构建VP1过表达载体并转染小鼠施万细胞
建立EV71 VP1过表达的细胞模型,以研究VP1对m6A修饰和PMP22表达的影响。
从EV71分离病毒RNA,RT-PCR扩增894-bp VP1片段,克隆至pEGFP-c3载体,经酶切和测序验证。将质粒转染至小鼠施万细胞(80%融合度),24小时后进行后续实验。
Enterovirus 71 structural viral protein 1 promotes the expression of PMP22 through m6A modification in mouse Schwann cells.
包含体外细胞实验,利用过表达、siRNA敲低和抑制剂处理进行功能验证,但缺乏动物模型或患者样本等独立证据层级,且机制验证依赖于m6A相关蛋白表达及PMP22水平检测,未检测m6A修饰直接变化。
小鼠施万细胞(MSCs) EV71 VP1过表达的小鼠施万细胞模型
细胞系:小鼠施万细胞(ScienCell, Cat. #M1700) 过表达质粒:pEGFP-c3+EV71-VP1,转染2 μg质粒,24小时检测mRNA,48小时检测蛋白 siRNA敲低:靶向METTL14和YTHDF1的siRNA,转染后检测敲低效率 3-DZA处理:浓度3.9 μM (Ki),处理72小时 对照组:正常细胞组、空载体(pEGFP-c3)阴性对照组
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立EV71 VP1过表达的细胞模型,以研究VP1对m6A修饰和PMP22表达的影响。
从EV71分离病毒RNA,RT-PCR扩增894-bp VP1片段,克隆至pEGFP-c3载体,经酶切和测序验证。将质粒转染至小鼠施万细胞(80%融合度),24小时后进行后续实验。
探讨VP1过表达对m6A甲基转移酶、去甲基化酶和识别蛋白表达的影响。
通过qRT-PCR和Western blot检测METTL3、METTL14、FTO、ALKBH5、YTHDC1、YTHDF1/2/3的mRNA和蛋白质水平。
验证METTL3/14和YTHDF1/2是否为VP1调控的关键m6A修饰相关基因。
用mRNA甲基化抑制剂3-DZA处理VP1过表达的MSCs,检测METTL3/14和YTHDF1/2的表达变化。
验证METTL14和YTHDF1是否参与VP1诱导的PMP22上调。
将靶向METTL14或YTHDF1的siRNA转染至VP1过表达的MSCs,通过qRT-PCR和Western blot检测敲低效率及PMP22表达变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 小鼠施万细胞 | ScienCell Research Laboratories, Inc. | M1700 |
| 施万细胞培养基 | ScienCell Research Laboratories, Inc. | 1701 | |
| 青霉素-链霉素 | Hyclone Laboratories, Inc. | SH30010 | |
| 多聚赖氨酸 | -- | -- | |
| 磷酸盐缓冲液 | Hyclone Laboratories, Inc. | SH30256.01B | |
| 台盼蓝 | Gibco | 15250061 | |
| RNA提取与逆转录 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | 15596026 |
| 逆转录系统 | Promega corporation | A3800 | |
| PCR扩增 | Takara LA Taq | Takara Bio, Inc. | 2011A |
| 质粒构建 | BamHI限制性内切酶 | Takara | 1010A |
| XhoI限制性内切酶 | Takara | 1094A | |
| pEGFP-c3载体 | Clontech Laboratories, Inc. | -- | |
| 质粒转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc. | 11668500 |
| Opti-MEM I减血清培养基 | Gibco | 31985062 | |
| 基因沉默 | METTL14 siRNA | Santa Cruz Biotechnology, Inc. | -- |
| YTHDF1 siRNA | Santa Cruz Biotechnology, Inc. | -- | |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668019 | |
| Opti-MEM I减血清培养基 | Invitrogen | 31985070 | |
| 药物处理 | 3-脱氮腺苷 | Selleck Chemicals | S0787 |
| qPCR | TaKaRa PrimeScript II 第一链cDNA合成试剂盒 | TaKaRa Bio Inc. | D6210A |
| SYBR Premix Ex Taq II (Perfect Real Time)试剂盒 | TaKaRa Bio Inc. | RR039B | |
| ABI PRISM 7500序列检测系统 | Applied Biosystems | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Millipore | 20-188 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Institute of Biotechnology | P0012 | |
| ECL检测试剂 | GE Healthcare | 28935599 | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab181602 | |
| 肠道病毒71型VP1单克隆抗体 | Thermo Fisher | MA5-33257 | |
| 兔抗METTL14抗体 | Bioss | bs-17608R | |
| 兔抗FTO抗体 | Bioss | bs-7056R | |
| 兔抗ALKBH5抗体 | Bioss | bs-20540R | |
| 重组抗METTL3抗体[EPR18810] | Abcam | ab195352 | |
| 重组抗YTHDF1抗体[EPR22349-16] | Abcam | ab252346 | |
| 重组抗YTHDF2抗体[EPR20318] | Abcam | ab220163 | |
| 重组抗YTHDF3抗体[EPR21912-3] | Abcam | ab220161 | |
| 重组抗YTHDC1抗体[EPR21821] | Abcam | ab220159 | |
| 兔抗小鼠IgG (H+L) | Southern Biotech | 6170-05 | |
| 山羊抗兔IgG (H+L) | Southern Biotech | 4050-05 | |
| 免疫荧光 | 抗PMP22抗体 | Abcam | ab211052 |
| 荧光标记二抗 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | 35510 | |
| DAPI染液 | -- | -- | |
| Leica共聚焦显微镜 | Leica Microsystems | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 小鼠施万细胞(ScienCell #M1700)的培养条件:培养基、添加物、多聚赖氨酸包被浓度、传代数、细胞活力 阅读提示:Materials and methods, 2.2 Cell line and culture |
| 质粒构建与转染 | VP1片段长度、克隆载体、转染质粒量、转染试剂、细胞融合度、检测时间点 阅读提示:Materials and methods, 2.3 Plasmid preparation and transfection for overexpression |
| 基因沉默 | siRNA序列、siRNA ID、转染条件、敲低效率验证 阅读提示:Materials and methods, 2.4 Gene silencing by siRNA;表1 |
| 3-DZA处理 | 3-DZA浓度、处理时间、检测指标 阅读提示:Materials and methods, 2.6 3-DZA treatment of mouse Schwann cells |
| 基因表达检测 | qPCR引物、内参基因、Western blot抗体及稀释比例、上样量 阅读提示:Materials and methods, 2.7 qPCR 和 2.8 Western blot;表2 |