OGD/R诱导心肌细胞损伤模型
建立体外MIRI模型,观察心肌细胞活力、焦亡及相关蛋白表达的改变。
AC16和HL-1细胞经过氧糖剥夺(OGD)2、4、8或12小时,然后复氧6小时。检测细胞活力(CCK-8)、焦亡(流式Caspase-1/PI双阳性)、蛋白表达(Western blot)及IL-18/IL-1β释放(ELISA)。
STUB1 is acetylated by KAT5 and alleviates myocardial ischemia-reperfusion injury through LATS2-YAP-β-catenin axis.
包含体外OGD/R模型和体内小鼠MIRI模型,并进行了功能验证(CCK-8、流式)、机制验证(Co-IP、ChIP、双荧光素酶)和体内评估(TTC、HE、超声心动图)。
AC16人心肌细胞 HL-1小鼠心肌细胞 C57BL/6小鼠心肌缺血再灌注模型
心肌细胞类型(AC16和HL-1)及OGD/R处理时间(2、4、8、12小时) 动物模型(C57BL/6小鼠)及缺血45分钟再灌注2、4、8、12小时,后续实验选择再灌注4小时 细胞转染使用的慢病毒载体(sh-KAT5、KAT5过表达等)及体内注射腺病毒(1×10^10 VP/mL) LATS2敲低或过表达对细胞活力(CCK-8)和焦亡(流式Caspase-1/PI双阳性)的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立体外MIRI模型,观察心肌细胞活力、焦亡及相关蛋白表达的改变。
AC16和HL-1细胞经过氧糖剥夺(OGD)2、4、8或12小时,然后复氧6小时。检测细胞活力(CCK-8)、焦亡(流式Caspase-1/PI双阳性)、蛋白表达(Western blot)及IL-18/IL-1β释放(ELISA)。
探讨LATS2对OGD/R诱导心肌细胞损伤的影响。
使用sh-LATS2或LATS2过表达慢病毒转染细胞,然后进行OGD/R处理。检测细胞活力、焦亡、Caspase-1表达、相关蛋白表达及IL-18/IL-1β释放。
验证STUB1是否作为E3泛素连接酶促进LATS2的泛素化和降解。
通过Ubibrowser预测LATS2的E3连接酶,RT-qPCR筛选STUB1。用sh-STUB1或STUB1过表达慢病毒转染细胞,检测STUB1和LATS2蛋白水平;Co-IP验证外源和内源相互作用;MG132抑制蛋白酶体后检测LATS2水平;CHX追踪实验观察蛋白降解;泛素化实验检测LATS2泛素化水平。
验证STUB1是否通过调节LATS2/YAP/β-catenin轴影响OGD/R诱导的心肌细胞损伤。
在AC16和HL-1细胞中共转染STUB1和LATS2过表达慢病毒(或单独),然后进行OGD/R处理。检测细胞活力、焦亡、Caspase-1表达、相关蛋白表达及IL-18/IL-1β释放。
验证KAT5是否通过乙酰化组蛋白修饰促进STUB1转录。
利用UCSC预测H3K27ac在STUB1启动子的富集;检测OGD/R后KAT5、GCN5、CBP蛋白水平;双荧光素酶报告实验检测KAT5、GCN5、CBP对STUB1启动子活性的影响;ChIP验证KAT5直接结合STUB1启动子;ChIP-re-ChIP验证KAT5与H3K27ac相互作用。
验证KAT5对OGD/R诱导心肌细胞损伤的影响。
使用sh-KAT5或KAT5过表达慢病毒转染细胞,然后进行OGD/R处理。检测细胞活力、焦亡、Caspase-1表达、相关蛋白表达及IL-18/IL-1β释放。
验证KAT5在体内对MIRI的保护作用。
对C57BL/6小鼠进行左前降支冠状动脉结扎45分钟,再灌注2、4、8、12小时。通过腺病毒介导KAT5敲低或过表达,检测心肌梗死面积(TTC)、病理变化(HE)、细胞死亡(TUNEL)、心功能(超声)、血清LDH/CK-MB、相关蛋白表达和细胞因子水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| Lipofectamine2000转染试剂 | Thermo Fisher | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂 | Dojindo | CK04 |
| 动物实验 | 异氟烷 | -- | -- |
| 心肌梗死面积检测 | TTC | -- | -- |
| 免疫组化 | 抗KAT5抗体 | Bioss | bs-13686R |
| 抗STUB1抗体 | Abcam | ab134064 | |
| 抗LATS2抗体 | Bioss | bs-4081R | |
| 抗YAP抗体 | Bioss | bs-3605R | |
| 抗β-catenin抗体 | Abclonal | A19657 | |
| 抗NLRP3抗体 | Thermo Fisher | MA5-32255 | |
| 血清生化检测 | 乳酸脱氢酶检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A020-2-2 |
| 肌酸激酶检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | H197-1-2 | |
