哺乳动物环状RNA通过靶向miR-24-3p/Igf2/PI3K-AKT-mTOR和Igf2bp2/Ucp1轴干扰脂质代谢重编程

Interference of a mammalian circRNA regulates lipid metabolism reprogramming by targeting miR-24-3p/Igf2/PI3K-AKT-mTOR and Igf2bp2/Ucp1 axis.

作者信息Jiahao Shao, Meigui Wang, Anjing Zhang, Zheliang Liu, Genglong Jiang, Tao Tang, Jie Wang, Xianbo Jia, Songjia Lai
PMID37587272
发布时间2023-08-17
DOI10.1007/s00018-023-04899-1

实验完整度

包含体外细胞实验(3T3-L1、原代前脂肪细胞、肝细胞)、动物模型(小鼠高脂饮食)和患者样本(肥胖兔组织),并进行功能验证(干扰/过表达)和机制验证(双荧光素酶、RIP、RNA测序等)。

主要模型

3T3-L1细胞 兔原代前脂肪细胞 昆明小鼠高脂饮食诱导肥胖模型 肥胖兔组织样本

重点核对

miR-24-3p agomir (HFD-A组) 或对照 agomir 通过尾静脉注射,剂量未明确说明但注射体积为100 μL,每三周一次,持续3周。 mmu_circ_0001874干扰使用eGFP标记的AAV-9 (1012 vg/mL) 经尾静脉注射100 μL。 高脂饮食诱导肥胖模型:3周或4周(急性)或14周(慢性)高脂饮食。 miR-24-3p mimic/inhibitor 转染浓度和具体方法未明确说明,但使用Lipofectamine 3000。 PA处理浓度为0.3 mmol/L,处理48小时。

摘要

白色脂肪组织(WAT)对于调节全身能量稳态非常重要。WAT的过度积累进一步导致肥胖和肥胖相关疾病的发生。然而,WAT脂质代谢重编程的更详细机制仍然难以捉摸。在这里,我们报道了肥胖小鼠WAT和肝脏中环状RNA(circRNA)mmu_circ_0001874的异常高表达。使用特异性腺相关病毒感染靶组织实现mmu_circ_0001874干扰,下调肥胖小鼠WAT和肝脏组织中的脂质积累。机制上,miR-24-3p直接与mmu_circ_0001874的脂质代谢效应相互作用,并通过靶向Igf2/PI3K-AKT-mTOR轴参与脂肪生成和脂质积累。此外,mmu_circ_0001874与Igf2bp2结合以与Ucp1相互作用,上调Ucp1翻译并增加产热以减少脂质积累。总之,我们的数据强调了circRNA在脂质代谢重编程中的生理作用,并提示mmu_circ_0001874/miR-24-3p/Igf2/PI3K-AKT-mTOR和mmu_circ_0001874/Igf2bp2/Ucp1轴可能代表控制肥胖中脂质积累的潜在机制。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
环状RNA mmu_circ_0001874如何通过调控miR-24-3p及相关通路影响白色脂肪组织和肝脏的脂质代谢重编程?
核心机制
mmu_circ_0001874作为miR-24-3p的海绵,解除miR-24-3p对Igf2的抑制,激活PI3K-AKT-mTOR通路促进脂肪生成;同时,mmu_circ_0001874与Igf2bp2结合,解除Igf2bp2对Ucp1翻译的抑制,增强产热。
主要证据
在细胞和动物模型中,干扰mmu_circ_0001874或过表达miR-24-3p降低脂质积累和炎症,改善葡萄糖耐量和胰岛素敏感性;双荧光素酶实验验证miR-24-3p与Igf2及mmu_circ_0001874的相互作用,RIP实验验证mmu_circ_0001874与Igf2bp2的直接结合。
研究意义
揭示了circRNA在脂质代谢重编程中的新机制,并提示mmu_circ_0001874/miR-24-3p/Igf2/PI3K-AKT-mTOR和mmu_circ_0001874/Igf2bp2/Ucp1轴可能作为控制肥胖脂质积累的潜在治疗靶点。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

