建立感染性骨缺损模型并评估ECP的体内疗效
验证ECP对感染性骨缺损的骨修复作用
新西兰白兔建立胫骨缺损并感染金黄色葡萄球菌,分为Control、Model、Van-CS、Van-CS+ECP组,ECP灌胃8周后,通过micro-CT、HE染色、IHC染色评估骨修复。
Epimedium-Curculigo herb pair enhances bone repair with infected bone defects and regulates osteoblasts through LncRNA MALAT1/miR-34a-5p/SMAD2 axis.
包含体内动物模型(兔感染性骨缺损模型)和体外细胞实验(MC3T3-E1成骨细胞),并进行了功能验证(CCK-8、ALP染色、茜素红染色)和机制验证(双荧光素酶报告基因、qRT-PCR、Western blot)。
新西兰白兔感染性骨缺损模型 MC3T3-E1成骨细胞 HEK 293细胞
感染性骨缺损模型制备:兔胫骨钻孔2mm,注入1×10^6 CFU/mL金黄色葡萄球菌悬液,感染4周 分组:Control、Model、Van-CS、Van-CS+ECP,每组10只兔子 ECP给药剂量:3.34 g/kg/天,灌胃,持续8周 LPS处理浓度:100 μg/mL,处理24和48小时 ECP-CS处理浓度:1% ECP-CS
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证ECP对感染性骨缺损的骨修复作用
新西兰白兔建立胫骨缺损并感染金黄色葡萄球菌,分为Control、Model、Van-CS、Van-CS+ECP组,ECP灌胃8周后,通过micro-CT、HE染色、IHC染色评估骨修复。
鉴定ECP提取物中的化学成分和入血成分
采用UPLC-QTOF-MS/MS定性分析ECP提取物,UPLC-QTRAP-MS/MS定量分析含药血清中的6种入血成分。
预测ECP入血成分治疗骨修复的潜在靶点和信号通路
利用PharmaMapper预测成分靶点,GeneCards、OMIM、Drugbank数据库获取骨修复相关基因,取交集后通过GO和KEGG富集分析。
验证LncRNA MALAT1是否直接靶向miR-34a-5p,以及miR-34a-5p对SMAD2的调控作用
通过双荧光素酶报告基因实验验证LncRNA MALAT1与miR-34a-5p的结合;通过转染siMALAT1、miR-34a-5p mimics/inhibitor、siSMAD2,检测成骨细胞分化矿化相关基因和蛋白表达。
验证LPS是否通过LncRNA MALAT1/miR-34a-5p/SMAD2轴抑制成骨细胞功能
用不同浓度LPS处理成骨细胞,筛选诱导浓度(100 μg/mL),检测相关基因和蛋白表达,以及ALP染色和茜素红S染色。
验证ECP-CS是否通过LncRNA MALAT1/miR-34a-5p/SMAD2轴逆转LPS的抑制作用
在LPS诱导的成骨细胞中,用ECP-CS处理,并结合siMALAT1、miR-34a-5p mimics和siSMAD2转染,检测细胞活力、基因和蛋白表达及染色。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 体内动物实验 | 万古霉素 | -- | -- |
| micro-CT扫描 | SkyScan-1172微型CT | Bruker | -- |
| 免疫组化 | RUNX2抗体 | Bioss | bs-1134R |
| 细胞培养 | α-MEM培养基 | Genomcell bio | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞转染 | opti-MEM培养基 | Grand Island Biological Company | -- |
| LipoHigh转染试剂 | GenePharm | -- | |
| qRT-PCR | SPARKeasy细胞RNA快速提取试剂盒 | Invitrogen | -- |
| SPARKscriptIIRT Plus试剂盒 | Hangzhou Diante Biotechnology | -- | |
| SPARKScript II miRNA第一链cDNA合成试剂盒 | Hangzhou Diante Biotechnology | -- | |
| 2× SYBR Green qPCR预混液 | Hangzhou Diante Biotechnology | -- | |
| 2× miRNA SYBR Green qPCR预混液 | Hangzhou Diante Biotechnology | -- | |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | -- | -- |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| SMAD2抗体 | Bioss | bs-0718R | |
| ALP抗体 | Bioss | bsm-52252R | |
| RUNX2抗体 | diagbio | db20178 | |
| I型胶原抗体 | Boster | PB0981 | |
| GAPDH抗体 | Boster | A00227-1 | |
| HRP标记二抗 | Boster | BA1054 | |
| ChemiDoc MP成像系统 | BioRad | -- | |
| 分化染色 | ALP染色试剂盒 | KGI Biotechnology | 20210520 |
| 矿化诱导 | 抗坏血酸 | Aladdin | A171447 |
| β-甘油磷酸钠 | Sigma-Aldrich | BCCD6874 | |
| 地塞米松 | Aladdin | B1704084 | |
| 矿化染色 | 茜素红S | Aladdin | 130-22-3 |
| 双荧光素酶报告基因检测 | 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Yeasen Biotechnology | -- |
| 成分分析 | ACQUITY UPLC HSS T3色谱柱 | Waters | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体内动物模型 | 新西兰白兔的年龄、体重、骨缺损直径、金黄色葡萄球菌浓度和感染时间 阅读提示:Materials and Methods 2.1 |
| ECP给药 | ECP灌胃剂量(3.34 g/kg/天)和治疗时间(8周) 阅读提示:Materials and Methods 2.1 |
| micro-CT分析 | 扫描参数(像素大小、滤波片、电压、电流、曝光时间)和软件(NRecon、CTAn) 阅读提示:Materials and Methods 2.2 |
| 含药血清制备 | ECP提取物制备方法、大鼠给药剂量(7.4 g/kg/day)、血清采集时间 阅读提示:Materials and Methods 2.3 |
| 细胞培养和LPS处理 | MC3T3-E1细胞培养条件、LPS处理浓度(100 μg/mL)和处理时间(24/48小时) 阅读提示:Materials and Methods 2.6, 2.7 and Results 3.8 |
| 细胞转染 | 转染试剂、转染时间(6小时)和质粒序列 阅读提示:Materials and Methods 2.8 and Table S2 |
| qRT-PCR | RNA提取试剂盒、逆转录试剂盒、qPCR Mix和引物序列 阅读提示:Materials and Methods 2.9 and Table S3 |
| Western blot | 一抗浓度(1:500或1:1000)和二抗浓度(1:2000) 阅读提示:Materials and Methods 2.10 |
| 双荧光素酶报告基因实验 | 转染浓度(50 nM)、处理时间和检测方法 阅读提示:Materials and Methods 2.12 |