| 细胞凋亡检测 | TUNEL检测试剂盒(HRP-DAB) | Abcam | ab206386 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher | -- |
| RT-qPCR | RT预混液(qPCR II) | MCE | HY-K0510A |
| 2×SYBR Green PCR预混液 | Solarbio | SR1110 | |
| Western blotting | RIPA裂解液 | Solarbio | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Solarbio | PC0020 | |
| 抗KAT5抗体 | Bioss | bs-13686R | |
| 抗STUB1抗体 | Abclonal | A11751 | |
| 抗LATS2抗体 | Bioss | bs-4081R | |
| 抗p-YAP抗体 | Bioss | bsm-52214R | |
| 抗YAP抗体 | Bioss | bs-3605R | |
| 抗β-catenin抗体 | Abclonal | A19657 | |
| 抗NLRP3抗体 | Abclonal | A5652 | |
| 抗ASC抗体 | Bioss | bs-6741R | |
| 抗Caspase-1抗体 | Abclonal | A0964 | |
| 抗IL-18抗体 | Abclonal | A1115 | |
| 抗IL-1β抗体 | Abclonal | A16288 | |
| 抗β-actin抗体 | Bioss | bs-0061R | |
| ECL Western blot底物 | Solarbio | PE0010 | |
| 免疫荧光 | 抗Caspase-1抗体 | Abclonal | A0964 |
| Cy3标记的山羊抗兔IgG | Abclonal | -- | |
| ELISA | 人IL-18 ELISA试剂盒 | Solarbio | SEKH-0028 |
| 小鼠IL-18 ELISA试剂盒 | Solarbio | SEKM-0019 | |
| 人IL-1β ELISA试剂盒 | Solarbio | SEKH-0002 | |
| 小鼠IL-1β ELISA试剂盒 | Solarbio | SEKM-0002 | |
| Co-IP | 抗泛素抗体 | Santa Cruz | sc-8017 |
| 抗IgG抗体 | Abclonal | AC005 | |
| ChIP | ChIP检测试剂盒 | Millipore | 17-371 |
| 抗KAT5抗体 | Novus Biologicals | NBP2-20647 | |
| 抗H3K27Ac抗体 | Epigentek | A-4708-050 | |
| 双荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Beyotime | RG027 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外OGD/R模型 | 细胞系(AC16和HL-1)、OGD时间(2,4,8,12小时)、复氧时间(6小时)、检测指标(活力、焦亡、蛋白表达、细胞因子) 阅读提示:Materials and methods: 细胞培养和体外MIRI模型; Figure 1 legend |
| LATS2功能验证 | 转染效率(sh-LATS2和LATS2过表达)、OGD/R处理、检测指标(细胞活力、焦亡、蛋白表达、细胞因子) 阅读提示:Materials and methods: 细胞培养和转染; Figure 2 legend |
| STUB1与LATS2相互作用 | Co-IP实验使用的抗体(STUB1, Ubiquitin, IgG)、MG132浓度(100 nM)和时间(48小时)、CHX浓度(50 μg/mL)和时间点(0,15,30,60,120,240分钟) 阅读提示:Materials and methods: 免疫共沉淀; Figure 3 legend |
| KAT5对STUB1转录调控 | ChIP实验使用的抗体(KAT5, H3K27Ac)、双荧光素酶报告基因实验使用的报告质粒(WT和MUT) 阅读提示:Materials and methods: ChIP和双荧光素酶报告基因实验; Figure 6 legend |
| KAT5功能验证 | 转染效率(sh-KAT5和KAT5过表达)、OGD/R处理、检测指标(细胞活力、焦亡、蛋白表达、细胞因子) 阅读提示:Materials and methods: 细胞培养和转染; Figure 5 legend |
| 体内小鼠MIRI模型 | 小鼠品系和年龄(6-8周龄雄性C57BL/6)、缺血时间(45分钟)和再灌注时间(2,4,8,12小时,后续实验选4小时)、腺病毒注射剂量(1×10^10 VP/mL)和方式(心肌注射)、每组动物数(5只) 阅读提示:Materials and methods: 动物模型; Figure 7 and 8 legends |