细胞增殖抑制实验
评估PAE对K562细胞增殖的抑制作用
使用CCK-8法检测PAE对多种肿瘤细胞和正常细胞的细胞毒性,并计算K562细胞的IC50。
Unlocking the Potential of Perillaldehyde: A Novel Mechanism for Chronic Myeloid Leukemia by Targeting HSP70.
该研究包含细胞增殖、凋亡、自噬、线粒体功能、DARTS、分子对接和斑马鱼胚胎毒性等多层次的实验验证,符合“高”完整度标准。
K562细胞系 斑马鱼胚胎
PAE处理浓度0–200 µM,处理时间24-72小时 K562细胞株(BCR-ABL阳性) Z-VAD-fmk预处理浓度(未明确说明) DARTS实验中使用100 µM PAE处理 斑马鱼胚胎分组(n=20)及PAE浓度0-200 µM
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估PAE对K562细胞增殖的抑制作用
使用CCK-8法检测PAE对多种肿瘤细胞和正常细胞的细胞毒性,并计算K562细胞的IC50。
检测PAE对K562细胞周期分布的影响
通过PI染色和流式细胞术分析细胞周期。
验证PAE诱导K562细胞凋亡及其依赖性
通过Western blot检测凋亡相关蛋白,并使用Z-VAD-fmk预处理验证caspase依赖性。
检测PAE对K562细胞自噬的影响
使用MDC染色和Western blot检测自噬相关蛋白。
评估PAE对K562细胞线粒体膜电位和ROS水平的影响
使用JC-1探针检测线粒体膜电位,使用DCFH-DA和Hoechst 33342检测ROS。
验证PAE的分子靶点HSP70及其与BCR-ABL的结合
通过DARTS实验、银染、HPLC-MS/MS和Western blot鉴定PAE靶点;通过免疫共沉淀检测PAE对HSP70与BCR-ABL结合的影响;通过分子对接和分子动力学模拟分析结合模式。
评估PAE对斑马鱼胚胎的毒性作用
将斑马鱼胚胎分为7组,暴露于不同浓度PAE,记录死亡率和畸形率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 紫苏醛 | Solarbio | SP8910 |
| 细胞处理 | Z-VAD-fmk | Shanghai Yuanye Bio-Technology | -- |
| Western blot | Bcl-2抗体 | Bioss | bs-0032R |
| survivin抗体 | Bioss | bs-0615R | |
| cleaved caspase-3抗体 | Bioss | bsm-61090R | |
| caspase-3抗体 | Bioss | bs-0081R | |
| cleaved caspase-9抗体 | Bioss | bs-3082R | |
| caspase-9抗体 | Bioss | bs-0049R | |
| LC3抗体 | Bioss | bs-8878R | |
| p62抗体 | Bioss | bs-51287M | |
| Beclin-1抗体 | Bioss | bs-1353R | |
| AKT抗体 | CST | # 9272S | |
| P-AKT抗体 | CST | # 86758S | |
| BCR-ABL抗体 | CST | # 3908 | |
| p-BCR-ABL抗体 | CST | # 2861 | |
| RPS6-Kb1抗体 | CST | # 34475 | |
| p-RPS6-Kb1抗体 | CST | # 9234 | |
| HSP70抗体 | CST | # 4872 | |
| mTOR抗体 | CST | #2983 | |
| P-mTOR抗体 | CST | #2974 | |
| 细胞周期分析 | 细胞周期检测试剂盒 | Solarbio | CA1510 |
| MDC染色 | Earle平衡盐溶液 | Beyotime | C0213-500 |
| MDC | Yuanye | R22204 | |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1 | Solarbio | M8650 |
| ROS检测 | DCFH-DA | Beyotime | S0033S |
| Hoechst 33342 | Solarbio | C0030 | |
| 免疫共沉淀 | Protein A/G磁珠 | bimake | B23201 |
| 分子动力学模拟 | AMBER 22 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞增殖实验 | 细胞密度(5×10^3细胞/孔)、PAE浓度(0-200 µM)、处理时间(24、48、72小时)、IC50计算 阅读提示:Methods 4.2,Figure 1C,D |
| 细胞周期分析 | 细胞密度(4×10^5细胞/孔)、PAE浓度(0-200 µM)、处理时间(24小时)、PI染色 阅读提示:Methods 4.3,Figure 2A,B |
| 凋亡检测 | PAE浓度(0-200 µM)、处理时间(24小时)、Z-VAD-fmk预处理浓度(未明确说明)及时间(2小时) 阅读提示:Methods 4.1,4.2,Figure 2C-F |
| 自噬检测 | PAE浓度(0-200 µM)、处理时间(24小时)、MDC染色条件(30分钟,37°C) 阅读提示:Methods 4.4,Figure 3 |
| 线粒体功能检测 | PAE浓度(0-200 µM)、处理时间(24小时)、JC-1染色(20分钟,37°C)、DCFH-DA染色(30分钟,37°C) 阅读提示:Methods 4.5,4.6,Figure 4 |
| DARTS实验 | 细胞裂解液浓度(5 μg/μL)、PAE浓度(100 µM)、处理时间(1小时)、pronase E浓度(未明确说明)及消化时间(10分钟) 阅读提示:Methods 4.7,Figure 6A,B |
| 免疫共沉淀 | 抗体(HSP70)、Protein A/G beads体积(未明确说明)、孵育时间(6小时)、洗涤缓冲液(1× PBST) 阅读提示:Methods 4.8,Figure 6C |
| 分子对接与动力学模拟 | PDB ID(6B1N)、结合口袋中心(共结晶配体质心)、盒子体积(20×20×20 Å^3)、模拟时间(未明确说明) 阅读提示:Methods 4.9,Figure 6D-G |
| 斑马鱼胚胎毒性实验 | 斑马鱼品系(AB野生型)、每组胚胎数(n=20)、PAE浓度(0-200 µM)、观察时间点(24-120 hpf)、溶剂对照(1% DMSO) 阅读提示:Methods 4.10,Figure 7,Table 1 |