去甲基化酶FTO介导的SIK1 m6A修饰调节2型糖尿病中胎盘细胞滋养层合体化

Demethylase FTO-mediated m6A modification of SIK1 modulates placental cytotrophoblast syncytialization in type 2 diabetes mellitus.

作者信息Jie Ning, Jie Yan, Shuxian Wang, Zifeng Cui, Yiwei Xue, Juan Juan, Huixia Yang
PMID38883837
期刊iScience
发布时间2024-05
DOI10.1016/j.isci.2024.109900

实验完整度

包含人胎盘样本、BeWo细胞模型、MeRIP-seq/RNA-seq组学分析、功能验证(siRNA敲低、过表达、荧光素酶报告基因)和机制验证。

主要模型

人足月胎盘组织(T2DM与正常对照) BeWo细胞系(FSK诱导合体化模型)

重点核对

胎盘样本:T2DM组n=12,CTRL组n=15 BeWo细胞高糖处理:25 mM D-葡萄糖 vs 5.5 mM D-葡萄糖+19.5 mM D-甘露醇 FSK诱导浓度:20 μM,处理时间:24, 48, 72, 96 h FTO过表达和siRNA敲低验证SIK1表达及融合指数

摘要

细胞生物学;基因调控的分子机制;生理学。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
高糖条件下滋养层合体化受损的具体分子机制,特别是m6A RNA甲基化修饰在其中的作用。
核心机制
高糖上调m6A去甲基化酶FTO,FTO通过识别SIK1 mRNA 3'-UTR的m6A位点降低其m6A修饰水平,导致SIK1 mRNA稳定性下降和表达下调,进而抑制滋养层合体化。
主要证据
人胎盘样本和BeWo细胞中,高糖组SIK1的m6A水平和表达均降低;FTO过表达降低SIK1表达和mRNA稳定性,FTO敲低恢复高糖下的SIK1表达;双荧光素酶报告实验证实FTO直接作用于SIK1 3'-UTR的m6A位点;FTO过表达抑制FSK诱导的BeWo细胞融合。
研究意义
揭示了FTO-m6A-SIK1轴在胎盘合体化中的关键作用,为高血糖相关胎盘功能障碍提供了潜在机制,可能作为治疗靶点。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

高糖暴露下滋养层合体化功能评估

验证高糖是否影响胎盘滋养层合体化过程。

收集T2DM和正常胎盘组织,检测β-hCG和SYNC-2的表达;使用BeWo细胞在5.5 mM和25 mM葡萄糖下用FSK诱导合体化,检测融合标志物和融合指数。

2

m6A修饰谱分析

比较T2DM与正常胎盘中m6A修饰的全基因组分布模式。

提取胎盘总RNA,检测整体m6A水平;对每组5个样本进行MeRIP-seq和RNA-seq,分析差异m6A峰和差异表达基因,进行GO和KEGG富集分析。

3

SIK1 m6A修饰和表达验证

验证测序结果中SIK1 m6A修饰和表达的差异。

用MeRIP-qPCR检测胎盘和BeWo细胞中SIK1特定位点m6A水平;RT-qPCR和Western blot检测SIK1 mRNA和蛋白表达;放线菌素D处理检测mRNA稳定性。

