细胞培养与处理
建立高糖和LPS联合处理MDBK细胞的体外模型,观察对细胞活力的影响。
MDBK细胞培养在含不同浓度葡萄糖(5.5 mM或25.5 mM)和不同浓度LPS(0、1、2、5 μg/mL)的培养基中处理24小时。
The combination of high glucose and LPS induces autophagy in bovine kidney epithelial cells via the Notch3/mTOR signaling pathway.
研究包含体外细胞实验(MDBK细胞)和多种检测技术(Western blot、qRT-PCR、免疫荧光、TEM),并进行了机制验证(Notch3抑制剂),但缺乏动物模型和患者样本,因此实验完整度评为中。
MDBK牛肾细胞
细胞处理:5.5 mM或25.5 mM葡萄糖与0、1、2、5 μg/mL LPS共处理24小时 自噬检测:Western blot检测LC3-II/I、Beclin1、p62蛋白水平 Notch3/mTOR通路验证:Western blot检测Notch3、p-mTOR蛋白水平 抑制剂处理:10 μM DAPT预处理6小时,再刺激24小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立高糖和LPS联合处理MDBK细胞的体外模型,观察对细胞活力的影响。
MDBK细胞培养在含不同浓度葡萄糖(5.5 mM或25.5 mM)和不同浓度LPS(0、1、2、5 μg/mL)的培养基中处理24小时。
评估高糖和LPS联合处理是否诱导MDBK细胞自噬。
通过Western blot和qRT-PCR检测自噬相关蛋白(LC3-II/I、Beclin1、p62)的表达,并通过免疫荧光检测LC3荧光信号。
探讨Notch3和mTOR信号通路在高糖和LPS诱导的自噬中的作用。
通过Western blot和qRT-PCR检测Notch3、mTOR、p-mTOR的表达。
验证Notch3是否通过mTOR信号通路介导高糖和LPS诱导的自噬。
使用Notch3抑制剂DAPT预处理细胞,检测自噬相关蛋白和mTOR磷酸化水平的变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12(HAM)培养基 | Biological Industries | -- |
| 低糖DMEM培养基 | Biological Industries | -- | |
| 高糖DMEM培养基 | Biological Industries | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Solarbio | -- | |
| 药物处理 | 脂多糖 | Solarbio | -- |
| DAPT | Selleck | -- | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂盒 | -- | -- |
| qRT-PCR | SYBR Premix Ex Taq II | Takara | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Solarbio | -- |
| BCA蛋白检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| Notch3抗体 | affinity | -- | |
| mTOR抗体 | Bioss | bs-1992R | |
| p-mTOR抗体 | Affinity | AF3308 | |
| LC3A抗体 | Novus Biologicals | NB100-2331 | |
| p62抗体 | GeneTex | GTX100685 | |
| Beclin1抗体 | CST | 3495T | |
| HRP标记的山羊抗兔二抗 | Solarbio | SE134 | |
| ECL化学发光检测系统 | Tanon-5200 | -- | |
| 免疫荧光 | TritonX-100 | Servicebio | -- |
| 牛血清白蛋白 | Servicebio | -- | |
| CY3荧光染料 | Servicebio | GB21303 | |
| DAPI染色液 | Servicebio | -- | |
| 免疫荧光观察 | 尼康ECLIPSE C1显微镜 | NIKON | -- |
| 透射电镜 | Epon环氧树脂 | Chengdu Rongshengke Biotechnology Co., Ltd | -- |
| 0.1%柠檬酸铅 | Chengdu Rongshengke Biotechnology Co., Ltd | -- | |
| 10%醋酸铀 | Chengdu Rongshengke Biotechnology Co., Ltd | -- | |
| 透射电镜观察 | JEM-1400PLUS透射电子显微镜 | JEOL | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | MDBK细胞来源、培养基类型、葡萄糖浓度(5.5 mM和25.5 mM)、LPS浓度(0、1、2、5 μg/mL)、处理时间(24小时) 阅读提示:详见Materials and methods中的Cell culture部分 |
| 细胞活力检测 | 细胞接种密度(2×10^5 cells)、处理时间(24小时)、CCK-8试剂盒操作 阅读提示:详见Materials and methods中的CCK-8 assay部分 |
| 自噬检测 | Western blot检测的蛋白(LC3-II/I、Beclin1、p62)、qRT-PCR检测的基因(LC3B、Beclin1、p62)、免疫荧光检测的LC3荧光 阅读提示:详见Materials and methods中的Western blot、qRT-PCR和Immunofluorescence部分 |
| 信号通路验证 | Notch3、mTOR、p-mTOR蛋白和mRNA表达 阅读提示:详见Materials and methods中的Western blot和qRT-PCR部分 |
| 机制验证 | DAPT浓度(10 μM)、预处理时间(6小时)、HG和LPS刺激浓度(25.5 mM葡萄糖和5 μg/mL LPS)、处理时间(24小时) 阅读提示:详见Figure 4 legend及Materials and methods中的Cell culture部分 |