仪器 阅读提示:参见Materials and methods中的Quantitative real-time PCR analysis |
| 细胞培养和处理 | 细胞系、培养基、血清、处理浓度和时间 阅读提示:参见Materials and methods中的Cell experimental design |
| siRNA转染 | siRNA序列、转染试剂、剂量、转染时间 阅读提示:参见Materials and methods中的siRNA transfection |
| 免疫荧光 | 抗体浓度、孵育时间、封片剂 阅读提示:参见Materials and methods中的Immunofluorescence |
| 分子对接 | 软件版本、对接参数、结合能阈值 阅读提示:参见Materials and methods中的Molecular docking |