高通量筛选抗HCC化合物
从1444种生物活性化合物中筛选出能显著抑制HCC细胞增殖的候选药物。
使用CCK8和LDH释放实验在Hep3B细胞中进行初筛和复筛,评估化合物对细胞存活率的影响,最终确定DIG为候选药物。
Digoxigenin activates autophagy in hepatocellular carcinoma cells by regulating the PI3K/AKT/mTOR pathway.
包含体外细胞实验(CCK8、LDH、集落形成、划痕、透射电镜、Western blot、免疫荧光)、体内裸鼠移植瘤实验、网络药理学和分子对接,并进行了功能验证(自噬抑制剂3MA)和机制验证(mTOR抑制剂Rapa)。
Hep3B人肝癌细胞系 Huh7人肝癌细胞系 BALB/c裸鼠皮下移植瘤模型
DIG浓度(1-10 µM)和处理时间(24-48 h)对细胞增殖的影响 自噬抑制剂3MA(1 mM)对DIG诱导细胞死亡和自噬的逆转作用 mTOR抑制剂雷帕霉素(1 µM)对DIG诱导自噬和通路蛋白磷酸化的增强作用 体内实验中DIG剂量(2.8 mg/kg/天)、3MA(24 mg/kg/天)和Rapa(2 mg/kg/天)的腹腔注射给药方案 肿瘤体积和体重的测量时间(每日)及处理持续时间(10天)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从1444种生物活性化合物中筛选出能显著抑制HCC细胞增殖的候选药物。
使用CCK8和LDH释放实验在Hep3B细胞中进行初筛和复筛,评估化合物对细胞存活率的影响,最终确定DIG为候选药物。
验证DIG对HCC细胞增殖、集落形成和迁移能力的抑制作用。
使用CCK8、集落形成、划痕实验和Western blot检测迁移相关蛋白(RHOA、RAC1)表达,评估DIG处理的效果。
确定DIG是否通过诱导自噬导致HCC细胞死亡。
通过透射电镜观察自噬体形成,Western blot检测LC3B和p62表达,免疫荧光检测LC3B斑块,并使用自噬抑制剂3MA和Baf-A1进行处理。
探索DIG抑制HCC的潜在分子机制,特别是PI3K/AKT/mTOR通路。
通过网络药理学预测DIG的靶点,KEGG富集分析;Western blot检测通路蛋白磷酸化水平;RT-qPCR检测mRNA水平;分子对接分析DIG与PI3K、AKT、mTOR的结合能力。
通过mTOR抑制剂雷帕霉素验证DIG是否通过抑制mTOR通路诱导自噬。
使用雷帕霉素预处理HCC细胞,CCK8检测细胞存活率,免疫荧光检测LC3B,Western blot检测通路蛋白和自噬蛋白表达。
评估DIG在体内对HCC移植瘤生长的抑制作用及对肝脏功能的影响。
在BALB/c裸鼠皮下接种Huh7细胞建立移植瘤模型,腹腔注射DIG、DIG+3MA、DIG+Rapa或生理盐水,连续10天,测量肿瘤体积和体重,检测血清ALT/AST,并通过H&E染色和免疫组化分析肿瘤组织。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 3-甲基腺嘌呤 | Selleck Chemicals | S2767 |
| Ac DEVD CHO | Selleck Chemicals | S7901 | |
| 巴佛洛霉素A1 | Meilunbio | MB5505-L | |
| 铁死亡抑制剂-1 | MedChem Express | HY-100579 | |
| 雷帕霉素 | MedChem Express | AY-22989 | |
| 细胞培养 | DMEM高糖培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | -- | |
| RPMI-1640培养基 | Gibco | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK8试剂 | Beyotime | C0043 |
| LDH检测 | LDH细胞毒性检测试剂盒 | Beyotime | C0017 |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒 | Elabscience | E-CK-A211 |
| 免疫荧光 | Cy3标记的山羊抗兔IgG | Invitrogen | A-10520 |
| DAPI即用型溶液 | Sorabio | C0065 | |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | Thermo Scientific | 89900 |
| BCA蛋白检测试剂盒 | Thermo Scientific | 23277 | |
| ChemiDoc MP成像系统 | BIO-RAD | -- | |
| 超灵敏电化学发光液 | Millipore Sigma | WBKLS0500 | |
