关联分析miR-24-3p与脂质代谢
验证miR-24-3p在肥胖模型中的表达及其与脂质代谢指标的相关性。
在肥胖兔模型和细胞模型中检测miR-24-3p表达,并进行相关性分析。条件包括高脂饮食诱导的肥胖兔、正常/肥胖兔的前脂肪细胞和脂肪组织;使用qRT-PCR、Western blot和血清生化指标。
Interference of a mammalian circRNA regulates lipid metabolism reprogramming by targeting miR-24-3p/Igf2/PI3K-AKT-mTOR and Igf2bp2/Ucp1 axis.
包含体外细胞实验(3T3-L1、原代前脂肪细胞、肝细胞)、动物模型(小鼠高脂饮食)和患者样本(肥胖兔组织),并进行功能验证(干扰/过表达)和机制验证(双荧光素酶、RIP、RNA测序等)。
3T3-L1细胞 兔原代前脂肪细胞 昆明小鼠高脂饮食诱导肥胖模型 肥胖兔组织样本
miR-24-3p agomir (HFD-A组) 或对照 agomir 通过尾静脉注射,剂量未明确说明但注射体积为100 μL,每三周一次,持续3周。 mmu_circ_0001874干扰使用eGFP标记的AAV-9 (1012 vg/mL) 经尾静脉注射100 μL。 高脂饮食诱导肥胖模型:3周或4周(急性)或14周(慢性)高脂饮食。 miR-24-3p mimic/inhibitor 转染浓度和具体方法未明确说明,但使用Lipofectamine 3000。 PA处理浓度为0.3 mmol/L,处理48小时。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证miR-24-3p在肥胖模型中的表达及其与脂质代谢指标的相关性。
在肥胖兔模型和细胞模型中检测miR-24-3p表达,并进行相关性分析。条件包括高脂饮食诱导的肥胖兔、正常/肥胖兔的前脂肪细胞和脂肪组织;使用qRT-PCR、Western blot和血清生化指标。
探究miR-24-3p对前脂肪细胞增殖和分化的影响。
在兔原代前脂肪细胞中过表达或抑制miR-24-3p,检测增殖和分化标志物表达。条件包括miR-24-3p mimic/inhibitor转染,CCK-8、EDU增殖检测,Western blot检测分化标志物。
验证miR-24-3p过表达对高脂饮食诱导肥胖的抵抗作用。
通过尾静脉注射miR-24-3p agomir建立过表达模型,检测体重、血脂、组织学、葡萄糖耐量等指标。条件包括3周高脂饮食,每三周注射一次agomir,共四次。
验证Igf2是miR-24-3p直接靶基因,并参与脂质合成。
通过RNA测序、生信预测、双荧光素酶报告实验验证miR-24-3p与Igf2的靶向关系;在3T3-L1细胞中敲低或过表达Igf2检测脂质代谢相关分子。
发现并验证circRNA mmu_circ_0001874作为miR-24-3p的ceRNA。
通过circRNA测序筛选与miR-24-3p结合的circRNA,并通过双荧光素酶、FISH、RNase R处理验证其环状结构和相互作用。
评估干扰mmu_circ_0001874对脂质积累的影响,并验证其治疗肥胖的潜力。
在3T3-L1细胞中敲低mmu_circ_0001874检测脂质积累;通过AAV介导的肝和脂肪组织特异性敲低,评估对高脂饮食诱导肥胖的预防和治疗效果。
验证mmu_circ_0001874与Igf2bp2直接结合,并调节Ucp1表达影响产热。
通过RIP和FISH验证直接结合;在细胞中敲低Igf2bp2和/或mmu_circ_0001874,检测Ucp1表达和脂质积累。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 基因表达分析 | Trizol试剂 | Qualityard Bio | -- |
| 逆转录 | RT Easy™ II(含gDNase) | FOREGENE | -- |
| Mir-X™ miRNA第一链合成试剂盒 | Takara | -- | |
| qPCR | EvaGREEN 2× qPCR预混液 | ABM Inc. | -- |
| CFX96实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| 蛋白质提取 | ProteinExt®哺乳动物总蛋白提取试剂盒 | TransGen Biotech | -- |
| 核蛋白提取试剂盒 | Solarbio | -- | |
| 蛋白定量 | Bradford蛋白定量试剂盒 | Novoprotein | -- |
| Western blot | SurePAGE预制胶 | GenScript Corporation | -- |
| ECL化学发光试剂 | HAKATA | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| RNA免疫沉淀 | PureBinding® RNA免疫沉淀试剂盒 | GENESEED | -- |
| 荧光原位杂交 | RNA FISH试剂盒 | BersinBio | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | VivaCell | -- |
| 胎牛血清 | ExCell Bio | -- | |
| 细胞分化 | 地塞米松 | Solarbio | -- |
| 3-异丁基-1-甲基黄嘌呤 | Solarbio | -- | |
| 胰岛素 | Solarbio | -- | |
| 细胞处理 | 棕榈酸 | Sigma | -- |
| 牛血清白蛋白 | Sigma | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 细胞增殖检测 | 细胞计数试剂盒 | Zomanbio | -- |
| 5-乙炔基-2'-脱氧尿苷 | RiboBio | -- | |
| 双荧光素酶报告实验 | Duo-Lite™荧光素酶检测系统 | Vazyme | -- |
| RNA-seq建库 | NEBNext® Ultra™ RNA文库制备试剂盒(Illumina) | New England BioLabs | -- |
| RNA-seq测序 | Illumina NovaSeq 6000测序平台 | Illumina | -- |
