建立m.3243A>G患者成纤维细胞模型
验证m.3243A>G突变对线粒体形态和复合物I功能的影响。
从4名患者皮肤活检获取成纤维细胞,培养并验证m.3243A>G突变,通过透射电镜观察线粒体形态,并通过Western blot和BN-PAGE检测ND6表达和复合物I活性。
Complex I deficiency in m.3243A>G fibroblasts is alleviated by reducing NADH accumulation.
包含患者来源成纤维细胞模型,涉及分子检测(蛋白、酶活性)、功能检测(OCR、ATP)、药物与基因干预(NR、mitoLbNOX)及机制验证(NADH FLIM)。
m.3243A>G患者来源成纤维细胞 对照健康人成纤维细胞
m.3243A>G异质性水平 NR处理浓度(0.5, 1, 3 mM)和时间(7天) 腺病毒感染滴度(3.5×10^10 pfu/mL)和时间(24小时) OCR检测的细胞数量 ATP检测的细胞数量
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证m.3243A>G突变对线粒体形态和复合物I功能的影响。
从4名患者皮肤活检获取成纤维细胞,培养并验证m.3243A>G突变,通过透射电镜观察线粒体形态,并通过Western blot和BN-PAGE检测ND6表达和复合物I活性。
检测复合物I功能障碍及NAD+/NADH比值变化。
通过高分辨率呼吸测定法检测OCR,使用WST-8试剂盒测量NAD+/NADH比值,利用FLIM测量NADH水平,并检测ATP水平。
评估NR补充NAD+对m.3243A>G成纤维细胞代谢的影响。
用不同浓度NR处理成纤维细胞,检测NAD+/NADH比值、ATP水平和NADH水平。
评估mitoLbNOX氧化NADH对m.3243A>G成纤维细胞代谢的影响。
通过腺病毒感染使成纤维细胞表达mitoLbNOX,检测NAD+/NADH比值、ATP水平、NADH水平和OCR。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良伊格尔培养基 | BI | 06-1055-57-1A |
| 胎牛血清 | BI | 04-001-1A | |
| 青霉素/链霉素 | BI | 03-031-1B | |
| 药物处理 | 烟酰胺核糖苷 | Selleck | S2935 |
| RFLP-PCR | TIANamp基因组DNA提取试剂盒 | Tiangen | -- |
| 溴化乙锭 | Acmec | E43590-1g | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013D |
| 抗ND6抗体 | BIOSS | bs-3955R | |
| 抗TOM20抗体 | Proteintech | 11802-1-AP | |
| 抗Flag抗体 | CWBIO | CW0287S | |
| Blue-native PAGE | NativePAGE 4%-16% Bis-Tris凝胶 | Thermo Fisher Scientific | BN1002BOX |
| 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 | Sigma-Aldrich | 481913-500MG | |
| 硝基蓝四氮唑 | Sigma-Aldrich | N5514-10TAB | |
| 复合物IV活性检测 | 复合物IV活性检测试剂盒 | Solarbio | BC0940 |
| OCR检测 | Oroboros Oxygraph-2K高分辨率呼吸仪 | Oroboros | -- |
| 寡霉素 | Sigma Aldrich | 75351 | |
| 鱼藤酮 | Sigma Aldrich | 557368 | |
| NAD+/NADH比值检测 | NAD+/NADH检测试剂盒 | Beyotime | S0175 |
| 96孔板 | NEST | 703001 | |
| FLIM | 玻底培养皿 | NEST | 801001 |
| Leica SP8 FALCON共聚焦显微镜 | Leica | -- | |
| Spectra-Physics InSight X3可调谐激光器 | Spectra-Physics | -- | |
| ATP检测 | Celltiter-Glo发光细胞活力检测试剂盒 | Promega | G7570 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 患者成纤维细胞的传代范围(对照1-10代,MELAS 4-12代)、培养基成分(DMEM+20%FBS+100IU/mL青霉素/链霉素)、培养条件 阅读提示:参见Materials and Methods中的Cell culture部分 |
| 药物处理(NR) | NR浓度(0.5 mM、1 mM、3 mM)、处理时间(7天)、细胞死亡率 阅读提示:参见Materials and Methods中的NR treatment部分及Results中的Figure 3 |
| 腺病毒感染(mitoLbNOX) | 腺病毒滴度(3.5×10^10 pfu/mL)、感染时间(24小时)、对照(GFP) 阅读提示:参见Materials and Methods中的adenovirus infection部分及Results中的Figure 3 |
| OCR检测 | 细胞状态(贴壁或悬浮)、药物顺序和浓度(Omy, CCCP, Rot, Ama)、细胞数量(未明确说明) 阅读提示:参见Materials and Methods中的OCR detection部分及Results中的Figure 2和Figure 4 |
| NADH FLIM | 激发波长(750nm)、发射波长(408-479nm)、激光功率(0.8mW)、采样数量(每样本5幅图像,每图像5-6个细胞) 阅读提示:参见Materials and Methods中的FLIM部分及Results中的Figure 2和Figure 4 |