建立和验证EMT模型
验证TGF-β1能否诱导BEAS-2B细胞发生上皮间质转化
使用TGF-β1处理BEAS-2B细胞,通过免疫荧光和Western blot检测EMT标志蛋白(E-cadherin、N-cadherin、vimentin、α-SMA)的表达变化以验证模型建立。
Inhibition of long non-coding RNA NEAT1 suppressed the epithelial mesenchymal transition through the miR-204-5p/Six1 axis in asthma.
体外细胞模型建立与验证、功能实验(增殖凋亡)、机制实验(双荧光素酶报告基因)明确,但缺少体内动物模型验证。
BEAS-2B人支气管上皮细胞系 TGF-β1诱导的EMT细胞模型
BEAS-2B细胞系来源:X-Y Biotechnology(中国) EMT诱导条件:10 ng/ml TGF-β1处理48小时 NEAT1敲低效率验证:siRNA3有效降低NEAT1表达 细胞增殖检测:CCK-8实验,450 nm吸光度 细胞凋亡检测:Annexin V-FITC/PI双染,流式细胞术
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证TGF-β1能否诱导BEAS-2B细胞发生上皮间质转化
使用TGF-β1处理BEAS-2B细胞,通过免疫荧光和Western blot检测EMT标志蛋白(E-cadherin、N-cadherin、vimentin、α-SMA)的表达变化以验证模型建立。
评估在EMT过程中NEAT1、miR-204-5p和Six1的表达水平变化
通过RT-qPCR检测TGF-β1处理组与对照组中NEAT1、miR-204-5p和Six1的mRNA表达水平。
探究抑制NEAT1表达对EMT过程及细胞增殖、凋亡的影响
将siRNA(NEAT1-siRNA1/2/3)转染至BEAS-2B细胞,筛选最有效的siRNA3;随后在TGF-β1诱导的EMT模型中敲低NEAT1,通过CCK-8、流式细胞术检测细胞增殖、周期和凋亡,并通过Western blot检测EMT标志蛋白及Six1的表达。
确认NEAT1作为miR-204-5p海绵以及Six1作为miR-204-5p直接靶标的分子机制
使用双荧光素酶报告基因实验,将野生型或突变型NEAT1载体与miR-204-5p mimics或NC共转染,以及野生型或突变型Six1载体与miR-204-5p mimics或NC共转染,检测荧光素酶活性变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | NoninBio | C3113-0500 |
| 胎牛血清 | Gibco | 10270-106 | |
| 青霉素-链霉素 | Solarbio | P1400 | |
| 细胞处理 | 转化生长因子-β1 | MCE | HY-P7118 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Solarbio | R0010 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Solarbio | PC0020 | |
| PVDF膜 | Millipore | ISEQ00010 | |
| 脱脂牛奶 | Solarbio | D8340 | |
| E-钙黏蛋白抗体 | Bioss | bs-1519R | |
| N-钙黏蛋白抗体 | Abclonal | A19083 | |
| 波形蛋白抗体 | Abclonal | A19607 | |
| α-平滑肌肌动蛋白抗体 | Bioss | bsm-52396R | |
| β-肌动蛋白抗体 | Huabio | EM21002 | |
| TBS缓冲液 | Boster | AR0031 | |
| 吐温-20 | Solarbio | T8220 | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔IgG | Bioss | K008 | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗小鼠IgG | Bioss | K009 | |
| ECL化学发光试剂 | NCM Biotech | P10300 | |
| 免疫荧光 | 曲拉通X-100 | Solarbio | T8200 |
| 正常山羊血清 | Boster | AR0009 | |
| 488山羊抗兔IgG | Bioss | bs-0295G-FITC | |
| DAPI染色液 | Solarbio | C0065 | |
| RT-qPCR | Trizol试剂 | Invitrogen | 10296028 |
| Superscript III逆转录试剂盒 | Invitrogen | 18080051 | |
| SYBR荧光定量PCR Mix | Invitrogen | 4472920 | |
| 细胞转染 | Lipo2000转染试剂 | Life Technologies | 11668019 |
| 细胞增殖分析 | CCK-8溶液 | -- | -- |
| 流式细胞术 | 细胞周期分析试剂盒 | 4A Biotech | FXP021 |
| Annexin V-FITC | -- | -- | |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 荧光素酶报告基因实验 | 萤火虫荧光素酶反应液 | Biomed | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和EMT模型建立 | 细胞系,TGF-β1浓度,处理时间 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatment |
| Western blot | 抗体稀释比例,蛋白上样量,电泳条件,封闭条件 阅读提示:Materials and methods: Western blot |
| 免疫荧光 | 抗体稀释比例,孵育时间,荧光显微镜型号 阅读提示:Materials and methods: Immunofluorescence |
| RNA提取和RT-qPCR | 逆转录条件,PCR循环参数,引物序列 阅读提示:Materials and methods: RNA extraction and RT-qPCR |
| 细胞增殖分析 | 细胞接种密度,CCK-8孵育时间,检测波长 阅读提示:Materials and methods: Cell proliferation analysis |
| 细胞凋亡检测 | 细胞数量,Annexin V和PI用量,孵育时间 阅读提示:Materials and methods: Flow-cytometric analysis |
| 双荧光素酶报告基因实验 | 共转染质粒种类,转染试剂用量,检测时间 阅读提示:Materials and methods: Luciferase reporter assay |