| 生化指标检测 | TG、TC、HDL-C、LDL-C酶法比色试剂盒 | Jiancheng | -- |
| ELISA | 兔ELISA试剂盒(瘦素、脂联素、IL-6、IL-1β、TNF-α) | Shanghai Hengyuan biotechnology Co., Ltd | -- |
| 小鼠ELISA试剂盒(瘦素、脂联素、IL-6、IL-1β、TNF-α) | Quanzhou Ruixin biotechnology Co., Ltd | -- | |
| 动物处理 | miR-24-3p agomir | RiboBio | -- |
| 对照agomir | RiboBio | -- | |
| eGFP标记的AAV-9(用于干扰mmu_circ_0001874) | Hanbio Tech | -- | |
| 抗体 | Igf2bp2抗体 | Proteintech | 11601-1-AP |
| Ucp1抗体 | Proteintech | 23673-1-AP | |
| PCNA抗体 | Proteintech | 10205-2-AP | |
| LPIN1抗体 | Proteintech | 27026-1-AP | |
| Fsp27抗体 | Bioss | bs-6796R | |
| PPARG抗体 | Abclonal | A0270 | |
| CEBPA抗体 | Abclonal | A0904 | |
| FABP4抗体 | Abclonal | A0232 | |
| SCD抗体 | Abclonal | A16429 | |
| mTOR抗体 | Zen bioscience | 380411 | |
| 磷酸化mTOR抗体 | Zen bioscience | 381557 | |
| AKT抗体 | Zen bioscience | 382804 | |
| 磷酸化AKT抗体 | Zen bioscience | 310021 | |
| PI3K抗体 | Zen bioscience | 251221 | |
| SREBP1抗体 | Zen bioscience | 347061 | |
| IL-1β抗体 | Zen bioscience | 511369 | |
| TNF-α抗体 | Zen bioscience | 346654 | |
| β-actin抗体 | Zen bioscience | 380624 | |
| Igf2抗体 | Zen bioscience | 820814 | |
| FASN抗体 | Zen bioscience | 31582 | |
| IL-6抗体 | Zen bioscience | 347023 | |
| 免疫组织荧光染色 | 免疫组织荧光染色用抗体 | Wuhan Servicebio Technology Co., Ltd | -- |
| RNA免疫沉淀 | Igf2bp2/IMP2兔多抗 | Proteintech | -- |
| 兔多抗对照IgG | Abclonal | -- | |
| 血糖检测 | 血糖仪 | Sinocare | -- |
| 葡萄糖耐量试验 | 葡萄糖 | Sigma | -- |
| 胰岛素耐量试验 | 胰岛素 | Wanbang Biopharma | -- |
| 切片 | 切片机RM2235 | Leica | -- |
| 显微镜 | 倒置荧光显微镜 | Olympus | -- |
| 细胞培养 | CO2培养箱 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 细胞增殖检测 | 酶标仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 小鼠品系、性别、周龄(21日龄雄性昆明小鼠);高脂饮食喂养时间(3周、4周或14周);AAV-9剂量(1012 vg/mL,100 μL);miR-24-3p agomir剂量(未明确说明体积/剂量,文中提及100 μL但未提浓度)。 阅读提示:Materials and methods: Animals; Figure legends 3, 6, S6 |
| 细胞培养与分化 | 细胞类型(3T3-L1、兔原代前脂肪细胞);分化培养基组分(DEX、IBMX、胰岛素浓度);PA处理浓度(0.3 mmol/L)和处理时间(48小时)。 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and transfection, Establish the hypertrophic cells model |
| 基因干扰与过表达 | siRNA序列(si-circ-2、si-Igf2-2、si-Igf2bp2)和转染试剂(Lipofectamine 3000)浓度(未明确说明);质粒(pcDNA3.1-Igf2)转染浓度。 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and transfection; Supplementary Table S2-A |
| 分子机制验证 | 双荧光素酶报告实验中所用质粒(Igf2 WT/mut、mmu_circ_0001874 WT/mut)和共转染比例(未明确说明);RIP实验所用抗体(Igf2bp2抗体)和细胞裂解液量。 阅读提示:Materials and methods: Dual-luciferase reporter assay, RNA immunoprecipitation |
| 生化指标检测 | 血清TG、TC、HDL-C、LDL-C检测试剂盒;ELISA试剂盒(leptin、adiponectin、IL-6、IL-1β、TNF-α)来源和操作步骤。 阅读提示:Materials and methods: Measure of blood fat and ELISA analysis |
| 代谢功能评估 | GTT和ITT注射剂量(葡萄糖1.5 g/kg,胰岛素0.5 IU/kg);测量时间点(0, 15, 30, 60, 120分钟)。 阅读提示:Materials and methods: Glucose tolerance test and insulin tolerance test |