体内外检测PD-1表达
验证IBDV感染是否影响PD-1表达
感染SPF鸡和DT-40细胞,检测PD-1 mRNA和蛋白水平,并用免疫荧光观察组织分布。
PD-1 induces autophagy via the PI3K/AKT/FoxO1 pathway to promote infectious bursal disease virus replication.
包含体内动物感染模型、体外细胞实验(DT-40)、Co-IP、Western blot、ELD50、自噬检测及通路抑制剂/激活剂验证,多层次功能与机制验证。
DT-40鸡淋巴样细胞系 SPF鸡体内感染模型 vvIBDV毒株LX
IBDV感染DT-40细胞MOI=1 PD-1过表达(pEGFP-HA-PD-1)或敲低(siPD-1) 自噬调节:饥饿处理或3-MA(5mM)处理 PI3K/AKT通路抑制剂LY294002(10μM)和激活剂SC79(8μM) 检测VP2蛋白表达和IBDV滴度(ELD50)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证IBDV感染是否影响PD-1表达
感染SPF鸡和DT-40细胞,检测PD-1 mRNA和蛋白水平,并用免疫荧光观察组织分布。
确定IBDV哪些蛋白上调PD-1表达
将IBDV VP1-VP5分别克隆至pXJ40-myc载体,转染DT-40细胞后检测PD-1蛋白水平。
探究PD-1是否与病毒蛋白VP2直接结合
共转染PD-1和VP2标签质粒,进行Co-IP和免疫荧光共定位,并检测PD-1对VP2蛋白表达的影响。
评估PD-1在IBDV复制中的作用
过表达或敲低PD-1后感染IBDV,检测VP2表达和病毒滴度。
研究PD-1是否调节自噬
过表达或敲低PD-1,结合饥饿、3-MA处理,检测自噬标志蛋白LC3-II、ATG5、p62。
确认IBDV感染对自噬的影响
感染IBDV后检测自噬标志蛋白。
探究PD-1在IBDV诱导自噬中的作用
过表达或敲低PD-1后感染IBDV,检测自噬蛋白和自噬流。
研究PD-1是否抑制PI3K/AKT通路
过表达或敲低PD-1,检测p-PI3K和p-AKT水平,并使用抑制剂和激活剂处理。
考察PD-1是否影响FoxO1磷酸化
过表达或敲低PD-1,结合FoxO1共转染,检测p-FoxO1水平。
确认PD-1诱导自噬依赖于PI3K/AKT/FoxO1通路
使用SC79或LY294002预处理,结合PD-1过表达或敲低及FoxO1敲低,检测自噬蛋白。
确认该通路在PD-1促进IBDV复制中的必要性
使用通路抑制剂/激活剂处理,结合PD-1过表达或敲低,检测VP2表达和病毒滴度。
评估自噬在PD-1介导的病毒复制中的作用
通过饥饿或3-MA处理调节自噬,结合PD-1过表达,检测VP2和病毒滴度。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 鸡血清 | -- | -- | |
| Western blot | 抗HA小鼠单克隆抗体 | Sangon Biotech | D191044 |
| 抗Myc兔多克隆抗体 | Sangon Biotech | D110006 | |
| 抗β-actin抗体 | Abmart | T40104S | |
| 抗Myc抗体 | Abmart | M20002 | |
| 抗LC3B抗体 | Abmart | T55026 | |
| 抗VP2抗体 | Abmart | M032148S | |
| 抗ATG5抗体 | Abmart | T55766 | |
| 抗磷酸化PI3K抗体 | Abmart | TA4371 | |
| 抗PI3K抗体 | Abmart | TA5121 | |
| 抗p62抗体 | Abmart | P76367R1S | |
| 抗磷酸化AKT抗体 | Abmart | TA0016 | |
| 抗AKT抗体 | Abmart | PA1036 | |
| 辣根过氧化物酶标记抗小鼠/兔IgG | Abmart | -- | |
| 抗FoxO1抗体 | Bioss | bs-9439R | |
| 抗磷酸化FoxO1抗体 | Bioss | bs-3142R | |
| 抗鸡PD-1小鼠单克隆抗体 | -- | -- | |
| 裂解和免疫沉淀 | NP-40裂解液 | Beyotime | P0013F |
| 免疫共沉淀 | 抗HA磁珠 | Beyotime | P2121 |
| 信号通路抑制 | LY294002 | MedChemExpress | HY-10108 |
| 自噬抑制 | 3-甲基腺嘌呤 | MedChemExpress | HY-19312 |
| 信号通路激活 | SC79 | MedChemExpress | HY-18749 |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 蛋白检测 | GE Amersham Imager 600成像系统 | GE | -- |
| 免疫荧光 | DAPI | -- | -- |
| Eclipse C2激光共聚焦扫描显微镜 | Nikon | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与病毒感染 | DT-40细胞使用DMEM+10%FBS+5%鸡血清,37℃和5%CO2。vvIBDV株LX,MOI=1。 阅读提示:Methods 2.1, 2.3 |
| 动物感染 | 3周龄SPF鸡,每只感染200μL 10^5 ELD50 IBDV或PBS,3天后取材。 阅读提示:Methods 2.3 |
| 质粒转染 | 使用Lipofectamine 2000转染2μg质粒,siRNA使用Lipofectamine RNAiMAX,24小时后感染。 阅读提示:Methods 2.5, 2.6 |
| 蛋白检测 | Western blot中使用特异性抗体,稀释比例如anti-HA 1:3000/1:800等。 阅读提示:Methods 2.2, 2.7 |
| 病毒滴度测定 | 使用ELD50测定,将上清稀释后接种9日龄SPF鸡胚,7天后计算。 阅读提示:Methods 2.9 |