抑制长链非编码RNA NEAT1通过miR-204-5p/Six1轴抑制哮喘中的上皮间质转化

Inhibition of long non-coding RNA NEAT1 suppressed the epithelial mesenchymal transition through the miR-204-5p/Six1 axis in asthma.

作者信息Lei Li, Guoju Li, Renzheng Guan, Hui Ma, Quansheng Xing
PMID39423195
期刊PLoS One
发布时间2024-10-18
DOI10.1371/journal.pone.0312020

实验完整度

体外细胞模型建立与验证、功能实验(增殖凋亡)、机制实验(双荧光素酶报告基因)明确,但缺少体内动物模型验证。

主要模型

BEAS-2B人支气管上皮细胞系 TGF-β1诱导的EMT细胞模型

重点核对

BEAS-2B细胞系来源:X-Y Biotechnology(中国) EMT诱导条件:10 ng/ml TGF-β1处理48小时 NEAT1敲低效率验证:siRNA3有效降低NEAT1表达 细胞增殖检测:CCK-8实验,450 nm吸光度 细胞凋亡检测:Annexin V-FITC/PI双染,流式细胞术

摘要

背景:哮喘是一种常见的慢性呼吸系统疾病,其特征是气道重塑。长链非编码RNA(lncRNA)NEAT1已被证明参与气道纤维化。此外,miR-204-5p/Six1轴显著影响上皮间质转化(EMT)。然而,NEAT1/miR-204-5p/Six1在哮喘EMT中的功能仍不清楚。目的:本研究旨在阐明NEAT1/miR-204-5p/Six1轴在哮喘EMT中的作用。方法:使用TGF-β1诱导BEAS-2B细胞EMT模型。通过免疫荧光和蛋白质印迹验证EMT模型的建立。使用RT-qPCR评估NEAT1、miR-204-5p和Six1的表达水平。通过CCK8实验和流式细胞术探讨NEAT1在体外EMT中的作用。进行荧光素酶报告基因实验以验证NEAT1与miR-204-5p/Six1之间的相互作用。结果:在EMT期间NEAT1表达增加。功能实验表明,敲低NEAT1在体外抑制细胞增殖并促进细胞凋亡。此外,抑制NEAT1降低了N-钙黏蛋白、波形蛋白和α-SMA的表达,并增加了E-钙黏蛋白的表达。机制上,NEAT1被确定为miR-204-5p的海绵,而Six1被发现是miR-204-5p的直接靶标。结论:下调NEAT1通过靶向miR-204-5p降低Six1表达,从而抑制哮喘中的EMT过程。本研究可能为揭示哮喘的潜在机制提供新的见解。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
NEAT1/miR-204-5p/Six1轴在哮喘相关上皮间质转化(EMT)中是否发挥作用及其机制是什么?
核心机制
下调NEAT1通过靶向miR-204-5p降低Six1表达,从而抑制哮喘中的EMT过程。
主要证据
在TGF-β1诱导的BEAS-2B细胞EMT模型中,敲低NEAT1后细胞增殖下降、凋亡增加,EMT标志物表达改变(E-cadherin升高,N-cadherin、vimentin、α-SMA降低),双荧光素酶报告基因证实NEAT1与miR-204-5p结合且Six1是miR-204-5p的靶标。
研究意义
本研究可能为揭示哮喘的潜在机制提供新的见解,并为哮喘患者提供新的治疗靶点。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

建立和验证EMT模型

验证TGF-β1能否诱导BEAS-2B细胞发生上皮间质转化

使用TGF-β1处理BEAS-2B细胞,通过免疫荧光和Western blot检测EMT标志蛋白(E-cadherin、N-cadherin、vimentin、α-SMA)的表达变化以验证模型建立。

2

检测NEAT1、miR-204-5p和Six1在EMT模型中的表达

评估在EMT过程中NEAT1、miR-204-5p和Six1的表达水平变化

通过RT-qPCR检测TGF-β1处理组与对照组中NEAT1、miR-204-5p和Six1的mRNA表达水平。

3

敲低NEAT1后观察对EMT和细胞功能的影响

探究抑制NEAT1表达对EMT过程及细胞增殖、凋亡的影响

将siRNA(NEAT1-siRNA1/2/3)转染至BEAS-2B细胞,筛选最有效的siRNA3;随后在TGF-β1诱导的EMT模型中敲低NEAT1,通过CCK-8、流式细胞术检测细胞增殖、周期和凋亡,并通过Western blot检测EMT标志蛋白及Six1的表达。

4

验证NEAT1与miR-204-5p/Six1的靶向关系

确认NEAT1作为miR-204-5p海绵以及Six1作为miR-204-5p直接靶标的分子机制

使用双荧光素酶报告基因实验,将野生型或突变型NEAT1载体与miR-204-5p mimics或NC共转染,以及野生型或突变型Six1载体与miR-204-5p mimics或NC共转染,检测荧光素酶活性变化。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

验证样本或模型特征
验证分子表达变化
验证细胞功能变化

产品清单

实验环节名称品牌货号
杜氏改良Eagle培养基NoninBioC3113-0500
胎牛血清Gibco10270-106
青霉素-链霉素SolarbioP1400
转化生长因子-β1MCEHY-P7118
RIPA裂解液SolarbioR0010
BCA蛋白定量试剂盒SolarbioPC0020
PVDF膜MilliporeISEQ00010
脱脂牛奶SolarbioD8340
E-钙黏蛋白抗体Biossbs-1519R
N-钙黏蛋白抗体AbclonalA19083
波形蛋白抗体AbclonalA19607
α-平滑肌肌动蛋白抗体Biossbsm-52396R
β-肌动蛋白抗体HuabioEM21002
TBS缓冲液BosterAR0031
吐温-20SolarbioT8220
辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔IgGBiossK008
辣根过氧化物酶标记的山羊抗小鼠IgGBiossK009
ECL化学发光试剂NCM BiotechP10300
曲拉通X-100SolarbioT8200
正常山羊血清BosterAR0009
488山羊抗兔IgGBiossbs-0295G-FITC
DAPI染色液SolarbioC0065
Trizol试剂Invitrogen10296028
Superscript III逆转录试剂盒Invitrogen18080051
SYBR荧光定量PCR MixInvitrogen4472920
Lipo2000转染试剂Life Technologies11668019
CCK-8溶液----
细胞周期分析试剂盒4A BiotechFXP021
Annexin V-FITC----
碘化丙啶----
萤火虫荧光素酶反应液Biomed--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞培养和EMT模型建立
细胞系,TGF-β1浓度,处理时间
阅读提示:Materials and methods: Cell culture and treatment
Western blot
抗体稀释比例,蛋白上样量,电泳条件,封闭条件
阅读提示:Materials and methods: Western blot
免疫荧光
抗体稀释比例,孵育时间,荧光显微镜型号
阅读提示:Materials and methods: Immunofluorescence
RNA提取和RT-qPCR
逆转录条件,PCR循环参数,引物序列
阅读提示:Materials and methods: RNA extraction and RT-qPCR
细胞增殖分析
细胞接种密度,CCK-8孵育时间,检测波长
阅读提示:Materials and methods: Cell proliferation analysis
细胞凋亡检测
细胞数量,Annexin V和PI用量,孵育时间
阅读提示:Materials and methods: Flow-cytometric analysis
双荧光素酶报告基因实验
共转染质粒种类,转染试剂用量,检测时间
阅读提示:Materials and methods: Luciferase reporter assay