患者队列和基因突变鉴定
鉴定导致男性不育的基因突变
对两名不育兄弟进行全外显子测序和Sanger测序,发现CT55基因的半合子无义突变。
Deficiency of cancer/testis antigen gene CT55 causes male infertility in humans and mice.
包括患者临床观察、WES、精子形态学(SEM/TEM)、小鼠KO模型、IVF、蛋白质组学、Co-IP、自噬功能验证等。
两名不育男性患者 Ct55敲除小鼠 HEK293T细胞 K562细胞
患者CT55 c.465T>A (p.Y155*)突变 Ct55敲除小鼠模型 精子形态学和超微结构分析 自噬标志物 LC3, p62, LAMP2, GABARAP 体外受精和卵丘扩散实验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定导致男性不育的基因突变
对两名不育兄弟进行全外显子测序和Sanger测序,发现CT55基因的半合子无义突变。
评估患者精子形态和超微结构异常
通过精子分析、Papanicolaou染色、SEM和TEM观察精子形态和超微结构,发现精子个体化失败、胞质残留、顶体缺陷和鞭毛异常。
验证Ct55缺失对小鼠生育能力的影响
通过CRISPR-Cas9构建Ct55敲除小鼠,观察其生育力、精子形态和运动能力,并进行IVF和卵丘扩散实验。
揭示CT55调控精子发生的分子机制
通过TMT蛋白质组学、Western blot、免疫荧光和Co-IP等方法,发现CT55通过调控自噬过程影响精子发生。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 全外显子测序 | QIAamp DNA血液迷你试剂盒 | QIAGEN | 51104 |
| Agilent SureSelect人全外显子V6试剂盒 | Agilent | -- | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Thermo Fisher | 15596026 |
| RT-qPCR | SuperScript™ IV逆转录酶 | Thermo Fisher | 18090010 |
| SYBR Green混合液 | Sigma-Aldrich | KCQS00 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | 11965092 |
| RPMI 1640培养基 | Gibco | C11875500BT | |
| 胎牛血清 | Sigma | F8318 | |
| 质粒转染 | jet PRIME转染试剂 | Polyplus | PT-114-15 |
| 病毒转染 | 聚凝胺 | Solarbio | H8761 |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Biomake | B14012 | |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo | 23227 |
| PVDF膜 | Millipore | ISEQ00010, | |
| ECL HRP底物 | Millipore | WBKLS0500 | |
| Co-IP | Protein A/G磁珠 | Thermo Fisher | 88804 |
| Western blot | SDS上样缓冲液 | Biosharp | BC502A |
| 免疫荧光 | 4',6-二脒基-2-苯基吲哚 | Sigma-Aldrich | D9542-1MG |
| Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher | A21206 | |
| Alexa Fluor 594 | Thermo Fisher | A11005 | |
| 卵丘扩散实验 | 透明质酸酶 | Sigma | 37326-33-3 |
| 芹菜素 | TargetMOI | T2175 | |
| 卵丘穿透实验 | Hoechst 33342 | Solarbio | C0031 |
| 精子DNA片段染色 | 精子DNA片段染色试剂盒 | Puhua Biotechnology Co., Ltd | SP001 |
| 免疫荧光 | 花生凝集素 | Vector | RL-1072-5 |
| 蛋白表达 | CT55抗体 | AVIVA SYSTEMS BIOLOGY | ARP70088_P050 |
| Western blot | GAPDH抗体 | Abcam | ab181602 |
| LAMP2抗体 | Proteintech | 66301-1-Ig | |
| GABARAP抗体 | Proteintech | 18723-1-AP | |
| LC3抗体 | Cell Signaling | 4108 | |
| p62抗体 | Proteintech | 18420-1-AP | |
| FLAG抗体 | Thermo Fisher | MA1-91878 | |
| SPAM1抗体 | Abclonal | A2120 | |
| ACR抗体 | Bioss | bs-5151R |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者基因突变检测 | 患者CT55 c.465T>A (p.Y155*)突变存在与否 阅读提示:见Materials and methods中Whole-exome sequencing和Sanger sequencing部分,以及Table 1。 |
| 小鼠模型构建 | Ct55敲除小鼠的构建方法(删除外显子2-4) 阅读提示:见Materials and methods中Generation of Ct55 knock out mouse models部分。 |
| 精子表型分析 | 精子形态和超微结构评估方法(SEM、TEM、CASA) 阅读提示:见Materials and methods中SEM、TEM、CASA部分和Results中相应描述。 |
| 体外功能实验 | IVF和卵丘扩散实验的详细条件 阅读提示:见Materials and methods中IVF、Cumulus cell dispersal assay和Cumulus penetration assay部分。 |
| 分子机制研究 | 自噬相关蛋白表达检测(LC3, p62, LAMP2, GABARAP) 阅读提示:见Results中Fig. 7和对应文字描述,以及Materials and methods中Western blot和Co-IP部分。 |