PDCD4过表达和沉默的细胞模型建立
验证oePDCD4和siPDCD4能否有效调节HL-1细胞中PDCD4的表达。
将oeNC、oePDCD4、siNC和siPDCD4(三种siRNA)转染至HL-1细胞,48小时后通过RT-qPCR和Western blot检测PDCD4表达。
PDCD4 promotes inflammation/fibrosis by activating the PPAR‑γ/NF‑κB pathway in mouse atrial myocytes.
体外细胞实验,包括过表达/沉默、药物干预、蛋白和细胞因子检测,但缺少体内模型和机制验证的独立性。
小鼠心房肌细胞HL-1细胞
PDCD4过表达和沉默的验证(RT-qPCR和Western blot) 药物浓度筛选(CCK-8法确定Pio 10 µM,CBL0137 0.25 µM,GW9662 10 µM,betulinic acid 20 µM) 纤维化蛋白和炎症因子检测(Western blot和ELISA) NF-κB p65磷酸化及核转位检测(Western blot和免疫荧光)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证oePDCD4和siPDCD4能否有效调节HL-1细胞中PDCD4的表达。
将oeNC、oePDCD4、siNC和siPDCD4(三种siRNA)转染至HL-1细胞,48小时后通过RT-qPCR和Western blot检测PDCD4表达。
确定PPARγ激动剂、NF-κB抑制剂、PPARγ抑制剂和NF-κB激动剂的无明显毒性浓度,用于后续干预实验。
HL-1细胞用不同浓度Pio、CBL0137、GW9962和betulinic acid处理24小时,CCK-8法检测细胞活力。
检测PDCD4过表达或沉默对HL-1细胞纤维化和炎症因子表达的影响。
收集转染和药物处理后的细胞,Western blot检测纤维化蛋白,ELISA检测炎症因子。
验证PDCD4是否通过PPARγ和NF-κB通路调节炎症和纤维化。
oePDCD4-HL-1细胞用PPARγ激动剂(Pio)和NF-κB抑制剂(CBL0137)处理,siPDCD4-HL-1细胞用PPARγ抑制剂(GW9962)和NF-κB激动剂(betulinic acid)处理,检测纤维化和炎症因子的变化。
观察PDCD4对NF-κB p65磷酸化和核转位的影响,以及药物干预的逆转作用。
通过Western blot检测核/质分离蛋白中p-p65/p65和p-p50/PCNA的比值,免疫荧光检测p-p65表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 最低必需培养基 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| 链霉素/青霉素 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| pcDNA3.1 | GenScript | -- | |
| 小干扰RNA | Guangzhou RiboBio Co., Ltd. | -- | |
| 脂质体2000 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| 药物处理 | 盐酸吡格列酮 | MedChemExpress | HY-14601 |
| CBL0137 | MedChemExpress | HY-18935A | |
| GW9962 | Merck KGaA | M6191-5MG | |
| 桦木酸 | MedChemExpress | HY-10529 | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| RevertAid第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| 2X SYBR-Green qPCR预混液 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| Western blotting | NE-PER核和胞质提取试剂 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| RIPA裂解液 | Beijing Solarbio Science & Technology Co., Ltd. | -- | |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche Diagnostics | -- | |
| BCA蛋白浓度测定试剂盒 | Biosharp Life Sciences | -- | |
| PVDF膜 | MilliporeSigma | -- | |
| PDCD4抗体 | BIOSS | bs-1608R | |
| I型胶原抗体 | Affinity Biosciences | AF7001 | |
| III型胶原抗体 | Affinity Biosciences | AF0136 | |
| 纤连蛋白抗体 | BIOSS | bs-13455R | |
| α-平滑肌肌动蛋白抗体 | BIOSS | bsm-33187M | |
| 基质金属蛋白酶2抗体 | Affinity Biosciences | AF0577 | |
| PPARγ抗体 | BIOSS | bs-0530R | |
| NF-κB p65抗体 | BIOSS | bs-0465R | |
| NF-κB磷酸化p65抗体 | BIOSS | bs-0982R | |
| NF-κB p50抗体 | BIOSS | bs-1194R | |
| 增殖细胞核抗原抗体 | Proteintech Group, Inc. | 10205-2-AP | |
| GAPDH抗体 | Proteintech Group, Inc. | 60004-1-Ig | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔二抗 | Beyotime Institute of Biotechnology | A0208 | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗小鼠二抗 | Beyotime Institute of Biotechnology | A0216 | |
| ECL发光液 | Beijing Dingguo Changsheng Biotechnology Co., Ltd. | -- | |
| CCK-8 assay | CCK-8试剂盒 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- |
| ELISA | 小鼠IFN-γ ELISA试剂盒 | Suzhou ExCell Biotechnology Co., Ltd. | EM007 |
| 小鼠IL-4 ELISA试剂盒 | Suzhou ExCell Biotechnology Co., Ltd. | EM003 | |
| 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | Suzhou ExCell Biotechnology Co., Ltd. | EM004 | |
| 小鼠IL-17A ELISA试剂盒 | Suzhou ExCell Biotechnology Co., Ltd. | EM015 | |
| 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | Suzhou ExCell Biotechnology Co., Ltd. | EM008 | |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 488标记的山羊抗兔IgG(H+L)二抗 | Beyotime Institute of Biotechnology | A0423 |
| Alexa Fluor 555标记的驴抗兔IgG(H+L)二抗 | Beyotime Institute of Biotechnology | A0453 | |
| Hoechst 33342 | MilliporeSigma | 875756-97-1 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | HL-1细胞培养条件:培养基、血清浓度、抗生素、37°C、5% CO2 阅读提示:Materials and methods, Cells, cell culture, transfection and treatment |
| 转染 | oePDCD4质粒剂量2 µg,siRNA浓度10 nM,转染时间48 h 阅读提示:Materials and methods, Cells, cell culture, transfection and treatment |
| 药物处理 | Pio 10 µM,CBL0137 0.25 µM,GW9962 10 µM,betulinic acid 20 µM,处理24 h 阅读提示:Results, Viability of HL-1 cells treated with Pio, CBL0137, GW9662 and betulinic acid |
| Western blotting | 蛋白上样量15 µg/lane,一抗稀释比例1:1000,二抗稀释比例1:1000,内参GAPDH和PCNA 阅读提示:Materials and methods, Western blot analysis |
| RT-qPCR | 引物序列,循环条件:94°C 10 min; 94°C 20 s, 55°C 20 s, 72°C 20 s共40个循环; 使用2-ΔΔCq方法 阅读提示:Materials and methods, RT-qPCR |
| 免疫荧光 | 细胞固定4%多聚甲醛15 min,5% FBS封闭2 h,一抗1:1000,二抗1:1000,Hoechst 33342染色15 min 阅读提示:Materials and methods, Immunofluorescence analysis |