SXD化学成分分析
鉴定SXD中的主要化学成分。
通过UPLC-Q-TOF/MS分析SXD乙醇提取液,鉴定出113种化合物,其中57种被筛选为潜在有效成分。
Exploring the effective compounds and potential mechanisms of Shengxian Decoction against coronary heart disease by UPLC-Q-TOF/MS and network pharmacology analysis.
本研究包含UPLC-Q-TOF/MS成分分析、网络药理学预测、分子对接、大鼠CHD模型和H9c2细胞H/R模型,进行了功能验证和机制验证,证据层级多样。
大鼠CHD模型(结扎左前降支冠状动脉结合力竭游泳和限食) H9c2心肌细胞H/R模型 GSE66360微阵列数据集(心肌梗死患者和对照组)
大鼠CHD模型建立方法:力竭游泳、限食、左前降支冠状动脉结扎 SXD给药剂量:低剂量4.33 g/kg和高剂量12.99 g/kg,灌胃给药 H9c2细胞H/R处理条件:缺氧8小时,复氧12小时 SXD处理浓度:250 μg/mL、500 μg/mL和1 mg/mL,处理24小时 核心靶点验证:TNF、IL-6、IL-1β、TP53、VEGFA、PTGS2
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定SXD中的主要化学成分。
通过UPLC-Q-TOF/MS分析SXD乙醇提取液,鉴定出113种化合物,其中57种被筛选为潜在有效成分。
预测SXD治疗CHD的潜在靶点和机制。
通过TCMSP、数据库和文献筛选有效成分,收集CHD相关靶点,构建PPI网络、C-T-D网络,计算CI,进行GO和KEGG富集分析,并进行分子对接验证核心成分-靶点结合。
验证SXD对CHD大鼠心肌损伤的保护作用。
建立大鼠CHD模型,分为假手术、模型、SXD低剂量、SXD高剂量和Betaloc组,给药28天后检测心重指数、心肌梗死面积、组织病理学变化和血清炎症因子水平。
验证SXD对H/R诱导的H9c2心肌细胞损伤的保护作用及机制。
建立H9c2细胞H/R模型,检测SXD对细胞活力、ROS水平、凋亡率、炎症因子分泌以及凋亡相关mRNA和蛋白表达的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 制备SXD提取物 | MiLLi-Q IQ 7000纯水系统 | Merck | -- |
| Labconco Freezone 4.5L冷冻干燥机 | Labconco | -- | |
| 化学指纹分析 | Waters Acquity SDS系统 | Waters | -- |
| ACQUITY UPLC HSS T3色谱柱 | Waters | -- | |
| 数据采集 | MassLynx V4.2软件 | Waters | -- |
| 网络药理学分析 | Cytoscape 3.8.2软件 | -- | -- |
| 分子对接 | AutoDockTools软件 | -- | -- |
| LigPlot软件 | -- | -- | |
| PyMOL软件 | -- | -- | |
| 动物实验 | 2%异氟烷 | -- | -- |
| 6-0手术缝合线 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 倍他乐克 | AstraZeneca | -- | |
| 心肌梗死面积检测 | 2,3,5-三苯基氯化四氮唑 | -- | -- |
| 组织染色 | 伊红 | -- | -- |
| Masson染色试剂盒 | -- | -- | |
| ELISA | IL-6 ELISA试剂盒 | MEIMIAN | MM-0190R1 |
| IL-1β ELISA试剂盒 | MEIMIAN | MM-0047R1 | |
| 醛固酮ELISA试剂盒 | MEIMIAN | YJ002876 | |
| 血管紧张素II ELISA试剂盒 | MEIMIAN | YJ058803 | |
| NT-proBNP ELISA试剂盒 | MEIMIAN | YJ003242 | |
| 酶标仪 | Rayto | RT-6100 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| D-Hank's液 | -- | -- | |
| 细胞处理 | 二氮嗪 | -- | -- |
| 细胞活力检测 | MTT试剂 | -- | -- |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| ROS检测 | 活性氧检测试剂盒 | Beyotime | S0033M |
| DCFH-DA探针 | -- | -- | |
| 流式分析 | Beckman CytoFlex S流式细胞仪 | Beckman | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI染色试剂盒 | Beyotime | C1062M |
| ELISA | TNF ELISA试剂盒 | BIOFINE | FU-D1393 |
| IL-6 ELISA试剂盒 | BIOFINE | FU-D1083 | |
| IL-1β ELISA试剂盒 | BIOFINE | FU-D1032 | |
| RT-qPCR | RNeasy mini试剂盒 | QIAGEN | -- |
| Revert Ace逆转录试剂盒 | TOYOBO | -- | |
| SYBR Green染料 | -- | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P1003B |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0010 | |
| 硝酸纤维素膜 | Millipore | HATF00010 | |
| Caspase3抗体 | Proteintech | 19677-1-AP | |
| Caspase9抗体 | Bioss | bs-20773R | |
| 细胞色素C抗体 | Bioss | bs-0013R | |
| β-actin抗体 | ZEN-BIOSCIENCE | 200068-8F10 | |
| HRP标记二抗 | Proteintech | SA00001-1, | |
| ECL化学发光试剂盒 | Millipore | WBKLS0500 | |
| Caspase-3活性检测 | Caspase 3活性检测试剂盒 | Beyotime | C1115 |
| Bradford蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0006 | |
| 酶标仪 | BioTek | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| SXD提取物制备 | 药材配比、提取溶剂(水或70%乙醇)、提取时间、冻干条件 阅读提示:Methods 2.1.1 |
| 化学指纹分析 | UPLC-Q-TOF/MS参数、色谱柱、流动相、梯度条件 阅读提示:Methods 2.1.2 |
| 网络药理学筛选 | 有效成分筛选标准(OB、DL)、靶点数据库筛选条件、PPI网络参数 阅读提示:Methods 2.2 |
| 动物实验 | 大鼠品系、性别、体重、CHD模型建立方法、分组、给药剂量和途径、治疗周期 阅读提示:Methods 2.3.1 |
| 细胞实验 | H9c2细胞培养条件、H/R模型建立参数、SXD处理浓度和时间 阅读提示:Methods 2.4.1 |
| 凋亡相关检测 | RT-qPCR引物序列、Western blot抗体稀释比例、caspase-3活性检测方法 阅读提示:Methods 2.4.6-2.4.8 |