验证FcRn对PRRSV感染的影响
检测FcRn是否参与PRRSV感染及具体作用。
通过shRNA敲低PAMs中FCGRT,感染PRRSV-2株FJ、SH和PRRSV-1株SH2022,检测病毒蛋白表达和病毒滴度;过表达猪或猴FCGRT于MARC-145细胞,感染PRRSV FJ后检测病毒蛋白和滴度。
The neonatal Fc receptor (FcRn) is required for porcine reproductive and respiratory syndrome virus uncoating.
包含细胞模型(PAMs、MARC-145、HEK-293T)的基因敲降、过表达、抗体/IgG阻断、CRISPR/Cas9敲除、回补实验,以及吸附、内化、免疫共沉淀、免疫荧光等验证,证据层级多且功能验证充分。
猪肺泡巨噬细胞(PAMs) MARC-145细胞 HEK-293T细胞(用于拯救实验)
FCGRT敲低后PRRSV感染的抑制作用(Western blot和TCID50) FcRn抗体和IgG阻断PRRSV感染(浓度依赖性) FCGRT、B2M、CD163单基因敲除MARC-145细胞对PRRSV感染的抗性 回补FcRn恢复PRRSV增殖(不同物种FCGRT) FcRn与PRRSV N和M蛋白在早期内体中的相互作用(Co-IP)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测FcRn是否参与PRRSV感染及具体作用。
通过shRNA敲低PAMs中FCGRT,感染PRRSV-2株FJ、SH和PRRSV-1株SH2022,检测病毒蛋白表达和病毒滴度;过表达猪或猴FCGRT于MARC-145细胞,感染PRRSV FJ后检测病毒蛋白和滴度。
验证FcRn抗体和IgG能否阻断PRRSV感染。
用FCGRT pAb或B2M mAb预处理MARC-145细胞或PAMs,或用猪、兔、鼠IgG预处理PAMs,然后感染PRRSV FJ,检测病毒N蛋白表达和滴度。
确定FcRn缺失对PRRSV感染的影响。
利用CRISPR/Cas9构建FCGRT-KO、B2M-KO、CD163-KO MARC-145细胞,感染多种PRRSV株,检测CPE、IFA、病毒蛋白和mRNA表达。
验证FcRn特异性回补是否恢复PRRSV感染。
在FCGRT-KO和B2M-KO细胞中表达外源FCGRT和B2M,或表达不同物种FCGRT,感染PRRSV FJ后检测病毒蛋白和滴度。
区分FcRn在PRRSV感染过程中的作用阶段。
使用FCGRT-KO和WT MARC-145细胞进行吸附和内化实验,检测病毒RNA和N蛋白。
确定FcRn与PRRSV蛋白在早期内体中的相互作用。
免疫荧光共定位和免疫共沉淀。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Hyclone | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| RPMI 1640培养基 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| Western blot | 抗FCGRT多克隆抗体 | proteintech | 16190-1-AP |
| 抗B2M单克隆抗体 | proteintech | 66207-1-Ig | |
| 小鼠IgG2b同型对照 | proteintech | 66360-3-Ig | |
| 免疫荧光 | 抗EEA1单克隆抗体 | proteintech | 68065-1-Ig |
| CoraLite647标记的山羊抗小鼠IgG | proteintech | SA00014-10 | |
| Western blot | 抗Cas9多克隆抗体 | ABclonal | A14997 |
| 抗FLAG单克隆抗体 | ABclonal | AE092 | |
| 抗HA单克隆抗体 | ABclonal | AE008 | |
| 抗Myc单克隆抗体 | ABclonal | AE070 | |
| 抗GAPDH单克隆抗体 | ABclonal | AC002 | |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG | ABclonal | AS003 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG | ABclonal | AS014 | |
| 免疫荧光 | ABflo594标记的山羊抗兔IgG | ABclonal | AS039 |
| ABflo594标记的山羊抗小鼠IgG | ABclonal | AS054 | |
| 抗体阻断实验 | 兔IgG同型对照 | ABclonal | AC042 |
| Western blot | 抗CD163单克隆抗体 | GeneTex | GTX42364 |
| 抗PRRSV N蛋白多克隆抗体 | GeneTex | GTX135351 | |
| 抗PRRSV M蛋白多克隆抗体 | GeneTex | GTX129063 | |
| 小鼠抗PRRSV M蛋白单克隆抗体 | GeneTex | GTX634651 | |
| 抗PRRSV GP5多克隆抗体 | GeneTex | GTX129062 | |
| 抗PRRSV GP3多克隆抗体 | GeneTex | GTX129272 | |
| 免疫荧光 | 抗PRRSV nsp1α多克隆抗体 | GeneTex | GTX133695 |
| 抗体阻断实验 | FITC标记的兔抗猪IgG | GeneTex | GTX26773 |
| 猪IgG | Bioss | bs-0309P | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | L3000008 |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Biosharp | BS350A |
| 细胞染色 | DAPI | Solarbio | C0065 |
| 细胞培养 | 嘌呤霉素 | Beyotime | ST551 |
| 筛选 | 潮霉素B | Beyotime | ST1389 |
| 细胞培养 | 0.45µm过滤器 | Millipore | -- |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| RT-qPCR | PrimeScript反转录试剂盒 | TaKaRa | -- |
| SYBR Green染料 | TaKaRa | -- | |
| CFX96实时荧光定量PCR仪 | BIO-RAD | -- | |
| Western blot | SDS-PAGE凝胶 | EpiZyme | -- |
| ECL化学发光试剂盒 | ABclonal | RM00021 | |
| ChemiDoc XRS+凝胶成像系统 | BIO-RAD | -- | |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A/G磁珠 | Selleck | B23201 |
| 荧光检测 | 酶标仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 显微镜 | 共聚焦激光扫描显微镜 | Carl Zeiss AG | LSM800 |
| 免疫荧光 | 倒置显微镜 | Olympus | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与病毒接种 | 细胞类型、培养基、病毒株、MOI、感染时间 阅读提示:Materials and Methods - Cells and viruses; 图1-3图注 |
| FCGRT敲低 | shRNA序列、敲低验证时间、PRRSV感染时间 阅读提示:Materials and Methods - shRNA-mediated FcRn knockdown; 图1A-B图注 |
| FcRn过表达 | 质粒、转染时间、MOI、检测时间点 阅读提示:Materials and Methods - FcRn overexpression; 图1F-I图注 |
| 抗体/IgG阻断 | 抗体类型、浓度、预处理时间、感染时间 阅读提示:Materials and Methods - Antibodies and IgG blocking assay; 图2图注 |
| 基因敲除 | sgRNA序列、敲除验证、MOI、检测时间 阅读提示:Materials and Methods - Knockout cell lines establishment; 图3图注 |
| 回补实验 | 表达载体、筛选浓度和时长、MOI、检测时间 阅读提示:Materials and Methods - Construction of complemented cell lines; 图4图注 |
| 吸附和内化实验 | 低温吸附温度和时间、内化时间和温度、MOI 阅读提示:Materials and Methods - Virus attachment and internalization assays; 图5A-D图注 |
| 免疫共沉淀 | 感染MOI、裂解缓冲液pH、抗体和磁珠 阅读提示:Materials and Methods - Co-immunoprecipitation; 图6C-D图注 |