制备修饰纤维蛋白原
生成未修饰和MAA、瓜氨酸单修饰及双重修饰的FIB抗原以刺激细胞。
将天然FIB与丙二醛和乙醛孵育进行MAA修饰;将天然或MAA修饰的FIB与PAD2孵育进行瓜氨酸化;依次进行MAA和瓜氨酸修饰生成双重修饰。最终经无菌过滤并检测内毒素。
Citrullinated and malondialdehyde-acetaldehyde modified fibrinogen activates macrophages and promotes an aggressive synovial fibroblast phenotype in patients with rheumatoid arthritis.
包含细胞系(U-937来源巨噬细胞)、原代细胞(PBMC来源巨噬细胞)、多种HFLS细胞(RA、OA、正常)刺激实验,以及功能验证(迁移、ECM沉积)和机制验证(信号通路、PDGF-BB)等至少两个独立证据层级。
PMA处理的U-937巨噬细胞(Mϕ) PBMC来源巨噬细胞(MP) HFLS-RA(类风湿关节炎滑膜成纤维细胞) HFLS-OA(骨关节炎滑膜成纤维细胞)
U-937细胞经100 ng/mL PMA分化24小时 巨噬细胞刺激浓度:25 μg/mL FIB蛋白 HFLS刺激条件:Mϕ-SN或MP-SN占总体积25% PDGF-BB处理浓度:10 ng/mL和5 pg/mL 信号通路检测时间点:1小时和4小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
生成未修饰和MAA、瓜氨酸单修饰及双重修饰的FIB抗原以刺激细胞。
将天然FIB与丙二醛和乙醛孵育进行MAA修饰;将天然或MAA修饰的FIB与PAD2孵育进行瓜氨酸化;依次进行MAA和瓜氨酸修饰生成双重修饰。最终经无菌过滤并检测内毒素。
产生经修饰FIB激活的巨噬细胞,收集其条件培养基(Mϕ-SN/MP-SN)。
U-937细胞用PMA分化为M0巨噬细胞,PBMCs用M-CSF分化为巨噬细胞,然后用未修饰或修饰FIB刺激,收集上清。
评估巨噬细胞上清或直接抗原刺激对HFLS细胞表型的影响。
将HFLS-RA、HFLS-OA和HFLS-对照细胞用Mϕ-SN、MP-SN(25%体积)或直接FIB抗原刺激,不同时间点进行后续分析。
筛选和验证与侵袭性表型相关的基因表达变化。
首先使用Nanostring纤维化panel筛选763个基因,选择上调最高的8个基因用RT-PCR验证。
评估修饰FIB或其巨噬细胞上清对HFLS细胞ECM蛋白沉积和形态的影响。
通过荧光免疫组化和Western blot检测波形蛋白和II型胶原沉积,并通过显微镜观察细胞形态。
评估巨噬细胞上清和直接抗原对HFLS-RA细胞迁移的影响。
通过划痕实验测量24小时伤口愈合面积。
鉴定巨噬细胞上清激活HFLS-RA细胞的关键信号通路。
通过Western blot检测JNK、Erk1/2、Akt、p38、paxillin和FAK的磷酸化水平。
定量巨噬细胞上清中PDGF-BB浓度,并验证其对HFLS-RA细胞表型的影响。
使用Meso Scale Discovery平台检测PDGF-BB浓度,并用重组PDGF-BB刺激HFLS-RA细胞检测ECM沉积和信号通路。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 制备修饰纤维蛋白原 | 纤维蛋白原(天然) | Cayman Chemical | -- |
| 肽基精氨酸脱亚氨酶2 | Sigma Aldrich | -- | |
| 大豆胰蛋白酶抑制剂 | Thermo Fisher | -- | |
| 巨噬细胞培养 | 佛波酯 | Sigma Aldrich | -- |
| 巨噬细胞集落刺激因子 | Thermo Fisher | -- | |
| PBMC分离 | SepMate PBMC分离管 | StemCell Technologies | -- |
| RNA提取 | RNeasy小型试剂盒 | Qiagen | -- |
| RT-PCR | 高效率RNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | -- |
| TaqMan基因表达预混液 | Applied Biosystems | -- | |
| 7500 Fast实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 荧光免疫组化 | Alexa Fluor 594标记的II型胶原抗体 | Bioss | -- |
| Cy5标记的波形蛋白抗体 | Bioss | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| Fluoromount-G封片剂 | SouthernBiotech | -- | |
