自然衰老小鼠模型建立与组织学分析
观察不同年龄阶段肺组织的结构变化和病理特征。
使用3、6、12、18、24、28月龄C57BL/6J小鼠,进行HE染色观察肺泡结构,透射电镜观察AT1和AT2细胞超微结构。
Age-Dependent Inflammatory Microenvironment Mediates Alveolar Regeneration.
包含自然衰老小鼠模型的组织学、免疫荧光、qRT-PCR、Western blot、转录组学,以及体外A549细胞衰老模型的功能验证和相关性分析。
自然衰老C57BL/6J小鼠(3至28月龄) A549细胞系(D-半乳糖诱导衰老)
小鼠年龄组:3、6、12、18、24、28月龄 D-半乳糖浓度30 g/L处理48小时诱导A549衰老 细胞周期:A549细胞G1期比例增加16.3% 转录组学样本:3月龄和24月龄小鼠AT2细胞
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
观察不同年龄阶段肺组织的结构变化和病理特征。
使用3、6、12、18、24、28月龄C57BL/6J小鼠,进行HE染色观察肺泡结构,透射电镜观察AT1和AT2细胞超微结构。
评估老化过程中AT1和AT2细胞数量的变化。
免疫荧光染色定量AT1(Aqp5)和AT2(Prospc)细胞,RT-qPCR和Western blot检测表面标志物mRNA和蛋白水平。
评估老化对AT2细胞自我增殖和向AT1分化能力的影响。
通过免疫荧光检测Ki67+ AT2细胞比例,分离原代AT2细胞体外培养7天观察其向AT1细胞分化。
探索老化过程中AT2细胞基因表达变化及炎症信号的影响。
流式分选3月龄和24月龄小鼠AT2细胞,进行RNA-seq,分析差异表达基因、GO和KEGG富集。
探讨炎症因子与AT2细胞增殖和分化相关基因的关联。
基于转录组数据,计算炎症因子与Wnt、TGF-β、Notch、BMP通路基因的Pearson相关系数,使用热图和网络图展示。
验证炎症环境对肺泡上皮细胞增殖和分化能力的抑制作用。
使用D-半乳糖诱导A549细胞衰老,检测细胞活力、衰老相关蛋白、炎症因子表达、细胞周期、增殖和分化相关通路蛋白。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| HE染色 | HE染色试剂盒 | Solarbio | G1120 |
| 免疫荧光染色 | 柠檬酸钠抗原修复液 | Solarbio | C1031 |
| Triton X-100 | Solarbio | T8200 | |
| 山羊血清 | Bioss | C01-03001 | |
| DAPI工作液 | Solarbio | C0065 | |
| 抗荧光淬灭封片剂 | Beyotime | P0126 | |
| 免疫荧光观察 | 激光共聚焦显微镜 | ZEISS | -- |
| 透射电镜 | 透射电子显微镜 | Hitachi | -- |
| 细胞培养 | Ham's F-12K培养基 | Procell | PM150910 |
| 胎牛血清 | Procell | 164210 | |
| 青霉素-链霉素 | Procell | PB180120 | |
| 原代AT2细胞培养 | 专用培养基 | Procell | CM-M003 |
| 小鼠尾胶原 | Corning | 354236 | |
| 细胞培养 | HERAcell 150i 二氧化碳培养箱 | Thermo Scientific | -- |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Dojindo | CK04 |
| 多功能酶标仪 | BioTek Instruments | -- | |
| β-半乳糖苷酶染色 | β-半乳糖苷酶染色试剂盒 | Solarbio | G1580 |
| β-半乳糖苷酶染色观察 | 倒置显微镜 | Leica | -- |
| 细胞周期分析 | 细胞染色缓冲液 | Biolegend | 420201 |
| 核糖核酸酶 | Solarbio | R1030 | |
| 碘化丙啶溶液 | Biolegend | 421301 | |
| 流式细胞仪 | BECKMAN COULTER | -- | |
| AT2细胞分离 | I型胶原酶 | Gibco | 17100017 |
| 弹性蛋白酶 | Worthington | LS002294 | |
| 分散酶II | Roach | 4942078001 | |
| 红细胞裂解液 | Solarbio | R1010 | |
| 40微米细胞筛网 | SORFA | 251100 | |
| 流式分选 | FITC标记大鼠抗小鼠CD45抗体 | BD | 553079 |
| PE/Cyanine7抗小鼠CD31抗体 | Biolegend | 102418 | |
| APC标记CD326(EpCAM)单克隆抗体 | Invitrogen | 17-5791-80 | |
| APC/Cyanine7抗小鼠MHCII(I-A/I-E)抗体 | Biolegend | 107627 | |
| 7-AAD活细胞染色液 | Biolegend | 420404 | |
| FACSAria III细胞分选仪 | BD | -- | |
| RNA提取 | TRNzol试剂 | TIANGEN | DP424 |
| NanoDrop分光光度计 | Thermo Scientific | -- | |
| RT-qPCR | cDNA逆转录试剂盒 | abm | G592 |
| 实时荧光定量PCR仪 | Thermo Scientific | -- | |
| SYBR Green荧光染料 | Thermo Scientific | A25742 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Solarbio | R0010 |
| 蛋白磷酸酶抑制剂 | Solarbio | P1260 | |
| 化学发光成像系统 | Clinx Science Instruments | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系:C57BL/6J;年龄:3、6、12、18、24、28月龄;自然老化;饲养环境温度22-24℃,湿度60% 阅读提示:4.1节 |
| 原代AT2细胞分离 | 酶消化:I型胶原酶780U、弹性蛋白酶40U、Dispase II 20U,溶于10mL含Ca2+/Mg2+的PBS;肺部注射1.0mL酶溶液和0.6mL 1%低熔点琼脂糖;消化37℃约40分钟 阅读提示:4.10节 |
| 流式分选AT2细胞 | 分选标记:CD45-FITC、CD31-PE/Cy7、CD326-APC、MHCII-APC/Cy7、7-AAD;分选CD45-CD31-CD326+MHCII+细胞 阅读提示:4.11节 |
| 体外衰老模型 | A549细胞代数<15;D-半乳糖浓度30 g/L,处理48小时 阅读提示:4.6节 |
| 细胞周期分析 | A549细胞接种密度1.5×10^5/孔(6孔板),30 g/L D-半乳糖处理24小时后分析 阅读提示:4.9节 |
| 转录组测序 | 3月龄和24月龄小鼠AT2细胞,3个生物学重复,每重复需足够细胞数,测序平台Illumina NovaSeq 6000,PE150 阅读提示:4.14节 |