| RT-qPCR | AGRNAex RNA提取试剂 | Accurate Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| 逆转录试剂盒 | Jiangsu Accuracy Biotechnology Co., Ltd. | AG11728 | |
| SYBR预混试剂盒 | Jiangsu Accuracy Biotechnology Co., Ltd. | AG11718 | |
| 免疫组化 | 柠檬酸溶液 | Beyotime Institute of Biotechnology | P0086 |
| 二抗 | MXB Biotechnologies | KIT5020 | |
| DAB显色液 | MXB Biotechnology Co., Ltd. | DAB-0031 | |
| 血清ALT/AST检测 | ALT检测试剂盒 | Jiancheng Bioengineering Institute | C00921 |
| AST检测试剂盒 | Jiancheng Bioengineering Institute | C01021 | |
| 抗体(Western blot, 免疫荧光, 免疫组化) | LC3I/II抗体 | Sigma-Aldrich | L7543 |
| 抗体(Western blot) | p62抗体 | Sigma-Aldrich | P0068 |
| AKT抗体 | ImmunoWay | YT0185 | |
| p-AKT (Ser473)抗体 | ImmunoWay | YP0006 | |
| p-70S6K (Tr389)抗体 | ImmunoWay | YP1427 | |
| PI3K抗体 | Cell Signaling Technology | 4249T | |
| p-mTOR (Ser2448)抗体 | Cell Signaling Technology | 2971 | |
| mTOR抗体 | Cell Signaling Technology | 2983T | |
| LC3I/II抗体 | Cell Signaling Technology | 2775 | |
| GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 14C10 | |
| p-PI3K抗体 | Bioss | bs-6417R | |
| Rac1抗体 | Servicebio | GB11621 | |
| RHOA抗体 | Proteintech | 10749-1-AP | |
| 免疫荧光 | 山羊抗兔IgG (H+L)交叉吸附二抗 | Invitrogen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 培养基类型:Hep3B、Huh7、HCCLM3、HepG2使用DMEM高糖培养基;AML-12使用专用培养基;MIHA使用RPMI-1640。所有培养基补充10%胎牛血清和1%青霉素/链霉素。 阅读提示:见Materials and methods: Cell culture |
| 药物处理 | DIG浓度范围1-10 µM,处理时间24-48 h;3MA预处理浓度1 mM,预处理时间1 h;Rapa预处理浓度1 µM,预处理时间1 h。 阅读提示:见Materials and methods: Cell viability assay 和 Results |
| 体外细胞增殖检测 | 细胞接种密度:CCK8和LDH为1×10^4细胞/孔(96孔板);集落形成500细胞/孔(6孔板);划痕实验4×10^5细胞/孔(6孔板)。 阅读提示:见Materials and methods: Cell viability assay, LDH assay, Colony formation assay, Cell scratch test |
| 自噬检测 | 透射电镜:DIG浓度2 µM,处理48 h;3MA预处理浓度1 mM,时间1 h;免疫荧光:LC3抗体稀释1:200;Western blot检测LC3B和p62。 阅读提示:见Materials and methods: Transmission electron microscopy, Immunofluorescence, Western blot |
| 通路检测 | Western blot检测p-PI3K、p-AKT、p-mTOR、p-p70S6K,DIG浓度2 µM处理48 h;RT-qPCR检测PIK3CA、AKT1、mTOR mRNA水平。 阅读提示:见Materials and methods: Western blot, RT-qPCR; Results: 图4 |
| 体内动物实验 | BALB/c裸鼠(4周龄,雄性),皮下接种Huh7细胞1×10^7;分组:对照组(0.9% NaCl)、DIG(2.8 mg/kg/天)、DIG+3MA(24 mg/kg/天)、DIG+Rapa(2 mg/kg/天);腹腔注射,连续10天;每组6只。 阅读提示:见Materials and methods: 使用裸鼠模型作为肿瘤和给药 |