高糖暴露下滋养层合体化功能评估
验证高糖是否影响胎盘滋养层合体化过程。
收集T2DM和正常胎盘组织,检测β-hCG和SYNC-2的表达;使用BeWo细胞在5.5 mM和25 mM葡萄糖下用FSK诱导合体化,检测融合标志物和融合指数。
Demethylase FTO-mediated m6A modification of SIK1 modulates placental cytotrophoblast syncytialization in type 2 diabetes mellitus.
包含人胎盘样本、BeWo细胞模型、MeRIP-seq/RNA-seq组学分析、功能验证(siRNA敲低、过表达、荧光素酶报告基因)和机制验证。
人足月胎盘组织(T2DM与正常对照) BeWo细胞系(FSK诱导合体化模型)
胎盘样本:T2DM组n=12,CTRL组n=15 BeWo细胞高糖处理:25 mM D-葡萄糖 vs 5.5 mM D-葡萄糖+19.5 mM D-甘露醇 FSK诱导浓度:20 μM,处理时间:24, 48, 72, 96 h FTO过表达和siRNA敲低验证SIK1表达及融合指数
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证高糖是否影响胎盘滋养层合体化过程。
收集T2DM和正常胎盘组织,检测β-hCG和SYNC-2的表达;使用BeWo细胞在5.5 mM和25 mM葡萄糖下用FSK诱导合体化,检测融合标志物和融合指数。
比较T2DM与正常胎盘中m6A修饰的全基因组分布模式。
提取胎盘总RNA,检测整体m6A水平;对每组5个样本进行MeRIP-seq和RNA-seq,分析差异m6A峰和差异表达基因,进行GO和KEGG富集分析。
验证测序结果中SIK1 m6A修饰和表达的差异。
用MeRIP-qPCR检测胎盘和BeWo细胞中SIK1特定位点m6A水平;RT-qPCR和Western blot检测SIK1 mRNA和蛋白表达;放线菌素D处理检测mRNA稳定性。
验证SIK1在滋养层合体化中的必要性。
使用siRNA敲低BeWo细胞中的SIK1,FSK诱导后检测β-hCG和SYNC-2表达及细胞融合。
探究FTO是否通过m6A修饰调控SIK1表达。
检测高糖下FTO表达;过表达FTO检测SIK1表达和稳定性;FTO敲低观察SIK1恢复;双荧光素酶报告实验验证FTO与SIK1 3'-UTR的m6A位点结合。
验证FTO过表达是否抑制滋养层合体化。
BeWo细胞转染FTO-DN或对照,FSK诱导后检测β-hCG、SYNC-2、SIK1表达及细胞融合。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Sigma | -- |
| 胎牛血清 | Sigma Aldrich | -- | |
| 抗生素-抗真菌剂 | Gibco | -- | |
| D-葡萄糖 | Sigma-Aldrich | -- | |
| D-甘露醇 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 毛喉素 | Selleck | S2449 | |
| 二甲基亚砜 | Sigma Aldrich | -- | |
| RNA提取与RT-qPCR | FastKing gDNA去除反转录超混液 | Tiangen Biotech | -- |
| RT-qPCR | SYBR Green实时PCR主混合物 | Bimake | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Bioss | -- |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 增强化学发光试剂 | Merck Millipore | -- | |
| m6A定量 | EpiQuik™ m6A RNA甲基化定量试剂盒 | Epigentek | -- |
| MeRIP-seq | GenSeq™ m6A RNA免疫沉淀试剂盒 | GenSeq | GS-ET-00110 |
| RNA-seq | NEBNext® Ultra II 定向RNA文库制备试剂盒 | New England Biolabs | E7530 |
| 细胞转染 | Lipofectamine RNAiMax转染试剂 | Invitrogen | -- |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| 免疫荧光 | 皂苷/Triton X-100透化剂 | Beyotime Biotechnology | -- |
| DAPI染色液 | -- | -- | |
| 荧光成像 | Leica SP8共聚焦显微镜 | Leica | -- |
| 双荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | E1910 |
| 抗体 | 兔单克隆抗β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | 4970 |
| Western blot/免疫组化 | 兔多克隆抗FTO抗体 | Proteintech | 27226-1-AP |
| 兔多克隆抗SIK1抗体 | Proteintech | 51045-1-AP | |
| 兔多克隆抗β-hCG抗体 | Proteintech | 11615-1-AP | |
| 兔多克隆抗SYNC-2(N端)抗体 | Abcepta | AP13018A | |
| Western blot | 抗兔IgG-HRP二抗 | Cell Signaling Technology | 7074 |
| 免疫荧光 | 兔单克隆抗E-cadherin抗体 | Cell Signaling Technology | 3195 |
| 山羊抗兔IgG H&L (Alexa Fluor 488)二抗 | Abcam | ab150077 | |
| 细胞系 | BeWo细胞系 | NICR | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集 | 胎盘组织来源:北京大学第一医院;T2DM组n=12(HbA1c>6%或GA>16%),CTRL组n=15;取样位置:脐带插入点5cm外、剖宫产后0.5h内;知情同意和伦理批准。 阅读提示:STAR Methods: Human participants |
| BeWo细胞培养与高糖处理 | 细胞系:BeWo (RRID: CVCL_0044);培养基:RPMI 1640无糖培养基添加5.5 mM D-葡萄糖(正常)或25 mM D-葡萄糖(高糖),高糖组用19.5 mM D-甘露醇平衡渗透压;培养条件:37°C、5% CO2。 阅读提示:STAR Methods: Cell lines |
| FSK诱导合体化 | FSK浓度:20 μM;处理时间:48 h(部分实验24-96 h);对照组用等量DMSO处理。 阅读提示:STAR Methods: Cell lines |
| m6A定量与MeRIP-seq | m6A定量试剂盒:EpiQuik™;RNA量:200 ng;MeRIP-seq每组5例,测序平台:Illumina NovaSeq,150 bp双端;差异m6A峰阈值:p<0.00001,FC≥2或<0.5。 阅读提示:STAR Methods: RNA m6A quantification, MeRIP-seq and data analysis |
| 细胞转染 | siRNA浓度:100 nM;转染试剂:Lipofectamine RNAiMax(siRNA)或Lipofectamine 3000(质粒);FTO-siRNA序列:CAGGAACCUUGGAUUAUAUTT;SIK1-siRNA序列:GGAACCAGCUCUGACAGUUTT;阴性对照序列:UUCUCCGAACGUGUCACGUTT。 阅读提示:STAR Methods: Cell transfection |
| mRNA稳定性检测 | 放线菌素D浓度:5 μg/mL;取样时间:0、6、12 h;内参:β-actin。 阅读提示:STAR Methods: mRNA stability |
| 双荧光素酶报告基因 | 载体:GV272(含SIK1 3'-UTR WT或MUT);共转染FTO-DN或对照质粒;检测时间:转染后48 h;每个组重复三次。 阅读提示:STAR Methods: Dual-luciferase reporter assays |