体内药效评估
验证MOBT在BLM诱导的肺纤维化小鼠模型中的抗纤维化效果
C57BL/6小鼠气管内喷雾BLM(5 mg/kg)诱导肺纤维化,MOBT组从第8天起口服30 mg/kg每日一次,第28天进行MicroCT、肺功能、H&E、Masson染色及Western blot检测。
MOBT Alleviates Pulmonary Fibrosis through an lncITPF-hnRNP-l-Complex-Mediated Signaling Pathway.
包含体内小鼠模型、体外细胞模型、患者样本以及多组学机制验证(ChIP-seq、RNA-seq、RIP、ChIP-PCR、RNA-FISH等)。
博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 TGF-β1激活的人胚肺成纤维细胞MRC-5 IPF患者肺组织样本
BLM剂量5 mg/kg,气管内喷雾给药;MOBT口服剂量30 mg/kg,从第8天起每日给药 TGF-β1激活MRC-5细胞模型:5 ng/mL TGF-β1处理24小时,随后10 μg/mL MOBT共处理48小时 lncITPF过表达或敲低对MOBT功能的影响(RTCA增殖和迁移实验) hnRNP L敲低对MOBT调控MEF2c的影响 Smad2/3磷酸化水平和lncITPF启动子区Smad2/3富集的检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证MOBT在BLM诱导的肺纤维化小鼠模型中的抗纤维化效果
C57BL/6小鼠气管内喷雾BLM(5 mg/kg)诱导肺纤维化,MOBT组从第8天起口服30 mg/kg每日一次,第28天进行MicroCT、肺功能、H&E、Masson染色及Western blot检测。
验证MOBT对TGF-β1激活的MRC-5细胞的抗纤维化作用
MRC-5细胞用TGF-β1(5 ng/mL)处理24小时,然后加MOBT(10 μg/mL)共处理48小时,Western blot检测纤维化标志物。
探究MOBT调控lncITPF表达的分子机制
通过RNA-FISH检测lncITPF定位,qRT-PCR检测表达,半衰期实验检测稳定性,ChIP-PCR检测Smad2/3在启动子区的结合,Western blot检测Smad2/3磷酸化。
鉴定lncITPF–hnRNP L复合物调控的靶基因
通过RIP实验发现hnRNP L与pre-mMEF2c结合,Western blot检测MEF2c表达,并进一步通过ChIP-seq和RNA-seq鉴定MEF2c靶基因。
验证lncITPF过表达和敲低对MOBT功能的影响以及hnRNP L和MEF2c的介导作用
通过lncITPF过表达载体和siRNA转染,RTCA检测细胞增殖和迁移;Western blot检测MEF2c、TAGLN2、FMN1表达;si-hnRNP L转染验证。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 博来霉素 | -- | -- |
| Penn-Century微量喷雾器 | Penn-Century Inc. | -- | |
| 小动物MicroCT成像系统 | PerkinElmer | -- | |
| 细胞培养 | MRC-5细胞系 | ATCC | CCL-171™ |
| 改良型最低必需培养基 | Gibco | 11090081 | |
| 胎牛血清 | Gibco | 10270106 | |
| 转化生长因子-β1 | Gibco | PHG9202 | |
| 药物处理 | MOBT | -- | -- |
| Western blot | GAPDH抗体 | Affinity | AF7021 |
| α-SMA抗体 | Abcam | Ab7817 | |
| 波形蛋白抗体 | Affinity | AF7013 | |
| I型胶原抗体 | Affinity | AF7001 | |
| MEF2c抗体 | Abcam | Ab78888 | |
| hnRNP L抗体 | Abcam | Ab6106 | |
| Smad2/3抗体 | Cell Signaling Technology | 8685 | |
| p-Smad2/3抗体 | Cell Signaling Technology | 8828 | |
| ADAMTS8抗体 | Bioss | Bs-5859R | |
| TAGLN2抗体 | Proteintech | 15508-1-AP | |
| HSPA12A抗体 | Abcam | Ab200838 | |
| FMN1抗体 | Proteintech | 25982-1-AP | |
| 组织学染色 | H&E染色剂 | Novland | IH-017 |
| Masson三色染色试剂盒 | Solarbio | G1345 | |
| 免疫荧光 | TritonX-100 | Sinopharm | 30188928 |
| 山羊血清 | Solarbio | SL038 | |
| α-SMA抗体(1:200) | Abcam | Ab7817 | |
| 1×PBS溶液 | Sparkjade | CR0013 | |
| 抗IgG荧光二抗(1:200) | Affinity | S0006 | |
| DAPI(1:400) | Sigma | D9542 | |
| 自动活细胞荧光显微成像系统 | Invitrogen | EVOS | |
| ChIP-PCR | SimpleChIP®酶解染色质IP试剂盒 | Cell Signaling Technology | 9002 |
| 甲醛(1%) | Macklin | F809702 | |
| 甘氨酸(2.5 M) | Meilunbio | MB4166 | |
| IgG抗体 | Cell Signaling Technology | 2729 | |
| 蛋白G琼脂糖珠 | Cell Signaling Technology | 9007 | |
| RNA-FISH | Ribo lncRNA FISH探针混合液 | RiboBio | C10910 |
| SSC缓冲液 | Solarbio | S1030 | |
| RTCA | E-板 | Agilent | 5469830001 |
| CIM板 | Agilent | 05665817001 | |
| RIP | EZ-Magna RIP™ RNA结合蛋白免疫沉淀试剂盒 | Millipore | 17-701 |
| hnRNP-L抗体 | Abcam | ab264340 | |
| RNA-seq | Ribo-off rRNA去除试剂盒 | Nanjing (China) | -- |
| NEBNext Ultra方向性RNA文库制备试剂盒(Illumina) | NEB | -- | |
| Qubit RNA检测试剂盒 | -- | -- | |
| Agilent Bioanalyzer 2100系统 | Agilent Technologies | -- | |
| AB Step One Plus实时荧光定量PCR系统 | Thermo Fisher | -- | |
| Novaseq 6000 S4测序平台 | Illumina | -- | |
| NovaSeq 6000 S4试剂盒V1.5 | Illumina | -- | |
| ChIP-seq | 抗MEF2c抗体 | Santa Cruz | sc-518152 |
| 通用DNA纯化试剂盒 | TIANGEN | DP214 | |
| Ultra II DNA文库制备试剂盒 | NEB | E7645 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系:C57BL/6,雄性;BLM剂量:5 mg/kg;给药方式:气管内喷雾;MOBT剂量:30 mg/kg,口服,每日一次,第8天开始;检测时间:第28天;每组动物数:10只。 阅读提示:参见4.2节 Animal Model and Ethics Statement |
| 细胞模型 | 细胞系:MRC-5;培养基:advanced MEM + 10% FBS;TGF-β1浓度:5 ng/mL,处理24小时;MOBT浓度:10 μg/mL,共处理48小时。 阅读提示:参见4.3节 Cell Model and Treatment |
| lncITPF机制 | RNA-FISH探针:lncITPF、U6、18S;半衰期实验:放线菌素D浓度5 μg/mL;ChIP-PCR:抗Smad2/3抗体、抗IgG抗体。 阅读提示:参见4.7-4.9节及相关图注 |
| 下游靶基因验证 | RIP实验:抗hnRNP L抗体、抗IgG抗体;Western blot检测MEF2c、TAGLN2、FMN1;ChIP-seq和RNA-seq实验条件。 阅读提示:参见4.11-4.13节及相关图注 |