验证LKB1在PEL细胞中的激活及其机制
确定KSHV阳性PEL细胞中LKB1是否被激活,并鉴定介导LKB1激活的病毒基因。
通过免疫印迹比较PEL细胞系(BC3、BCBL1、BCP1)和KSHV阴性细胞系(DG75、BJAB)中pLKB1-S428和pAMPKα-T174水平;在BJAB细胞中过表达一系列KSHV基因,筛选能激活LKB1的基因;在BC3细胞中敲除vCyclin并回补,检测LKB1磷酸化。
LKB1 suppresses KSHV reactivation and promotes primary effusion lymphoma progression.
包含细胞系模型(PEL和Burkitt淋巴瘤)、基因敲除/敲低、药理抑制、体外功能实验及异种移植小鼠模型等多层级验证。
KSHV阳性PEL细胞系(BC3、BCBL1、BCP1) KSHV阴性Burkitt淋巴瘤细胞系(DG75、BJAB) NOD/SCID小鼠异种移植PEL模型
PEL细胞系为BC3、BCBL1、BCP1;KSHV阴性对照为DG75和BJAB LKB1和AMPK敲低使用慢病毒介导的shRNA,转导后3天检测 Compound C浓度:0、1、5、10 µM,处理72小时 动物实验中NOD/SCID小鼠腹腔注射1×10^7 BCBL1-Luc细胞,Compound C剂量10 mg/kg每日两次 KSHV再激活检测指标:裂解基因RTA、ORF65、ORFK8、ORF57、ORF59、PAN RNA,及病毒粒子产生
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定KSHV阳性PEL细胞中LKB1是否被激活,并鉴定介导LKB1激活的病毒基因。
通过免疫印迹比较PEL细胞系(BC3、BCBL1、BCP1)和KSHV阴性细胞系(DG75、BJAB)中pLKB1-S428和pAMPKα-T174水平;在BJAB细胞中过表达一系列KSHV基因,筛选能激活LKB1的基因;在BC3细胞中敲除vCyclin并回补,检测LKB1磷酸化。
探究LKB1是否对PEL细胞增殖和存活至关重要。
用慢病毒介导的shRNA敲低LKB1,检测PEL和KSHV阴性细胞系的增殖曲线、死细胞比例、凋亡细胞比例及c-caspase 3表达。
验证AMPK作为LKB1下游效应分子,其缺失是否模拟LKB1敲低表型。
用shRNA敲低AMPKα1,检测细胞增殖、死亡、凋亡及c-caspase 3表达。
评估药理抑制AMPK对PEL细胞增殖和存活的影响。
用不同浓度Compound C处理PEL和DG75细胞,检测pAMPKα水平、增殖、死细胞比例、IC50、凋亡和c-caspase 3表达。
确定LKB1是否维持KSHV潜伏期。
在PEL细胞中敲低LKB1,通过RT-qPCR检测裂解基因(RTA、ORF65、ORFK8等)mRNA,免疫印迹和免疫荧光检测ORFK8蛋白,并定量上清中病毒粒子。
验证AMPK在维持KSHV潜伏中的作用。
在PEL细胞中敲低AMPK或Compound C处理,检测裂解基因表达、ORFK8蛋白和病毒粒子。
评估AMPK抑制剂在异种移植小鼠模型中对PEL生长的治疗效果。
建立NOD/SCID小鼠腹腔注射BCBL1-Luc细胞模型,用Compound C或载体处理,通过活体成像监测肿瘤负担,并测量腹水量和脾脏大小。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI1640培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | ExCell | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| Western blot | LKB1抗体 | Bioss | bs-3948R |
| p-LKB1-S428抗体 | Cell Signaling Technology | 3482S | |
| AMPKα抗体 | Cell Signaling Technology | 2793S | |
| p-AMPKα-T174抗体 | Bimake | A5740 | |
| cleaved caspase3抗体 | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| β-actin抗体 | ABclonal | AC026 | |
| ORFK8抗体 | Santa Cruz | F33P1 | |
| West Dura ECL底物 | FTC life | 047-500 | |
| ChemiDoc MP成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 免疫荧光 | DAPI染色液 | Solarbio | C0060 |
| 抗淬灭封片剂 | Solarbio | S2100 | |
| Alexa Fluor 488偶联的山羊抗小鼠二抗 | -- | -- | |
| 荧光显微镜 | Zeiss | M2 | |
| 药物处理 | Compound C | Adooq | A13720 |
| 丁酸钠 | -- | -- | |
| 细胞增殖检测 | 台盼蓝 | Yesen | 40207ES20 |
| 凋亡检测 | Annexin V-PE-Cy7 | Elabscience | E-CK-A217 |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 流式细胞术 | 流式细胞仪 | Thermo Fisher | Attune |
| 基因敲低 | 聚乙烯亚胺 | Polysciences | 23966-2 |
| 聚凝胺 | -- | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | TransGen Biotech | ET111-01 |
| RT-qPCR | cDNA合成试剂盒 | TransGen Biotech | AUQ-01 |
| SYBR Green | TransGen Biotech | AUQ-01 | |
| 病毒粒子定量 | DNase I | Invitrogen | P30727 |
| qPCR预混液 | Abclonal | RK21219 | |
| 动物实验 | D-荧光素 | PerkinElmer | 122799 |
| IVIS Lumina LT小动物活体成像系统 | PerkinElmer | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养条件(RPMI1640+10%FBS,5% CO2, 37°C) 阅读提示:Material and Methods, Cell culture and reagents |
| LKB1/AMPK敲低 | shRNA序列、转导方法(慢病毒)、敲低效率验证(RT-qPCR和Western blot) 阅读提示:Material and Methods, Lentivirus-mediated gene knockdown |
| Compound C处理 | 浓度(0、1、5、10 µM)、处理时间(72小时)、溶剂对照(H2O) 阅读提示:Results, Pharmacological inhibition of AMPK suppresses PEL cell proliferation and survival |
| KSHV再激活检测 | 裂解基因引物(RTA、ORF65等)、NaB浓度(0.5 mM)、处理时间(3天或4天) 阅读提示:Material and Methods, Detection of KSHV lytic replication; Results sections |
| 动物实验 | 小鼠品系(NOD/SCID)、细胞注射量(1×10^7)、Compound C剂量(10 mg/kg)和给药频率(每日两次) 阅读提示:Material and Methods, Animal experiments |