细胞活力检测
评估靛玉红对SKOV3细胞增殖的抑制作用。
将SKOV3细胞以3×10^3个/孔接种于96孔板,分别用靛玉红、顺铂、阿霉素和紫杉醇的梯度浓度处理,通过MTT和CCK-8法检测细胞活力,计算IC50。
Indirubin induces apoptosis in ovarian cancer cells via the mitochondrial pathway.
实验包含体外细胞活力、凋亡检测、转录组测序及qPCR/Western blot验证,但缺乏动物模型或体内实验验证。
卵巢癌SKOV3细胞系
SKOV3细胞系 靛玉红浓度梯度(0–10 μM) 处理时间(24小时、4小时、6小时) MTT和CCK-8法检测细胞活力 流式细胞术和TUNEL检测凋亡
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估靛玉红对SKOV3细胞增殖的抑制作用。
将SKOV3细胞以3×10^3个/孔接种于96孔板,分别用靛玉红、顺铂、阿霉素和紫杉醇的梯度浓度处理,通过MTT和CCK-8法检测细胞活力,计算IC50。
验证靛玉红是否诱导SKOV3细胞凋亡。
用靛玉红(0、2、5 μM)处理细胞24小时,通过流式细胞术(TUNEL染色)和免疫荧光(Cy3和DAPI染色)检测凋亡细胞比例。
筛选靛玉红处理后差异表达的凋亡相关基因。
SKOV3细胞用10 μmol/L靛玉红处理4小时,提取RNA进行转录组测序,分析凋亡相关基因表达变化。
验证线粒体通透性相关基因的mRNA表达水平。
用靛玉红(0、2、5、10、20 μM)处理细胞24小时,提取RNA,通过qPCR检测CypD、ANT1、VDAC1、VDAC2的表达。
验证线粒体通道相关蛋白的表达水平。
用靛玉红(0、1、2、5、10、20 μM)处理细胞6小时,提取总蛋白,通过Western blot检测CypD、ANT1、VDAC1、VDAC的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 靛玉红 | GLPBIO | GC12975 |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Gibco | -- |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime Biotechnology | C0037 |
| 凋亡检测 | TUNEL凋亡检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | C1089 |
| Western blot | 兔抗VDAC1抗体 | BIOSS | bsm-52251R |
| 兔抗VDAC抗体 | BIOSS | bs-23683R | |
| 兔抗ANT-1抗体 | BIOSS | bs-6794R | |
| 兔抗亲环蛋白40/PPID抗体 | BIOSS | bs-9878R | |
| 兔抗GAPDH抗体 | BIOSS | bsm-52262R | |
| 抗小鼠IgG过氧化物酶结合物 | Zhongshan Jinqiao Biotechnology | ZF-0317 | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | TaKaRa | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞活力检测 | 细胞密度(3×10^3个/孔)、药物浓度梯度(靛玉红0–10 μM)、处理时间(24小时)、检测方法(MTT/CCK-8) 阅读提示:见“CCK-8 cell viability assay and MTT assay”和Figure 1 legend |
| 细胞凋亡检测 | 靛玉红浓度(0、2、5 μM)、处理时间(24小时)、细胞密度(1×10^6个/ml)、染色方法(TUNEL、Cy3/DAPI) 阅读提示:见“Flow cytometry”和“Immunofluorescence”,以及Figure 2和Figure 3 legends |
| 转录组测序 | 靛玉红浓度(10 μmol/L)、处理时间(4小时)、重复数(3个) 阅读提示:见“Transcriptome sequencing”和Figure 4 legend |
| qPCR验证 | 靛玉红浓度(0、2、5、10、20 μM)、处理时间(24小时)、内参基因(β-actin) 阅读提示:见“qRT-PCR”和Table 1,以及Figure 5 legend |
| Western blot验证 | 靛玉红浓度(0、1、2、5、10、20 μM)、处理时间(6小时)、内参蛋白(GAPDH) 阅读提示:见“Western blot analysis”和Figure 6 legend |