验证HFD增加DCA并加剧结肠炎
探究HFD对DCA水平和结肠炎症的影响
小鼠饲喂HFD或CD 3周,最后一周给予2% DSS诱导结肠炎,检测体重、疾病活动指数、结肠长度、组织学损伤及粪便和血清胆汁酸和DCA水平。
Microbial metabolite deoxycholic acid-mediated ferroptosis exacerbates high-fat diet-induced colonic inflammation.
包含体外细胞实验、体内小鼠模型(DSS和TNBS诱导的 colitis)、基因敲除小鼠和临床患者样本,进行了功能验证和机制验证,如铁死亡抑制剂和HIF-2α抑制剂。
C57BL/6J小鼠DSS诱导结肠炎模型 C57BL/6J小鼠TNBS诱导结肠炎模型 HIF-2αfl/fl和HIF-2αΔIEC小鼠 IEC-6细胞和Caco-2细胞 活动期UC患者结肠组织
HFD喂食时长21天,DSS浓度2%,DCA灌肠浓度4mM 体外LPS浓度10 ng/mL处理12h,DCA浓度200μM处理2h 铁死亡抑制剂Ferrostatin-1浓度2μM,HIF-2α抑制剂PT2385浓度10μM BKG浓度20μM和40μM处理24h 患者样本中脂肪摄入与疾病活动度相关性(r值)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究HFD对DCA水平和结肠炎症的影响
小鼠饲喂HFD或CD 3周,最后一周给予2% DSS诱导结肠炎,检测体重、疾病活动指数、结肠长度、组织学损伤及粪便和血清胆汁酸和DCA水平。
探究DCA对结肠炎的直接作用
DSS或TNBS诱导结肠炎小鼠,同时给予DCA灌肠,评估体重、DAI、结肠长度、内镜和组织学损伤。
探究DCA加剧结肠炎的分子机制,特别是铁死亡通路
对DSS和DSS+DCA组结肠组织进行RNA-seq,KEGG和GSEA分析,并通过TEM、免疫组化、qPCR和生化检测验证铁死亡相关指标。
在细胞水平验证DCA对肠上皮细胞铁死亡的影响
IEC-6和Caco-2细胞用LPS和DCA处理,检测铁死亡标志物和形态学变化。
确认DCA效应是通过铁死亡介导
在细胞中加入Ferrostatin-1预处理,观察DCA诱导的铁死亡相关指标变化。
探究DCA调节铁死亡的分子机制
检测体内外HIF-2α和DMT1的表达,使用HIF-2α抑制剂PT2385和肠道特异性敲除小鼠验证其功能。
寻找能阻断DCA诱导铁死亡的天然化合物
分子对接预测BKG与HIF-2α结合,体内外实验评估BKG对DCA诱导铁死亡和结肠炎的影响。
探究HFD对UC患者疾病活动度和铁死亡的影响
分析UC患者脂肪摄入与临床指标的相关性,并检测结肠组织铁死亡相关蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型构建 | 葡聚糖硫酸钠 | MP Biomedicals | -- |
| 药物处理 | 脱氧胆酸 | Sigma-Aldrich | D2510 |
| 脂多糖 | Sigma-Aldrich | L2880 | |
| 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich | D2650 | |
| Ferrostatin-1 | GLPBIO | GC10380 | |
| PT2385 | MedChemExpress | HY-12867 | |
| 白芷素 | Acmec | B96940 | |
| 羧甲基纤维素钠 | Acmec | C91596 | |
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良伊格尔培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素溶液 | -- | -- | |
| 非必需氨基酸 | -- | -- | |
| 总胆汁酸检测 | 总胆汁酸比色法试剂盒 | Elabscience | E-BC-K181-M |
| DCA检测 | 小鼠脱氧胆酸ELISA试剂盒 | Wuxi Yuncui Biotechnology Co. LTD | CM103235 |
| 透射电镜 | 环氧树脂812 | -- | -- |
| 透射电子显微镜HT7800 | Hitachi | -- | |
| 铁含量测定 | 铁含量检测试剂盒 | Solarbio | BC4355 |
| 总铁比色测定 | 总铁比色法试剂盒 | Elabscience | E-BC-K772-M |
| 亚铁比色测定 | 亚铁比色法试剂盒 | Elabscience | E-BC-K773-M |
| GSH测定 | GSH检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K030-M |
| ROS测定 | 活性氧检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | E004-1-1 |
| MDA测定 | MDA检测试剂盒 | Solarbio | BC0025 |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| Western blot | PVDF膜 | Invitrogen | -- |
| β-肌动蛋白抗体 | Abcam | ab8226 | |
| 抗GPX4抗体 | Affinity Biosciences | DF6701 | |
| 抗ACSL4抗体 | Affinity Biosciences | DF12141 | |
| 抗HIF-2α抗体 | Affinity Biosciences | DF2928 | |
| 抗DMT1抗体 | Bioss | bs-3577R | |
| HRP标记的抗鼠IgG | Cell Signaling Technology | -- | |
| HRP标记的抗兔IgG | Cell Signaling Technology | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Ambion | 15596026 |
| TIANScript逆转录试剂盒 | TIANGEN | -- | |
| TaqMan基因表达预混液 | Genewiz | -- | |
| RNA-seq | HiSeq X-Ten测序平台 | Illumina | -- |
| 分子对接 | Schrodinger软件 | -- | -- |
| Maestro软件 | -- | -- | |
| Pymol软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| HFD小鼠模型 | HFD饲料成分(60%脂肪),CD饲料成分(16%脂肪),喂食时长21天,DSS给药浓度和时长 阅读提示:Methods 4.2 Mice experiments,Figure 1A |
| DSS诱导结肠炎模型 | DSS浓度2%,给药方式饮水,时长7天,动物品系和性别(8周龄雌性C57BL/6J),每组小鼠数量(5或6) 阅读提示:Methods 4.2 Mice experiments,Figure 1J |
| TNBS诱导结肠炎模型 | TNBS浓度2.5%,给药方式灌肠,乙醇浓度50%,DCA灌肠浓度4mM,时长4天 阅读提示:Methods 4.2 Mice experiments,Figure 1Q |
| 体外细胞铁死亡实验 | 细胞系(IEC-6和Caco-2),LPS浓度10 ng/mL处理12h,DCA浓度200 μM处理2h,Ferrostatin-1浓度2 μM预处理16h,PT2385浓度10 μM预处理24h,BKG浓度20和40 μM处理24h 阅读提示:Methods 4.3 Cell lines and culture,Figure 3 |
| HIF-2α条件敲除小鼠实验 | 小鼠品系(HIF-2αfl/fl和HIF-2αΔIEC),DSS诱导,DCA灌肠浓度4mM 阅读提示:Methods 4.2 Mice experiments,Figure 5H |
| 临床样本 | UC患者和对照,HFD饮食评估,脂肪摄入计算方法,免疫组化检测HIF-2α、DMT1、GPX4 阅读提示:Methods 4.4 Subjects and samples collection,Figure 7 |