外泌体提取与表征
获得稳定的牛奶外泌体并验证其标志物和粒径。
通过差速离心、超速离心和尺寸排阻色谱从牛奶中提取外泌体,并利用Western blot检测标志物(CD63、TSG101、CD9、β-酪蛋白、钙联蛋白),NTA测定粒径和浓度。
Oral Delivery of Ellagic Acid Encapsulated in Milk Exosomes: Sex-Based Differences in Bioavailability, Urolithin Production, and Gut Microbiota Modulation.
包含体外胃肠稳定性实验、大鼠静脉动力学和小鼠口服研究,以及代谢组学、SCFA和菌群分析,但缺乏独立的功能验证实验。
BALB/c小鼠口服模型 Sprague-Dawley大鼠静脉注射模型 牛奶外泌体
口服剂量:0.27 mg EA/kg体重,持续2周 大鼠静脉剂量:40 μM EA(单次) 小鼠分组:CT-EXO、NEA、EXO-EA,每组8只,雌雄各半 样本采集时间点:小鼠第0、2、7、14天粪便,第14天血浆;大鼠3、5、15分钟血浆和脑 体外消化模拟采用INFOGEST方法,评估EXO稳定性和EA释放
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得稳定的牛奶外泌体并验证其标志物和粒径。
通过差速离心、超速离心和尺寸排阻色谱从牛奶中提取外泌体,并利用Western blot检测标志物(CD63、TSG101、CD9、β-酪蛋白、钙联蛋白),NTA测定粒径和浓度。
确定最佳包封条件以最大化外泌体中EA含量。
测试了超声、电穿孔和被动接触等多种方法,最终采用将EA溶解在DMSO中,用乙醇稀释(1:10),然后与外泌体(10%)在室温下被动孵育1小时,再经SEC纯化去除未包封的EA。
评估EXO-EA与NEA在静脉注射后对EA生物利用度和脑分布的影响。
对雌性SD大鼠静脉注射EXO-EA或NEA(40 μM EA),在3、5、15分钟后收集血浆和灌注脑组织,用UPLC-qTOF-MS检测EA浓度。
评估口服EXO-EA与NEA对EA生物利用度、尿石素产生和肠道菌群的影响,并观察性别差异。
BALB/c小鼠(雌雄各半)按组每日口服CT-EXO、NEA或EXO-EA(含185 μM EA,0.27 mg/kg)持续2周,收集粪便(第0、2、7、14天)和血液(第14天),分析EA及代谢物、SCFAs和肠道菌群。
评估EXO-EA在胃肠道中的稳定性。
采用INFOGEST方法模拟体外消化,在不同时间点(口腔、胃、肠阶段)用NTA、WB和UPLC-qTOF-MS分析EXO颗粒数、蛋白标志物和EA含量。
比较不同处理和性别下粪便中短链脂肪酸水平的变化。
用GC-MS检测粪便样本中乙酸、丙酸、异丁酸、丁酸、异戊酸和戊酸等SCFAs,比较基线和第14天的变化。
评估口服处理后小鼠肠道菌群组成的变化,并分析性别差异。
提取粪便DNA,扩增16S rRNA全长基因,使用PacBio Sequel II测序,通过QIIME2和silva数据库进行物种注释,并分析α多样性和β多样性以及差异丰度菌群。
分析不同处理组小鼠血浆代谢物差异,揭示性别相关的代谢变化。
采用UPLC-qTOF-MS进行非靶向代谢组学分析,通过PCA和VIP评分筛选差异代谢物,并使用数据库进行初步鉴定。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 试剂 | 鞣花酸 | Sigma–Aldrich | -- |
| 尿石素A | Dalton Research Molecules | -- | |
| 甲酸 | Panreac | -- | |
| 二甲基亚砜 | Panreac | -- | |
| 甲醇 | Panreac | -- | |
| 磷酸盐缓冲液 | Fisher Scientific | -- | |
| 外泌体表征 | 抗钙联蛋白抗体 | Bethyl | A303-694A |
| 抗CD63抗体 | Bioss | bs-1523R | |
| 抗TSG101抗体 | -- | A303-506A | |
| 抗β-酪蛋白抗体 | Abcam | ab112595 | |
| 抗CD9抗体 | MyBioSource | MBS821978 | |
| 奥德赛红外成像系统 | LI-COR | -- | |
| ZetaView Twin PMX-220 | Particle Metrix | -- | |
| DNA提取 | NucleoSpin组织DNA纯化试剂盒 | Macherey-Nagel | -- |
| DNA质量检测 | NanoDrop | ThermoFisher Scientific | -- |
| DNA定量 | Qubit 3.0 | ThermoFisher Scientific | -- |
| PCR | KAPA Hi-Fi热启动DNA聚合酶 | KAPA Biosystems | -- |
| 测序 | SMRTbell Express模板制备试剂盒2.0 | PacBio | 101-599-700 |
| Sequel II结合试剂盒2.1 | PacBio | -- | |
| Sequel II DNA内部对照复合物1.0 | PacBio | -- | |
| Sequel II测序试剂盒2.0 | PacBio | -- | |
| Qubit HS DNA试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| 代谢组学分析 | Agilent 1290 Infinity液相色谱系统耦合6550 I-Funnel高分辨QTOF | Agilent Technologies | -- |
| Poroshell 120 EC-C18色谱柱 | Agilent | -- | |
| SCFA分析 | Agilent 7890A气相色谱仪联用Agilent 5975C质谱检测器 | Agilent | -- |
| DB-WAXetr色谱柱 | Agilent | -- | |
| 动物实验 | 标准大鼠饲料 | Panlab | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 外泌体提取与表征 | 牛奶来源、纯化方法(差速离心、超速离心、SEC)、NTA参数(激光488 nm,稀释倍数)、Zeta电位测量条件 阅读提示:见实验部分2.2 |
| 鞣花酸包封 | EA溶解于DMSO、乙醇稀释比例、外泌体浓度、孵育时间和温度、SEC纯化条件 阅读提示:见实验部分2.3 |
| 大鼠静脉注射动力学 | 大鼠品系(SD)、性别(雌性)、体重、分组、剂量(40 μM EA)、给药体积(300 μL)、时间点(3、5、15分钟)、样本处理 阅读提示:见实验部分2.4.1 |
| 小鼠口服试验 | 小鼠品系(BALB/c)、性别、周龄、体重、分组(CT-EXO、NEA、EXO-EA)、给药体积(100 μL)、每日剂量(0.27 mg EA/kg)、持续2周、样本收集时间点 阅读提示:见实验部分2.4.2 |
| 体外模拟胃肠消化 | INFOGEST方法细节、消化时间点、NTA/WB/EA分析条件 阅读提示:见实验部分2.6 |
| 代谢组学分析 | UPLC-qTOF-MS参数、色谱柱、流动相、梯度、离子模式、筛选标准(VIP、p值、fold-change) 阅读提示:见实验部分2.7 |
| SCFA分析 | 粪便样本量、酸化试剂、提取溶剂、内标、GC-MS条件 阅读提示:见实验部分2.8 |
| 肠道菌群测序 | DNA提取试剂盒、PCR引物、循环条件、测序平台、文库制备、生物信息学分析流程 阅读提示:见实验部分2.9 |