检测M. hyopneumoniae感染诱导自噬
验证M. hyopneumoniae感染能否诱导PAM产生自噬体并上调自噬相关蛋白表达。
用TEM观察自噬体超微结构;Western blot检测LC3-II、Atg5、Atg12-Atg5、Beclin1表达;免疫荧光检测LC3斑点及与细菌共定位。
Incomplete autophagy promotes the proliferation of Mycoplasma hyopneumoniae through the JNK and Akt pathways in porcine alveolar macrophages.
包含原代PAM和3D4/21细胞模型的体外实验,结合免疫荧光、Western blot、TEM等验证自噬流阻断和信号通路,并利用自噬调节剂和抑制剂进行功能验证。
原代猪肺泡巨噬细胞(PAMs) 猪肺泡巨噬细胞系3D4/21
感染剂量:MOI 200用于自噬检测,MOI 2和200用于增殖检测 自噬调节剂浓度:3-MA 5mmol/L,Rap 1000nmol/L,HCQ 25μmol/L,BAF 200nmol/L 信号通路抑制剂浓度:PD98059、SP600125、LY294002均为10mmol/L 检测时间点:感染后0-12小时,关键时间点包括3h、6h、9h、12h 对照设置:包括未感染、EBSS饥饿诱导完全自噬、HCQ/BAF处理阻断自噬流
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证M. hyopneumoniae感染能否诱导PAM产生自噬体并上调自噬相关蛋白表达。
用TEM观察自噬体超微结构;Western blot检测LC3-II、Atg5、Atg12-Atg5、Beclin1表达;免疫荧光检测LC3斑点及与细菌共定位。
确定M. hyopneumoniae感染是否导致自噬体与溶酶体融合受阻,形成不完全自噬。
使用自噬抑制剂HCQ和BAF处理感染细胞,检测LC3-II积累;验证p62积累;使用Ad-mRFP-GFP-LC3串联报告病毒检测自噬体与溶酶体融合;免疫荧光检测LC3与LAMP2共定位。
评估自噬不同阶段(起始、自噬体形成、自噬体-溶酶体融合)对M. hyopneumoniae胞内存活和增殖的影响。
使用3-MA、雷帕霉素、HCQ、BAF处理感染细胞,检测P97蛋白表达和细菌CCU。
确定哪些信号通路(Erk1/2、JNK、p38、Akt)介导M. hyopneumoniae诱导的自噬。
检测感染后不同时间点Erk1/2、JNK、p38、Akt的磷酸化水平;使用特异性抑制剂(PD98059、SP600125、LY294002)预处理,检测自噬标志蛋白LC3-II和Beclin1表达及LC3斑点数。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫检测 | LC3B多克隆抗体 | GeneTex | GTX127375 |
| ATG5多克隆抗体 | Novus Biologicals | NBP2-24389 | |
| ATG5多克隆抗体 | Novus Biologicals | NB110-53818 | |
| Beclin 1多克隆抗体 | Novus Biologicals | NB110-87318 | |
| p62多克隆抗体 | Novus Biologicals | NBP1-48320 | |
| β-actin抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| p38 MAPK抗体 | Proteintech | 66234-4-Ig | |
| LAMP2抗体 | Proteintech | 66301-1 | |
| Erk1/2抗体 | Proteintech | 16443-1-AP | |
| JNK抗体 | Biosynthesis Biotechnology | bs-2592R | |
| p-JNK抗体 | Biosynthesis Biotechnology | bs-1640R | |
| p-Erk1/2抗体 | Biosynthesis Biotechnology | bs-3016R | |
| p-p38 MAPK抗体 | Biosynthesis Biotechnology | bs-2210R | |
| Akt抗体 | Biosynthesis Biotechnology | bs-0115R | |
| p-Akt抗体 | Biosynthesis Biotechnology | bs-5182R | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG | Biosharp | BL003A | |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG | Solarbio | SE131 | |
| CoraLite594标记的驴抗兔IgG | Proteintech | SA00006-8 | |
| Alexa Fluor 488标记的山羊抗小鼠IgG | Proteintech | SA00006-1 | |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG | Biosynthesis Biotechnology | bs-0296G-HRP | |
| 信号通路抑制 | PD98059 | Beyotime Biotechnology | S1805 |
| SP600125 | Beyotime Biotechnology | S1876 | |
| LY294002 | Beyotime Biotechnology | S1737 | |
| 细胞染色 | Hoechst 33342 | Beyotime Biotechnology | C1028 |
| 自噬监测 | Ad-mRFP-GFP-LC3腺病毒 | Hanbio | HB-AP2100001 |
| 自噬诱导 | 雷帕霉素 | Sigma-Aldrich | V900930 |
| 自噬抑制 | 硫酸羟氯喹 | Selleck | S4430 |
| 3-甲基腺嘌呤 | Selleck | S2767 | |
| 巴弗洛霉素A1 | APExBIO | A8627 | |
| 免疫检测 | P97单克隆抗体 | -- | -- |
| Mhp366多克隆抗体 | -- | -- | |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| EBSS培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 细菌培养 | KM2培养基 | -- | -- |
| 细胞处理 | 庆大霉素 | -- | -- |
| 蛋白提取 | 细胞裂解液 | -- | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | -- | -- |
| 蛋白检测 | SDS-PAGE上样缓冲液 | -- | -- |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| ECL化学发光检测试剂盒 | -- | -- | |
| 细胞活性检测 | CCK-8细胞增殖/毒性检测试剂盒 | Solarbio | CA1210 |
| 电镜观察 | 透射电子显微镜(JEM-1400PLUS) | JEOL Ltd. | -- |
| 荧光观察 | 荧光显微镜(Olympus IX71) | Olympus | -- |
| 光密度测量 | xMark酶标仪 | Bio-Rad | -- |
| 蛋白成像 | ChemiDoc XRS+成像系统 | Bio-Rad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与感染 | 细胞系来源(3D4/21, ATCC CRL-2843),PAM分离方法(支气管肺泡灌洗),感染剂量(MOI 2和200),感染时间(3h, 6h, 9h, 12h),培养基成分(RPMI 1640、DMEM、EBSS)及添加剂(FBS、抗生素) 阅读提示:Materials and methods: Porcine alveolar macrophages, M. hyopneumoniae strain and cell culture |
| 自噬调节剂处理 | 3-MA、雷帕霉素、HCQ和BAF的最适工作浓度(分别为5mM, 1000nM, 25μM, 200nM),处理时间(6h, 3h/6h, 4h等),溶剂(DMSO等),细胞毒性检测(CCK-8) 阅读提示:Materials and methods: Optimal concentrations of autophagy regulators and cytotoxicity assay, Drug treatments |
| 自噬流检测 | LC3-II和p62蛋白表达水平,自噬体-溶酶体融合(Ad-mRFP-GFP-LC3、LC3与LAMP2共定位),自噬体超微结构(TEM) 阅读提示:Materials and methods: Transmission electron microscopy, Indirect immunofluorescence assay, Western blotting; Results: 图3, 4, 5 |
| 信号通路分析 | Erk1/2、JNK、p38、Akt的磷酸化水平,抑制剂(PD98059、SP600125、LY294002)浓度(10mM),预处理时间(1h),感染时间(9h) 阅读提示:Materials and methods: Drug treatments; Results: 图7, 8, 9 |
| 细菌定量 | 胞内细菌数量测定方法(CCU计数),庆大霉素处理浓度(100μg/mL)和时间(2h),细胞裂解方法(超声等) 阅读提示:Materials and methods: Drug treatments; Results: 图6 |