4

SIK1功能验证

验证SIK1在滋养层合体化中的必要性。

使用siRNA敲低BeWo细胞中的SIK1,FSK诱导后检测β-hCG和SYNC-2表达及细胞融合。

5

FTO调控SIK1的机制研究

探究FTO是否通过m6A修饰调控SIK1表达。

检测高糖下FTO表达;过表达FTO检测SIK1表达和稳定性;FTO敲低观察SIK1恢复;双荧光素酶报告实验验证FTO与SIK1 3'-UTR的m6A位点结合。

6

FTO对合体化的影响

验证FTO过表达是否抑制滋养层合体化。

BeWo细胞转染FTO-DN或对照,FSK诱导后检测β-hCG、SYNC-2、SIK1表达及细胞融合。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
RPMI 1640培养基Sigma--
胎牛血清Sigma Aldrich--
抗生素-抗真菌剂Gibco--
D-葡萄糖Sigma-Aldrich--
D-甘露醇Sigma-Aldrich--
毛喉素SelleckS2449
二甲基亚砜Sigma Aldrich--
FastKing gDNA去除反转录超混液Tiangen Biotech--
SYBR Green实时PCR主混合物Bimake--
RIPA裂解液Bioss--
PVDF膜Millipore--
增强化学发光试剂Merck Millipore--
EpiQuik™ m6A RNA甲基化定量试剂盒Epigentek--
GenSeq™ m6A RNA免疫沉淀试剂盒GenSeqGS-ET-00110
NEBNext® Ultra II 定向RNA文库制备试剂盒New England BiolabsE7530
Lipofectamine RNAiMax转染试剂Invitrogen--
Lipofectamine 3000转染试剂Invitrogen--
皂苷/Triton X-100透化剂Beyotime Biotechnology--
DAPI染色液----
Leica SP8共聚焦显微镜Leica--
双荧光素酶报告基因检测系统PromegaE1910
兔单克隆抗β-actin抗体Cell Signaling Technology4970
兔多克隆抗FTO抗体Proteintech27226-1-AP
兔多克隆抗SIK1抗体Proteintech51045-1-AP
兔多克隆抗β-hCG抗体Proteintech11615-1-AP
兔多克隆抗SYNC-2(N端)抗体AbceptaAP13018A
抗兔IgG-HRP二抗Cell Signaling Technology7074
兔单克隆抗E-cadherin抗体Cell Signaling Technology3195
山羊抗兔IgG H&L (Alexa Fluor 488)二抗Abcamab150077
BeWo细胞系NICR--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
临床样本收集
胎盘组织来源:北京大学第一医院;T2DM组n=12(HbA1c>6%或GA>16%),CTRL组n=15;取样位置:脐带插入点5cm外、剖宫产后0.5h内;知情同意和伦理批准。
阅读提示:STAR Methods: Human participants
BeWo细胞培养与高糖处理
细胞系:BeWo (RRID: CVCL_0044);培养基:RPMI 1640无糖培养基添加5.5 mM D-葡萄糖(正常)或25 mM D-葡萄糖(高糖),高糖组用19.5 mM D-甘露醇平衡渗透压;培养条件:37°C、5% CO2。
阅读提示:STAR Methods: Cell lines
FSK诱导合体化
FSK浓度:20 μM;处理时间:48 h(部分实验24-96 h);对照组用等量DMSO处理。
阅读提示:STAR Methods: Cell lines
m6A定量与MeRIP-seq
m6A定量试剂盒:EpiQuik™;RNA量:200 ng;MeRIP-seq每组5例,测序平台:Illumina NovaSeq,150 bp双端;差异m6A峰阈值:p<0.00001,FC≥2或<0.5。
阅读提示:STAR Methods: RNA m6A quantification, MeRIP-seq and data analysis
细胞转染
siRNA浓度:100 nM;转染试剂:Lipofectamine RNAiMax(siRNA)或Lipofectamine 3000(质粒);FTO-siRNA序列:CAGGAACCUUGGAUUAUAUTT;SIK1-siRNA序列:GGAACCAGCUCUGACAGUUTT;阴性对照序列:UUCUCCGAACGUGUCACGUTT。
阅读提示:STAR Methods: Cell transfection
mRNA稳定性检测
放线菌素D浓度:5 μg/mL;取样时间:0、6、12 h;内参:β-actin。
阅读提示:STAR Methods: mRNA stability
双荧光素酶报告基因
载体:GV272(含SIK1 3'-UTR WT或MUT);共转染FTO-DN或对照质粒;检测时间:转染后48 h;每个组重复三次。
阅读提示:STAR Methods: Dual-luciferase reporter assays