| Zeiss 710 Meta共聚焦激光扫描显微镜 | Zeiss | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Thermo Fisher | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher | -- | |
| PVDF膜 | EMD Millipore Corp | -- | |
| 酪蛋白(2%) | Sigma Aldrich | -- | |
| 抗波形蛋白抗体(V9) | Abcam | -- | |
| 抗II型胶原抗体(5B2.5) | Novus Biologicals | -- | |
| 抗II型胶原抗体(多克隆) | EMD Millipore Corp | -- | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Novus Biologicals | -- | |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG | Jackson ImmunoResearch | -- | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG | Jackson ImmunoResearch | -- | |
| 化学发光试剂 | Thermo Fisher | -- | |
| KwikQuant成像仪 | Kindle Biosciences LLC | -- | |
| 信号通路检测 | 抗SAPK/JNK抗体(#9252) | Cell Signaling Technology | 9252 |
| 抗磷酸化SAPK/JNK (Thr183/Tyr185)抗体(#9251) | Cell Signaling Technology | 9251 | |
| 抗Erk1/2 (p44/42 MAPK)抗体(#9102) | Cell Signaling Technology | 9102 | |
| 抗磷酸化Erk1/2 (p44/42 MAPK; Thr202/Tyr204)抗体(#9101) | Cell Signaling Technology | 9101 | |
| 抗Akt抗体(#9272) | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| 抗磷酸化Akt (Ser473)抗体(#9271) | Cell Signaling Technology | 9271 | |
| 抗p38 MAPK抗体(#9212) | Cell Signaling Technology | 9212 | |
| 抗磷酸化p38 MAPK (Thr180/Tyr182)抗体(#4511) | Cell Signaling Technology | 4511 | |
| 抗桩蛋白抗体(#2542) | Cell Signaling Technology | 2542 | |
| 抗磷酸化桩蛋白 (Tyr118)抗体(#2541) | Cell Signaling Technology | 2541 | |
| 抗FAK抗体(#3285) | Cell Signaling Technology | 3285 | |
| 抗磷酸化FAK (Tyr397)抗体(#3283) | Cell Signaling Technology | 3283 | |
| PDGF-BB检测 | Meso Scale Discovery免疫分析平台 | Meso Scale Discovery | -- |
| Meso QuickPlex SQ 120成像仪 | Meso Scale Discovery | -- | |
| PDGF-BB刺激 | 血小板衍生生长因子-BB | Thermo Fisher | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 制备修饰纤维蛋白原 | MAA修饰浓度(2 mM丙二醛、1 mM乙醛)、孵育时间(3天)、温度(37°C);瓜氨酸化使用PAD2酶及孵育条件 阅读提示:Methods 2.1 |
| 巨噬细胞分化与刺激 | U-937细胞PMA浓度(100 ng/mL)和时间;PBMCs M-CSF浓度(100 ng/mL)和时间(7天);刺激浓度(25 μg/mL FIB)和时间(24、48小时) 阅读提示:Methods 2.2和2.3 |
| HFLS刺激 | 使用的Mϕ-SN/MP-SN体积比(25%)、刺激时间(8、24、48小时)、HFLS细胞类型(RA、OA、对照) 阅读提示:Methods 2.4 |
| 信号通路检测 | 刺激时间点(15分钟、30分钟、1小时、4小时)、抗体稀释度(文中未明确说明)、检测蛋白(JNK、Erk1/2、Akt、p38、paxillin、FAK) 阅读提示:Methods 2.8.2 |
| PDGF-BB功能验证 | PDGF-BB浓度(10 ng/mL和5 pg/mL)、刺激时间(1小时和48小时) 阅读提示:Methods 2.10 |