系统发育和序列相似性分析
评估历史上人类N2和禽类N2之间的进化关系及氨基酸序列相似性。
分析了103条人类和禽类N2基因序列,构建最大似然系统发育树,并进行成对氨基酸序列相似性比较。
A(H2N2) and A(H3N2) influenza pandemics elicited durable cross-reactive and protective antibodies against avian N2 neuraminidases.
研究包含人群血清学调查、系统发育分析、小鼠攻毒被动转移和初免-攻击实验等多个独立证据层级,并包含功能验证和机制验证。
人血清样本(广州、CARES、EPI-HK队列) BALB/c小鼠 重组病毒(rgH6Nx、rgH3N2等)
广州队列中不同年龄组(≤5、6-10、11-20、21-39、40-64、≥65岁)的N2抗体阳性率 BALB/c小鼠中被动转移人血清后的生存率和体重减轻 小鼠初免-攻击实验中的免疫剂量、攻毒病毒株、攻毒剂量 CARES队列中A(H3N2)感染前后的N2抗体滴度 EPI-HK队列中按出生年份分层的N2抗体滴度
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估历史上人类N2和禽类N2之间的进化关系及氨基酸序列相似性。
分析了103条人类和禽类N2基因序列,构建最大似然系统发育树,并进行成对氨基酸序列相似性比较。
评估不同年龄组个体对禽类N2和人类N2的抗体反应模式。
对广州队列(120份血清样本,6个年龄组)和EPI-HK队列(105份血清样本)进行HI和NI抗体检测。
评估人血清中交叉反应性N2抗体对A(H9N2)病毒攻击的保护作用。
收集不同年龄组的混合人血清,通过腹腔注射转移给BALB/c小鼠,18小时后用A/chicken/Zhejiang/198/2019 (H9N2)病毒攻击,监测体重和生存率。
验证1968年N2免疫是否提供对禽类N2的交叉反应性抗体和保护作用。
用不同病毒(AI68、rgH3N2-SG16、rgH1N1-MI15或rgH6Nx系列)初免小鼠两次,然后用A/chicken/Zhejiang/198/2019 (H9N2)病毒攻击,评估抗体反应和病毒复制。
进一步确认AI68 N2抗体对禽类N2攻击的独立保护作用。
收集用rgH6N2-AI68等病毒免疫的小鼠血清,转移至未免疫的小鼠,然后用ZJ19攻击,监测体重和生存率。
探究季节性A(H3N2)感染能否唤起交叉反应性禽类NA抗体。
分析43名经PCR确诊的A(H3N2)感染老年人(60-88岁)基线及感染后血清中针对多种NA亚型的NI抗体滴度变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 病毒培养与滴定 | 狗肾细胞系(MDCK) | -- | -- |
| 病毒培养 | 最低必需培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 血凝抑制试验 | 受体破坏酶 | Denka Seiken | -- |
| 豚鼠红细胞 | Guangzhou Ruite Biotechnology Co., Ltd. | -- | |
| 神经氨酸酶抑制试验 | 胎球蛋白 | BIO-RAD | -- |
| 辣根过氧化物酶标记的花生凝集素 | Sigma | -- | |
| 酶联免疫吸附测定 | 重组全长HA蛋白 | Sinobiologicals | -- |
| 抗人IgG二抗 | Bioss | bs-0297G-HRP | |
| 抗鼠IgG二抗 | Bioss | bs-0296G-HRP | |
| 吐温-20 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | Lonsera | -- | |
| 重组病毒生成 | pHW2000质粒 | -- | -- |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| 病毒滴定 | TissueLyser II组织破碎仪 | QIAGEN | -- |
| 统计分析与绘图 | GraphPad Prism软件 | -- | -- |
| R软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 人群血清学调查 | 年龄分组标准,样本量(广州队列n=20/组,EPI-HK队列n=105),性别比例,采样时间,禽类暴露史,疫苗接种史 阅读提示:Methods: Human cohorts, Table 1 |
| 抗体检测 | 血清起始稀释度,血凝素抑制试验中红细胞类型,神经氨酸酶抑制试验中fetuin浓度、重组病毒浓度、孵育时间 阅读提示:Methods: Hemagglutination inhibition assay, Neuraminidase inhibition (NI) assay |
| 被动转移-攻毒实验 | 小鼠品系、性别、年龄,血清转移体积,攻毒病毒株、剂量,监测时间 阅读提示:Methods: Human sera passive transfer-challenge mouse experiment, Fig. 2f, g |
| 初免-攻击实验 | 初免病毒株及剂量,加强免疫时间,攻毒剂量,肺脏收取时间点,监测时间 阅读提示:Methods: Prime-challenge mouse experiment, Fig. 3, Fig. 4 |