关联分析miR-24-3p与脂质代谢

验证miR-24-3p在肥胖模型中的表达及其与脂质代谢指标的相关性。

在肥胖兔模型和细胞模型中检测miR-24-3p表达,并进行相关性分析。条件包括高脂饮食诱导的肥胖兔、正常/肥胖兔的前脂肪细胞和脂肪组织;使用qRT-PCR、Western blot和血清生化指标。

2

细胞功能验证miR-24-3p

探究miR-24-3p对前脂肪细胞增殖和分化的影响。

在兔原代前脂肪细胞中过表达或抑制miR-24-3p,检测增殖和分化标志物表达。条件包括miR-24-3p mimic/inhibitor转染,CCK-8、EDU增殖检测,Western blot检测分化标志物。

3

体内过表达miR-24-3p验证功能

验证miR-24-3p过表达对高脂饮食诱导肥胖的抵抗作用。

通过尾静脉注射miR-24-3p agomir建立过表达模型,检测体重、血脂、组织学、葡萄糖耐量等指标。条件包括3周高脂饮食,每三周注射一次agomir,共四次。

4

鉴定Igf2为miR-24-3p靶基因

验证Igf2是miR-24-3p直接靶基因,并参与脂质合成。

通过RNA测序、生信预测、双荧光素酶报告实验验证miR-24-3p与Igf2的靶向关系;在3T3-L1细胞中敲低或过表达Igf2检测脂质代谢相关分子。

5

筛选并验证mmu_circ_0001874为miR-24-3p海绵

发现并验证circRNA mmu_circ_0001874作为miR-24-3p的ceRNA。

通过circRNA测序筛选与miR-24-3p结合的circRNA,并通过双荧光素酶、FISH、RNase R处理验证其环状结构和相互作用。

6

干扰mmu_circ_0001874验证体内外脂质代谢影响

评估干扰mmu_circ_0001874对脂质积累的影响,并验证其治疗肥胖的潜力。

在3T3-L1细胞中敲低mmu_circ_0001874检测脂质积累;通过AAV介导的肝和脂肪组织特异性敲低,评估对高脂饮食诱导肥胖的预防和治疗效果。

7

验证mmu_circ_0001874与Igf2bp2相互作用

验证mmu_circ_0001874与Igf2bp2直接结合,并调节Ucp1表达影响产热。

通过RIP和FISH验证直接结合;在细胞中敲低Igf2bp2和/或mmu_circ_0001874,检测Ucp1表达和脂质积累。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
Trizol试剂Qualityard Bio--
RT Easy™ II(含gDNase)FOREGENE--
Mir-X™ miRNA第一链合成试剂盒Takara--
EvaGREEN 2× qPCR预混液ABM Inc.--
CFX96实时荧光定量PCR仪Bio-Rad--
ProteinExt®哺乳动物总蛋白提取试剂盒TransGen Biotech--
核蛋白提取试剂盒Solarbio--
Bradford蛋白定量试剂盒Novoprotein--
SurePAGE预制胶GenScript Corporation--
ECL化学发光试剂HAKATA--
PVDF膜----
PureBinding® RNA免疫沉淀试剂盒GENESEED--
RNA FISH试剂盒BersinBio--
DMEM培养基VivaCell--
胎牛血清ExCell Bio--
地塞米松Solarbio--
3-异丁基-1-甲基黄嘌呤Solarbio--
胰岛素Solarbio--
棕榈酸Sigma--
牛血清白蛋白Sigma--
Lipofectamine 3000转染试剂Invitrogen--
细胞计数试剂盒Zomanbio--
5-乙炔基-2'-脱氧尿苷RiboBio--
Duo-Lite™荧光素酶检测系统Vazyme--
NEBNext® Ultra™ RNA文库制备试剂盒(Illumina)New England BioLabs--
Illumina NovaSeq 6000测序平台Illumina--
TG、TC、HDL-C、LDL-C酶法比色试剂盒Jiancheng--
兔ELISA试剂盒(瘦素、脂联素、IL-6、IL-1β、TNF-α)Shanghai Hengyuan biotechnology Co., Ltd--
小鼠ELISA试剂盒(瘦素、脂联素、IL-6、IL-1β、TNF-α)Quanzhou Ruixin biotechnology Co., Ltd--
miR-24-3p agomirRiboBio--
