外泌体分离与鉴定
从健康对照和EMs患者血清中分离并验证外泌体特性。
使用快速外泌体提取试剂盒从血清中提取外泌体,通过TEM观察形态,NTA分析粒径,Western blot检测标志蛋白。
Endometriosis-derived exosomes encapsulated miR-196a-5p mediate macrophage polarization through regulation of the Hippo pathway.
研究包含体外细胞实验,包括外泌体分离鉴定、巨噬细胞极化检测、电穿孔修饰、共培养功能实验,以及机制验证(Hippo通路抑制剂),但缺乏体内动物模型实验,且存在部分机制(下游mRNA)未明确。
THP-1细胞来源的巨噬细胞 12Z细胞(永生化人子宫内膜异位症细胞) 人血清来源外泌体(健康对照与EMs患者)
外泌体分离使用快速外泌体提取试剂盒(41202ES30, YEASEN) THP-1细胞用100 ng/mL PMA诱导分化为巨噬细胞 巨噬细胞与外泌体共培养浓度为20 μg/mL,处理24小时 miR-196a-5p mimic电穿孔条件:1000 V, 10 ms, 2 pulses,200 nM mimic与20 μg外泌体 Hippo通路抑制剂XMU-MP-1浓度为1 mM
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从健康对照和EMs患者血清中分离并验证外泌体特性。
使用快速外泌体提取试剂盒从血清中提取外泌体,通过TEM观察形态,NTA分析粒径,Western blot检测标志蛋白。
检测EMs患者来源外泌体能否诱导巨噬细胞M2型极化。
THP-1细胞经PMA诱导分化为巨噬细胞,与外泌体共培养后,通过RT-qPCR、Western blot和流式检测M1/M2标志物。
寻找外泌体中差异表达的miRNA,并筛选关键miRNA。
对两组外泌体进行小RNA测序,分析差异miRNA,并通过RT-qPCR验证关键miRNA。
验证上调外泌体中miR-196a-5p能否逆转M2极化效应。
通过电穿孔将miR-196a-5p mimic导入EMs外泌体,然后处理巨噬细胞,检测miR-196a-5p表达及巨噬细胞极化标志物。
验证EMs外泌体包裹miR-196a-5p激活Hippo通路,并证实通过该通路影响极化。
Western blot检测Hippo通路蛋白,并用抑制剂XMU-MP-1处理巨噬细胞,观察极化变化。
评估不同极化的巨噬细胞对12Z细胞活力和转移能力的影响。
将处理后的巨噬细胞与12Z细胞共培养,进行CCK-8、划痕和Transwell实验。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 外泌体提取 | 快速外泌体提取试剂盒 | YEASEN | 41202ES30 |
| 透射电镜 | Spectra 300 S | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 纳米颗粒追踪分析 | NS300 | Malvern Panalytical | -- |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | YEASEN | 41402ES76 |
| 胎牛血清 | YEASEN | 40131ES76 | |
| 青霉素-链霉素 | YEASEN | 60162ES76 | |
| β-巯基乙醇 | Bioss | C7122 | |
| DMEM/F12培养基 | YEASEN | 41420ES76 | |
| 巨噬细胞诱导 | 佛波酯 | -- | -- |
| Hippo通路抑制 | XMU-MP-1 | Selleck | S8334 |
| 外泌体标记 | PKH26荧光探针 | YEASEN | 40780ES20 |
| 细胞核染色 | DAPI | Beyotime | C1005 |
| 荧光显微镜 | NIB1000 | Novel | -- |
| RNA测序 | Illumina NovaSeq 6000平台 | Illumina | -- |
| 流式固定 | 固定缓冲液 | YEASEN | 40402ES50 |
| 流式分析 | 抗人CD86抗体 | BioLegend | 374210 |
| 抗人CD206抗体 | BioLegend | 321120 | |
| 流式细胞仪 | NovoCyte Advanteon | Agilent | -- |
| 电穿孔 | Neon NxT电穿孔系统 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Neon试剂盒缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | N1025 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | YEASEN | 10606ES60 |
| 逆转录 | 逆转录试剂盒 | Vazyme | R223 |
| RT-qPCR扩增 | SYBR green扩增试剂盒 | Sigma | KCQS00 |
| RT-qPCR仪器 | CFX96TM | Bio-Rad | -- |
| 蛋白提取 | RIPA蛋白裂解缓冲液 | Epizyme | PC101 |
| 蛋白定量 | BCA定量试剂盒 | Epizyme | ZJ101 |
| 蛋白上样缓冲液 | 5×上样缓冲液 | Epizyme | LT103 |
| Western blot | Western blot试剂盒 | Elabscience | E-IR-R304A |
| PVDF膜 | Merck | IPVH00010 | |
| 封闭 | 脱脂牛奶 | Epizyme | PS112 |
| 化学发光 | ECL化学发光试剂 | Epizyme | SQ201 |
| 成像系统 | SCG-W2000 | ServiceBio | -- |
| 共培养系统 | 共培养系统 | Labselect | 14151 |
| CCK-8实验 | CCK-8溶液 | YEASEN | 40203ES60 |
| 酶标仪 | Epoch2 | Biotek | -- |
| 划痕实验 | CKX53 | Olympus | -- |
| 侵袭实验 | 基质胶 | MCE | HY-K6001 |
| 染色 | 结晶紫 | YEASEN | 60506ES60 |
| Western blot(一抗) | 抗Calnexin抗体 | Affinity | AF5362 |
| 抗TSG101抗体 | Affinity | DF8427 | |
| 抗CD63抗体 | Affinity | AF5117 | |
| 抗iNOS抗体 | Affinity | AF0199 | |
| 抗CD86抗体 | Affinity | DF6332 | |
| 抗CD206抗体 | Affinity | DF4149 | |
| 抗CD163抗体 | Affinity | DF8235 | |
| 抗MST1抗体 | CST | 3682 | |
| 抗p-YAP1抗体 | CST | 13008 | |
| 抗YAP1抗体 | CST | 14074 | |
| 抗p-TAZ抗体 | Affinity | AF4315 | |
| 抗TAZ抗体 | CST | 72804 | |
| Western blot(内参) | 抗β-actin抗体 | CST | 4970 |
| Western blot(二抗) | 山羊抗兔IgG HRP | Affinity | S0001 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 外泌体分离与鉴定 | 外泌体提取试剂盒品牌与货号;血清样本量(5 vs 5);TEM、NTA、Western blot参数 阅读提示:参见Materials and Methods 2.2,Figure 1 |
| 巨噬细胞诱导与处理 | THP-1细胞来源与培养条件;PMA浓度(100 ng/mL);外泌体处理浓度(20 μg/mL)和时间(24 h);Hippo抑制剂浓度(1 mM) 阅读提示:参见Materials and Methods 2.3, 2.6 |
| 外泌体电穿孔 | 电穿孔参数(1000V, 10ms, 2pulses);外泌体量(20 μg)和miRNA mimic浓度(200 nM);mimic序列 阅读提示:参见Materials and Methods 2.7,Figure 4 |
| 巨噬细胞极化检测 | RT-qPCR引物序列;Western blot抗体和稀释比;流式抗体(CD86, CD206)及荧光标记;重复次数(三次独立实验) 阅读提示:参见Materials and Methods 2.6, 2.8, 2.9,Table 1, Table 2 |
| 共培养及功能实验 | 共培养系统品牌与货号;细胞接种密度;共培养时间(24h);CCK-8检测条件;划痕实验方法;Transwell侵袭实验基质胶浓度、培养时间 阅读提示:参见Materials and Methods 2.10-2.13,Figure 7 |