LMOD家族在骨骼肌中的表达特征分析
评估LMOD1-3在猪组织和C2C12细胞增殖分化过程中的表达变化,以确定研究对象。
通过qRT-PCR和Western blot检测猪组织和C2C12细胞中LMOD1-3的表达,并观察肌肉损伤和发育过程中的蛋白变化。
LMOD2 interaction with ACTC1 regulates myogenic differentiation.
包含细胞体外敲除、转录组分析、双荧光素酶报告、Co-IP、体内慢病毒敲低等多个独立证据层级,且涉及功能与机制验证。
C2C12细胞 HEK293T细胞 小鼠(C57BL/6j)体内模型 猪骨骼肌组织
LMOD2基因敲除细胞系的构建及敲除效率验证(PCR和Sanger测序) 肌纤维类型标志物(MyHC-I、MyHC-2a、MyHC-2x、MyHC-2b)的表达变化 慢病毒介导的LMOD2敲低在小鼠体内的注射方法及肌肉质量评估 LMOD2与ACTC1相互作用的Co-IP验证
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估LMOD1-3在猪组织和C2C12细胞增殖分化过程中的表达变化,以确定研究对象。
通过qRT-PCR和Western blot检测猪组织和C2C12细胞中LMOD1-3的表达,并观察肌肉损伤和发育过程中的蛋白变化。
明确LMOD2缺失对成肌细胞增殖和肌纤维类型的影响。
利用CRISPR-Cas9构建LMOD2敲除的C2C12细胞系,通过qRT-PCR、Western blot和免疫荧光检测肌纤维类型标志物及增殖相关蛋白。
在转录水平上揭示LMOD2敲除后差异表达基因及其富集通路。
对增殖期和分化期的LMOD2-KO和WT C2C12细胞进行RNA-seq,并进行GO、KEGG和GSEA分析。
验证MyoG是否为LMOD2的转录因子以及miR-335-3p是否直接靶向LMOD2。
通过敲低MyoG和MyoD1检测LMOD2表达,双荧光素酶报告实验验证MyoG和miR-335-3p对LMOD2的靶向调控。
寻找与LMOD2相互作用的蛋白并验证其功能。
利用RNA-seq和STRING数据库筛选候选蛋白,并通过Co-IP验证LMOD2与ACTC1的相互作用,进而通过siRNA敲低ACTC1检测其对肌原性分化的影响。
验证LMOD2在体内对骨骼肌质量和肌纤维类型的作用。
通过肌肉注射慢病毒介导的shRNA敲低小鼠骨骼肌中LMOD2,检测肌肉重量和肌纤维类型标志物的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 马血清 | Gibco | -- | |
| C2C12细胞 | ATCC | -- | |
| 293T细胞 | ATCC | -- | |
| 转染 | 脂质体2000 | Invitrogen | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| RT-qPCR | SYBR Green试剂盒 | TransGen | -- |
| CCK-8实验 | CCK-8试剂盒 | AFExBIO | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| LMOD1抗体 | Proteintech | 15117-1-AP | |
| LMOD2抗体 | Affinity Biosciences | DF15006 | |
| LMOD3抗体 | Proteintech | 14948-1-AP | |
| MyHC-I抗体 | Proteintech | 22280-1-AP | |
| MYHC-2a抗体 | DSHB | 2F7 | |
| MyHC-2x抗体 | Proteintech | 67299-1-Ig | |
| MyHC-2b抗体 | DSHB | BF-F3 | |
| PAX7抗体 | Proteintech | 20570-1-AP | |
| MyoD1抗体 | HuaBio | ER1913-45 | |
| MyoG抗体 | HuaBio | HA721688 | |
| ACTC1抗体 | Proteintech | 11032-1-AP | |
| MYH3抗体 | Bioss | bs-10905R | |
| β-actin抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| 二抗 | Biodragon | BF03001X和BF03008X | |
| 免疫荧光 | MyHC-I抗体 | Proteintech | 22280-1-AP |
| MyH-2b抗体 | Invitrogen | 14-6503-80 | |
| MyHC-2x抗体 | Proteintech | 67299-1-Ig | |
| MyHC-2a抗体 | DSHB | 2F7 | |
| 二抗 | Bioss; ZENBIO | bs-0296G-Cy3; | |
| DAPI | -- | -- | |
| Leica SP8显微镜 | Leica | -- | |
| 免疫共沉淀 | Pierce™蛋白A/G琼脂糖珠 | Invitrogen | -- |
| 动物实验 | 心脏毒素 | BOYAO | 9012-91-3 |
| LV3载体 | GenePharma | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 样本获取与处理 | 猪品种、年龄、采样部位;肌肉损伤模型注射剂量(40µM Cardiotoxin 1mL)及时间点(1、4、16天) 阅读提示:Methods中Sample Preparation |
| 细胞培养 | C2C12和293T细胞培养条件(DMEM+10%FBS或2%马血清,5%CO2,37℃) 阅读提示:Methods中Cell culture |
| 基因敲除与敲低 | CRISPR-Cas9靶向LMOD2外显子1的gRNA序列;siRNA序列(如si-ACTC1-1073);转染试剂及条件 阅读提示:Methods中Plasmids, siRNAs, and transfection、Generation of LMOD2 knockout C2C12 cells |
| 表达检测 | 抗体稀释比例(如1:1000或1:500);qRT-PCR引物序列;内参基因选择(β-actin、GAPDH) 阅读提示:Methods中Western blot analysis、Total RNA extraction and quantitative Real-time PCR |
| 功能实验 | CCK-8实验细胞密度(1×10^6)和检测时间点(0、24、48h);免疫荧光染色固定和通透条件 阅读提示:Methods中Cell counting Kit-8 (CCK-8) assay、Immunofluorescence assay |
| 体内实验 | 小鼠品系、性别、周龄(4周龄C57BL/6j雄性);慢病毒注射剂量、频率(每周一次共4周);肌肉收集时间 阅读提示:Methods中Lentiviruses mediated LMOD2 knockdown in skeletal muscles |