对照agomirRiboBio--
eGFP标记的AAV-9(用于干扰mmu_circ_0001874)Hanbio Tech--
Igf2bp2抗体Proteintech11601-1-AP
Ucp1抗体Proteintech23673-1-AP
PCNA抗体Proteintech10205-2-AP
LPIN1抗体Proteintech27026-1-AP
Fsp27抗体Biossbs-6796R
PPARG抗体AbclonalA0270
CEBPA抗体AbclonalA0904
FABP4抗体AbclonalA0232
SCD抗体AbclonalA16429
mTOR抗体Zen bioscience380411
磷酸化mTOR抗体Zen bioscience381557
AKT抗体Zen bioscience382804
磷酸化AKT抗体Zen bioscience310021
PI3K抗体Zen bioscience251221
SREBP1抗体Zen bioscience347061
IL-1β抗体Zen bioscience511369
TNF-α抗体Zen bioscience346654
β-actin抗体Zen bioscience380624
Igf2抗体Zen bioscience820814
FASN抗体Zen bioscience31582
IL-6抗体Zen bioscience347023
免疫组织荧光染色用抗体Wuhan Servicebio Technology Co., Ltd--
Igf2bp2/IMP2兔多抗Proteintech--
兔多抗对照IgGAbclonal--
血糖仪Sinocare--
葡萄糖Sigma--
胰岛素Wanbang Biopharma--
切片机RM2235Leica--
倒置荧光显微镜Olympus--
CO2培养箱Thermo Fisher Scientific--
酶标仪Thermo Fisher Scientific--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
动物模型建立
小鼠品系、性别、周龄(21日龄雄性昆明小鼠);高脂饮食喂养时间(3周、4周或14周);AAV-9剂量(1012 vg/mL,100 μL);miR-24-3p agomir剂量(未明确说明体积/剂量,文中提及100 μL但未提浓度)。
阅读提示:Materials and methods: Animals; Figure legends 3, 6, S6
细胞培养与分化
细胞类型(3T3-L1、兔原代前脂肪细胞);分化培养基组分(DEX、IBMX、胰岛素浓度);PA处理浓度(0.3 mmol/L)和处理时间(48小时)。
阅读提示:Materials and methods: Cell culture and transfection, Establish the hypertrophic cells model
基因干扰与过表达
siRNA序列(si-circ-2、si-Igf2-2、si-Igf2bp2)和转染试剂(Lipofectamine 3000)浓度(未明确说明);质粒(pcDNA3.1-Igf2)转染浓度。
阅读提示:Materials and methods: Cell culture and transfection; Supplementary Table S2-A
分子机制验证
双荧光素酶报告实验中所用质粒(Igf2 WT/mut、mmu_circ_0001874 WT/mut)和共转染比例(未明确说明);RIP实验所用抗体(Igf2bp2抗体)和细胞裂解液量。
阅读提示:Materials and methods: Dual-luciferase reporter assay, RNA immunoprecipitation
生化指标检测
血清TG、TC、HDL-C、LDL-C检测试剂盒;ELISA试剂盒(leptin、adiponectin、IL-6、IL-1β、TNF-α)来源和操作步骤。
阅读提示:Materials and methods: Measure of blood fat and ELISA analysis
代谢功能评估
GTT和ITT注射剂量(葡萄糖1.5 g/kg,胰岛素0.5 IU/kg);测量时间点(0, 15, 30, 60, 120分钟)。
阅读提示:Materials and methods: Glucose tolerance test and insulin tolerance test